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体外分子进化改善β-葡萄糖苷酶酶学特性

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 绪论第10-23页
    1.1 β-葡萄糖苷酶概论第10-15页
        1.1.1 β-葡萄糖苷酶简介第10页
        1.1.2 β-葡萄糖苷酶的克隆与表达现状第10-11页
        1.1.3 β-葡萄糖苷酶的结构与催化机制第11-14页
        1.1.4 β-葡萄糖苷酶的应用第14-15页
    1.2 β-葡萄糖苷酶分子改造研究进展第15-19页
        1.2.1 定点突变第15-16页
        1.2.2 定向进化第16-18页
        1.2.3 半理性设计第18-19页
        1.2.4 小结第19页
    1.3 多粘类芽孢杆菌β-葡萄糖苷酶的研究现状第19-20页
    1.4 本文的研究内容与方法第20-22页
        1.4.1 研究内容第20-21页
        1.4.2 技术路线第21-22页
    1.5 本文的创新之处第22-23页
第二章 PpBBglA在E.coliBL21 (DE3)中的表达及酶学性质研究第23-37页
    2.1 实验材料第23-25页
        2.1.1 菌株与质粒第23-24页
        2.1.2 培养基第24页
        2.1.3 生物化学与分子生物学试剂(盒)第24页
        2.1.4 主要实验仪器第24-25页
    2.2 实验方法第25-27页
        2.2.1 主要溶液的配制第25-26页
        2.2.2 PpBBglA基因的克隆及序列测定第26页
        2.2.3 IPTG诱导表达的最佳浓度第26页
        2.2.4 PpBBglA的分离纯化及SDS-PAGE分析第26-27页
        2.2.5 β-葡萄糖苷酶酶活力的测定第27页
        2.2.6 PpBBglA的动力学特征第27页
        2.2.7 底物间抑制动力学第27页
    2.3 结果与讨论第27-36页
        2.3.1 重组β-葡萄糖苷酶的基因和氨基酸序列特征第27-29页
        2.3.2 pNP标准曲线第29页
        2.3.3 IPTG浓度对重组β-葡萄糖苷酶可溶性表达水平的影响第29-30页
        2.3.4 重组β-葡萄糖苷酶的纯化及SDS-PAGE分析第30-31页
        2.3.5 PpBBglA的基本性质第31-33页
        2.3.6 底物结构与PpBBglA催化动力学的关系第33页
        2.3.7 底物间抑制动力学第33-36页
    2.4 本章小结第36-37页
第三章 密码子优化提高PpBBglA异源表达量第37-53页
    3.1 实验材料第37-38页
        3.1.1 菌种与质粒第37-38页
        3.1.2 培养基及主要实验仪器第38页
        3.1.3 药品与溶液第38页
    3.2 实验方法第38-40页
        3.2.1 PpBBglA基因的定点突变第38-39页
        3.2.2 密码子优化型PpBBglA的表达量分析第39-40页
        3.2.3 表达载体对表达量的影响第40页
        3.2.4 表达宿主对表达量的影响第40页
    3.3 结果与讨论第40-51页
        3.3.1 PpBBglA的密码子偏性第40-42页
        3.3.2 内参蛋白质β-半乳糖苷酶的表达量稳定性第42-43页
        3.3.3 同义密码子替换对重组酶表达量的影响第43-46页
        3.3.4 表达载体对表达量的影响第46-47页
        3.3.5 表达宿主对表达量的影响第47-48页
        3.3.6 各类重组基因在不同IPTG浓度下的表达量比较第48-49页
        3.3.7 常用密码子偏性衡量指数与实际表达量的关系第49-50页
        3.3.8 ppbbglA基因密码子偏性对表达量影响方式的讨论第50-51页
        3.3.9 怎样选择最值得优化的密码子第51页
        3.3.10 密码子基因型优化方法和宿主修饰方法的比较第51页
    3.4 本章小结第51-53页
第四章 定向进化提高PpBBglA催化效率第53-62页
    4.1 实验材料第53-54页
        4.1.1 培养基第53页
        4.1.2 药品与溶液第53页
        4.1.3 主要实验仪器第53-54页
    4.2 实验方法第54-55页
        4.2.1 变体库的构建第54页
        4.2.2 平板-微孔板法筛选高水解活性突变体第54-55页
        4.2.3 突变酶的动力学参数测定第55页
        4.2.4 突变体的结构分析第55页
    4.3 结果与讨论第55-60页
        4.3.1 高催化效率突变体的筛选第55-56页
        4.3.2 高催化效率突变体的序列分析第56页
        4.3.3 突变酶的动力学及耐热性变化第56-57页
        4.3.4 高催化效率突变体的结构分析第57-60页
    4.4 本章小结第60-62页
第五章 定点突变提高PpBBglA热稳定性第62-71页
    5.1 实验材料第62页
    5.2 实验方法第62-63页
        5.2.1 引物设计第62-63页
        5.2.2 定点突变构建热稳定型突变体第63页
        5.2.3 突变酶的分离纯化及酶学性质研究第63页
        5.2.4 CD光谱第63页
        5.2.5 热稳型PpBBglA的结构分析第63页
    5.3 结果与讨论第63-70页
        5.3.1 热稳定型突变体的筛选第63-64页
        5.3.2 单突变体的热稳定性分析第64-65页
        5.3.3 组合突变体的动力学参数变化与相对表达量第65-66页
        5.3.4 突变体酶的耐热性比较第66页
        5.3.5 野生酶突变体的CD光谱第66-68页
        5.3.6 突变体的热稳定性与分子间弱相互作用第68-70页
    5.4 本章小结第70-71页
第六章 PpBBglA的寡聚体分析及活性-寡聚态-温度之间关系的猜想第71-83页
    6.1 实验材料第71-72页
        6.1.1 实验药品第71页
        6.1.2 溶液配制第71-72页
    6.2 方法第72-73页
        6.2.1 PpBBglA的非变性凝胶电泳第72页
        6.2.2 Sephadex G-200凝胶过滤柱分离PpBBglA多聚体第72页
        6.2.3 PpBBglA的还原与非还原SDS-PAGE分析第72页
        6.2.4 温度对PpBBglA多聚体解离的影响第72-73页
        6.2.5 PpBBglA的紫外扫描光谱第73页
        6.2.6 PpBBglA多聚体亚基间相互作用的信息学分析第73页
    6.3 结果与讨论第73-82页
        6.3.1 PpBBglA的 Native-PAGE第73-74页
        6.3.2 葡聚糖凝胶过滤柱分离PpBBglA多聚体第74-76页
        6.3.3 PpBBglA的还原与非还原SDS-PAGE分析第76-77页
        6.3.4 温度对PpBBglA多聚体形式的影响第77-78页
        6.3.5 温度对PpBBglA立体构象的影响第78-79页
        6.3.6 PpBBglA功能二聚体的亚基空间位置推断第79-82页
    6.4 本章小结第82-83页
主要结论与建议第83-85页
    结论第83-84页
    建议第84-85页
参考文献第85-94页
致谢第94-95页
个人简历第95页
在读期间已发表和录用的论文第95页

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