| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 异源四倍体烟草基因组的稳定性研究 | 第14-53页 |
| 1.1 前言 | 第14-29页 |
| 1.1.1 植物对病原体的防御反应 | 第14-17页 |
| 1.1.2 烟草N基因介导的抗性反应 | 第17-20页 |
| 1.1.3 多倍体进化 | 第20-25页 |
| 1.1.4 DNA双链断裂的修复机制 | 第25-29页 |
| 1.1.5 研究目的和意义 | 第29页 |
| 1.2 材料和方法 | 第29-33页 |
| 1.2.1 实验材料 | 第29页 |
| 1.2.2 人工杂交和杂交种子数目统计 | 第29-30页 |
| 1.2.3 TMV侵染 | 第30-31页 |
| 1.2.4 EMS诱变 | 第31页 |
| 1.2.5 转P50基因所在基因组位置的遗传图谱和物理图谱的构建 | 第31-32页 |
| 1.2.6 RNAi载体的构建和植物转化 | 第32-33页 |
| 1.3 结果与分析 | 第33-47页 |
| 1.3.1 烟草基因组的高频率自发性突变 | 第33页 |
| 1.3.2 构建高通量突变体筛选体系 | 第33-35页 |
| 1.3.3 P50基因多拷贝串联插入T-基因组 | 第35-36页 |
| 1.3.4 P50基因功能缺失突变的机制 | 第36-38页 |
| 1.3.5 P50所在染色体的突变不是由同祖染色体重组导致 | 第38-40页 |
| 1.3.6 NHEJ修复P50所在染色体的缺失突变 | 第40-41页 |
| 1.3.7 P50基因突变体的生存能力降低 | 第41-42页 |
| 1.3.8 导致N基因功能缺失的点突变和小片段插入缺失突变 | 第42-45页 |
| 1.3.9 沉默基因组稳定性和DSB修复相关的基因对N基因突变率的影响 | 第45-47页 |
| 1.4 讨论 | 第47-53页 |
| 1.4.1 通过高通量突变体筛选体系鉴定基因组的稳定性是可行的 | 第47-48页 |
| 1.4.2 不同遗传事件对多倍体基因组的进化具有重要作用 | 第48页 |
| 1.4.3 多倍体基因组的染色体缺失和大片段缺失及其修复 | 第48-49页 |
| 1.4.4 由染色体缺失和大片段缺失引起的多倍体快速进化 | 第49-50页 |
| 1.4.5 N基因的抗性功能不能通过点突变的杂交实现 | 第50-51页 |
| 1.4.6 同源重组和DSB修复相关基因对基因组稳定性的影响 | 第51-53页 |
| 第二章 紫背天葵(Gynura bicolor)叶背面红色形成机理研究 | 第53-79页 |
| 2.1 前言 | 第53-61页 |
| 2.1.1 紫背天葵的研究现状 | 第53页 |
| 2.1.2 转录组学概述和应用 | 第53-57页 |
| 2.1.3 花青素的生物合成 | 第57-61页 |
| 2.1.4 研究目的和意义 | 第61页 |
| 2.2 材料和方法 | 第61-64页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第61-62页 |
| 2.2.2 花青素的收集和测定 | 第62页 |
| 2.2.3 植物组织RNA提取 | 第62页 |
| 2.2.4 转录组测序和组装 | 第62-63页 |
| 2.2.5 基因组denovo组装和基因注释 | 第63页 |
| 2.2.6 差异表达基因分析 | 第63页 |
| 2.2.7 荧光定量PCR分析 | 第63-64页 |
| 2.3 结果与分析 | 第64-76页 |
| 2.3.1 花青素含量测定 | 第64-65页 |
| 2.3.2 RNA提取及质量检测 | 第65页 |
| 2.3.3 转录组测序和组装 | 第65-66页 |
| 2.3.4 差异表达基因的鉴定和注释 | 第66-69页 |
| 2.3.5 差异表达基因的KEGG分类 | 第69-72页 |
| 2.3.6 花青素合成相关基因的差异表达分析 | 第72-75页 |
| 2.3.7 调控紫背天葵叶背面红色形成的重要基因 | 第75-76页 |
| 2.4 讨论 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-108页 |
| 附录 | 第108-120页 |
| 附录1 本研究中烟草所用引物 | 第108-119页 |
| 附录2 本研究中紫背天葵所用引物 | 第119-120页 |
| 作者简介 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
