| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 第一章 文献综述:非编码RNA的研究概况 | 第12-30页 |
| 1. 非编码RNA的分类 | 第12-13页 |
| ·依据序列长度分类 | 第12页 |
| ·依据细胞定位分类 | 第12-13页 |
| 2. 小于50nt的ncRNA研究进展 | 第13-15页 |
| 3. 50-500nt的ncRNA研究进展 | 第15-23页 |
| ·snoRNA的种类和结构 | 第16-19页 |
| ·C/D box snoRNA | 第16-17页 |
| ·H/ACA box snoRNA | 第17-19页 |
| ·RNase MRP snoRNA | 第19页 |
| ·snoRNA的基因组织形式 | 第19-21页 |
| ·独立转录的snoRNA基因 | 第20页 |
| ·内含子编码的snoRNA基因 | 第20-21页 |
| ·snoRNA基因簇 | 第21页 |
| ·50-500 nt ncRNA的功能研究进展 | 第21-23页 |
| 4. 大于500nt的ncRNA研究进展 | 第23-25页 |
| 5. ncRNA研究技术进展 | 第25-27页 |
| ·生物信息学预测 | 第25-26页 |
| ·通过测序鉴定新的非编码RNA | 第26-27页 |
| ·ncRNA功能研究方法 | 第27页 |
| 6. 非编码RNA在昆虫中的研究进展 | 第27-30页 |
| 第二章 家蚕50-500nt ncRNA的cDNA文库构建 | 第30-50页 |
| 1. 材料与方法 | 第31-40页 |
| ·供试家蚕 | 第31页 |
| ·家蚕饲养 | 第31页 |
| ·家蚕样品收集 | 第31页 |
| ·实验方法 | 第31-40页 |
| ·总RNA的提取 | 第31-32页 |
| ·50-500nt RNA的分离 | 第32页 |
| ·mRNA的去除 | 第32页 |
| ·核糖体RNA的去除 | 第32-34页 |
| ·小片段RNA去磷酸化 | 第34-35页 |
| ·3'adaptor连接 | 第35页 |
| ·磷酸化和去帽修饰 | 第35-36页 |
| ·5'adaptor连接 | 第36页 |
| ·50-500nt ncRNA的cDNA文库克隆 | 第36-40页 |
| 2. 结果与分析 | 第40-46页 |
| ·RNA提取及50-500nt RNA的cDNA文库构建 | 第40-45页 |
| ·测序结果 | 第45-46页 |
| 3. 结论与讨论 | 第46-48页 |
| 本章小结 | 第48-50页 |
| 第三章 家蚕基因组中新的ncRNA的鉴定及转录本研究 | 第50-64页 |
| 1. 材料与方法 | 第51-52页 |
| ·家蚕基因组中新ncRNA的鉴定 | 第51页 |
| ·家蚕ncRNA的基因组定位 | 第51页 |
| ·ncRNA二级结构分析 | 第51页 |
| ·ncRNA的保守性分析 | 第51-52页 |
| ·ncRNA靶基因预测 | 第52页 |
| 2. 结果与分析 | 第52-57页 |
| ·家蚕新ncRNA的鉴定及归类 | 第52页 |
| ·家蚕特异性ncRNA | 第52-53页 |
| ·新ncRNA的基因组定位及基因组织形式 | 第53页 |
| ·内含子起源的ncRNA与宿主基因的相互关系 | 第53-54页 |
| ·新的ncRNA靶基因预测 | 第54-57页 |
| 3. 结论与讨论 | 第57-63页 |
| ·特殊种类的ncRNA的发现 | 第57-58页 |
| ·家蚕特异的ncRNA | 第58-59页 |
| ·家蚕中ncRNA的基因组织形式 | 第59-61页 |
| ·可能指导tRNA和mRNA修饰的ncRNA | 第61-63页 |
| 本章小结 | 第63-64页 |
| 第四章 家蚕新的ncRNA的表达谱研究 | 第64-86页 |
| 1. 材料与方法 | 第65-74页 |
| ·ncRNA表达谱芯片 | 第65-70页 |
| ·芯片探针设计与合成 | 第65-69页 |
| ·RNA样品准备 | 第69页 |
| ·芯片杂交 | 第69-70页 |
| ·Norhtern杂交 | 第70-71页 |
| ·探针准备 | 第70-71页 |
| ·Northern杂交 | 第71页 |
| ·ncRNA Real-time PCR | 第71-72页 |
| ·编码基因半定量RT-PCR | 第72-74页 |
| 2. 结果与分析 | 第74-81页 |
| ·ncRNA的在家蚕不同发育虫态的表达谱 | 第74-80页 |
| ·ncRNA在家蚕同一虫态不同时期的表达情况 | 第80-81页 |
| 3. 结论与讨论 | 第81-84页 |
| 本章小结 | 第84-86页 |
| 全文结论 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-102页 |
| 附录 | 第102-104页 |
| 攻读博士期间发表论文情况 | 第104-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
