| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第14-34页 |
| 第1节 肠道微生物概述 | 第14-25页 |
| 1.1.1 肠道微生物的组成 | 第16-17页 |
| 1.1.2 肠道微生物的功能 | 第17-21页 |
| 1.1.3 肠道微生物与疾病 | 第21-25页 |
| 第2节 影响肠道微生物的因素 | 第25-28页 |
| 1.2.1 人体肠道微生物的形成 | 第25-26页 |
| 1.2.2 饮食与肠道微生物 | 第26页 |
| 1.2.3 年龄与肠道微生物 | 第26-27页 |
| 1.2.4 地理与肠道微生物 | 第27页 |
| 1.2.5 遗传信息与肠道微生物 | 第27-28页 |
| 第3节 肠道微生物的研究方法 | 第28-31页 |
| 1.3.1 宏基因组测序 | 第28-29页 |
| 1.3.2 16 SrRNA测序技术 | 第29-31页 |
| 第4节 蝙蝠肠道微生物的研究背景 | 第31-34页 |
| 1.4.1 蝙蝠概述 | 第31-32页 |
| 1.4.2 蝙蝠肠道微生物的研究 | 第32-33页 |
| 1.4.3 本文的研究目的 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-48页 |
| 第1节 样品的收集与基因的测序 | 第34-39页 |
| 2.1.1 实验动物的采集 | 第34页 |
| 2.1.2 样品的收集 | 第34页 |
| 2.1.3 物种的分子生物学鉴定 | 第34-37页 |
| 2.1.4 样品微生物的全基因组提取 | 第37页 |
| 2.1.5 16 SrRNA目标片段的扩增及测序 | 第37-39页 |
| 第2节 16SRRNA测序数据的分析 | 第39-48页 |
| 2.2.1 原始测序数据的质量控制 | 第39-40页 |
| 2.2.2 质控后数据的拼接 | 第40页 |
| 2.2.3 拼接后序列的去杂 | 第40-41页 |
| 2.2.4 操作分类单元(OTU)聚类 | 第41-42页 |
| 2.2.5 微生物群落结构分析 | 第42-43页 |
| 2.2.6 Alpha多样性分析 | 第43-45页 |
| 2.2.7 Beta多样性分析 | 第45-47页 |
| 2.2.8 微生物多元变量统计分析 | 第47-48页 |
| 第三章 结果 | 第48-65页 |
| 3.1 物种鉴定 | 第48页 |
| 3.2 所有样品的拼接后序列数据结果 | 第48页 |
| 3.3 OTU聚类结果 | 第48-52页 |
| 3.4 三个不同取样部位分别在两种蝙蝠中的微生物多样性分析 | 第52-61页 |
| 3.5 两种蝙蝠肠道微生物的多样性比较 | 第61-65页 |
| 第四章 讨论 | 第65-70页 |
| 4.1 两种食虫蝙蝠的肠道微生物 | 第65-67页 |
| 4.2 取样部位对蝙蝠肠道微生物多样性的影响 | 第67-68页 |
| 4.3 两种蝙蝠微生物多样性比较 | 第68-70页 |
| 第五章 结论与展望 | 第70-72页 |
| 5.1 结论 | 第70页 |
| 5.2 不足与展望 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-86页 |
| 附录 | 第86-95页 |
| 作者在学期间科研成果 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |