摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
第一章 文献综述 | 第15-55页 |
1.1 小麦条锈病的研究概况 | 第15-21页 |
1.2 病原真菌吸器及与寄主互作的研究 | 第21-26页 |
1.2.1 吸器的发育及侵入寄主细胞的质膜界面的相关研究 | 第22-24页 |
1.2.2 吸器与寄主互作的生理生化研究 | 第24-25页 |
1.2.3 寄主与病原真菌不同互作反应对吸器发育的影响 | 第25-26页 |
1.3 植物的抗病性 | 第26-41页 |
1.3.1 植物的抗病性反应类型 | 第26-29页 |
1.3.2 植物抗病性反应的遗传模式 | 第29-30页 |
1.3.3 植物的抗病基因 | 第30-37页 |
1.3.4 植物抗病相关的信号分子 | 第37-41页 |
1.4 小麦成株抗条锈性研究 | 第41-43页 |
1.4.1 成株抗条锈性 | 第41-42页 |
1.4.2 小麦成株抗条锈性的相关研究 | 第42-43页 |
1.5 基因差异表达的研究技术 | 第43-51页 |
1.5.1 消减杂交技术(Subtractive hybridization) | 第43-44页 |
1.5.2 mRNA差异显示技术(mRNA differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR) | 第44页 |
1.5.3 cDNA代表性差异分析(cDNA representational difference analysis,cDNA-RDA) | 第44-45页 |
1.5.4 基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE) | 第45-46页 |
1.5.5 抑制消减杂交法(suppression subtractive hybridization,SSH) | 第46页 |
1.5.6 cDNA微阵列(cDNA microassay) | 第46-47页 |
1.5.7 cDNA扩增片段长度多态性(cDNA amplified fragment length polymorphism,cDNA-AFLP) | 第47-51页 |
1.6 生物信息学研究 | 第51-53页 |
1.6.1 生物信息学的研究领域 | 第51-52页 |
1.6.2 生物信息学数据库 | 第52页 |
1.6.3 生物信息学研究内容 | 第52-53页 |
1.6.4 生物信息学数据挖掘的领域 | 第53页 |
1.7 本研究的目的和意义 | 第53-55页 |
第二章 cDNA-AFLP分离小麦成株抗条锈病的差异表达基因及其生物信息学分析 | 第55-85页 |
2.1 引言 | 第55-56页 |
2.2 材料与方法 | 第56-58页 |
2.2.1 供试材料 | 第56-57页 |
2.2.2 接种培养与处理 | 第57页 |
2.2.3 样品采集 | 第57页 |
2.2.4 仪器及试剂 | 第57-58页 |
2.3 实验方法 | 第58-69页 |
2.3.1 小麦叶片总RNA的提取、纯化与质量检测 | 第58-59页 |
2.3.2 cDNA的合成、检测及纯化 | 第59-61页 |
2.3.3 cDNA-AFLP分析 | 第61-65页 |
2.3.4 差异表达片段的二次PCR扩增及琼脂糖凝胶回收 | 第65-66页 |
2.3.5 差异表达片段的克隆 | 第66-68页 |
2.3.6 差异表达片段的序列测定及生物信息学分析 | 第68-69页 |
2.4 结果与分析 | 第69-78页 |
2.4.1 材料的反应型鉴定及小麦叶片总RNA的检测 | 第69-70页 |
2.4.2 cDNA-AFLP分析 | 第70-78页 |
2.5 结论与讨论 | 第78-85页 |
2.5.1 cDNA-AFLP技术在基因差异表达研究中的应用 | 第78-79页 |
2.5.2 小麦成株抗条锈病差异表达基因的类型及表达特征 | 第79-81页 |
2.5.3 条锈菌作用下小麦成株抗病性差异表达基因的功能研究 | 第81-85页 |
第三章 小麦条锈菌中分泌蛋白基因的克隆及相关特征分析 | 第85-130页 |
3.1 引言 | 第85-87页 |
3.2 材料、试剂及仪器 | 第87页 |
3.2.1 材料 | 第87页 |
3.2.2 仪器及试剂 | 第87页 |
3.3 实验方法 | 第87-106页 |
3.3.1 接种、培养及取样 | 第87-88页 |
3.3.2 RNA的提取、纯化及检测 | 第88-90页 |
3.3.3 候选基因的筛选 | 第90页 |
3.3.4 5'-RACE反应 | 第90-96页 |
3.3.5 5'-RACE PCR扩增产物的凝胶回收 | 第96页 |
3.3.6 回收片段的克隆与转化 | 第96-99页 |
3.3.7 5'-RACE产物的测序、序列拼接及生物信息学分析 | 第99-102页 |
3.3.8 qRT-PCR进行基因的表达特征分析 | 第102-104页 |
3.3.9 候选基因来源的鉴定 | 第104-106页 |
3.4 结果与分析 | 第106-126页 |
3.4.1 候选基因的挑选 | 第106页 |
3.4.2 反应型鉴定 | 第106-107页 |
3.4.3 小麦叶片总RNA提取及其检测 | 第107-108页 |
3.4.4 5'-RACE扩增 | 第108-109页 |
3.4.5 基因的克隆及全长序列分析 | 第109-111页 |
3.4.6 相似性和同源性搜索 | 第111页 |
3.4.7 氨基酸一级结构的预测 | 第111-116页 |
3.4.8 蛋白质基序(protein motifs)和蛋白质功能域(protein-conserved domain)的预测 | 第116-117页 |
3.4.9 分泌蛋白质的预测 | 第117-123页 |
3.4.10 qRT-PCR结果 | 第123-126页 |
3.4.11 基因来源的检测 | 第126页 |
3.5 结论与讨论 | 第126-130页 |
第四章 小麦条锈菌诱导的载体蛋白基因(PstAAC9P1基因)的克隆及特征分析 | 第130-142页 |
4.1 引言 | 第130-131页 |
4.2 材料、仪器及试剂 | 第131页 |
4.3 实验方法 | 第131-133页 |
4.3.1 接种、培养 | 第131页 |
4.3.2 材料准备 | 第131页 |
4.3.3 RNA的提取、纯化及检测 | 第131页 |
4.3.4 5'-RACE反应 | 第131-132页 |
4.3.5 条锈菌诱导下的qRT-PCR分析 | 第132页 |
4.3.6 PstAAC9P1基因来源的鉴定 | 第132-133页 |
4.4 结果与分析 | 第133-140页 |
4.4.1 纯化后RNA的PCR检测 | 第133页 |
4.4.2 5'-RACE扩增及PstAAC9P1基因全长cDNA的克隆 | 第133-134页 |
4.4.3 PstAAC9P1基因序列分析 | 第134-137页 |
4.4.4 PstAAC9P1的表达模式分析 | 第137-139页 |
4.4.5 基因来源的鉴定 | 第139-140页 |
4.5 结论与讨论 | 第140-142页 |
第五章 全文总结 | 第142-144页 |
参考文献 | 第144-173页 |
附表1 成株期TDFS序列的BLASTX比对分析 | 第173-178页 |
附表2 苗期TDFS序列的BLASTX比对分析 | 第178-182页 |
附表3 未知功能的UNIGENES | 第182-185页 |
附表4 苗期文库中差异表达的UNIGENES与成株期文库数据库的BLASTX比对分析 | 第185-186页 |
致谢 | 第186-187页 |
作者简介 | 第187-188页 |