分枝杆菌蛋白质亚细胞定位的预测研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 生物信息学 | 第10-11页 |
| 1.2 分枝杆菌简介 | 第11页 |
| 1.3 分枝杆菌的研究现状 | 第11-13页 |
| 1.4 本论文的主要工作和结构安排 | 第13-15页 |
| 第二章 构建数据集和特征提取 | 第15-25页 |
| 2.1 构建数据集 | 第15-20页 |
| 2.1.1 PISCES在线软件 | 第17-19页 |
| 2.1.2 CD-HIT在线软件 | 第19-20页 |
| 2.2 提取特征 | 第20-25页 |
| 2.2.1 三肽特征 | 第21页 |
| 2.2.2 基于g-gap二肽的伪氨基酸特征 | 第21-25页 |
| 第三章 特征筛选算法 | 第25-28页 |
| 3.1 二项分布 | 第25-26页 |
| 3.2 方差分析 | 第26-28页 |
| 第四章 分类算法 | 第28-32页 |
| 4.1 支持向量机 | 第28-29页 |
| 4.2 LIBSVM软件包 | 第29-30页 |
| 4.3 性能评估 | 第30-32页 |
| 第五章 结果分析 | 第32-42页 |
| 5.1 亚细胞定位点蛋白质预测的结果分析 | 第32-39页 |
| 5.1.1 预测性能 | 第32-33页 |
| 5.1.2 其他参照数据集的比较 | 第33-36页 |
| 5.1.3 Mycosub在线服务平台 | 第36-39页 |
| 5.2 分泌蛋白质的预测结果分析 | 第39-42页 |
| 5.2.1 预测性能 | 第39-40页 |
| 5.2.2 与其他分类算法对比 | 第40-42页 |
| 第六章 总结与展望 | 第42-45页 |
| 6.1 本文工作总结 | 第42-43页 |
| 6.2 展望 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 附录 | 第53-55页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第55页 |
