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铁结合蛋白进化分析,乳酸菌表面展示系统构建和产乙醇耐受性研究

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
缩略词表第14-16页
第一章 文献综述第16-30页
    1 研究课题的由来第16页
    2 铁蛋白家族的研究进展第16-19页
        2.1 铁蛋白家族及其分布第16-17页
        2.2 铁蛋白家族的结构和生物学功能第17页
        2.3 铁蛋白家族的进化第17-19页
    3 转铁蛋白家族的研究进展第19-21页
        3.1 转铁蛋白家族及其分布第19页
        3.2 转铁蛋白家族的结构和生物学功能第19-20页
        3.3 转铁蛋白家族的进化第20-21页
    4 生物信息学分析蛋白家族的系统进化第21-22页
        4.1 基因家族与蛋白家族第21页
        4.2 多序列比对和系统发育树的构建第21-22页
        4.3 蛋白家族可能进化模型的研究第22页
    5 乳酸菌表面表达乳铁蛋白的研究第22-25页
        5.1 乳酸菌作为表达载体的开发和应用第22-23页
        5.2 乳铁蛋白多肽的研究进展第23-24页
        5.3 细菌表面展示技术研究进展第24-25页
        5.4 重叠延伸PCR技术第25页
    6 乳酸菌作为产乙醇的微生物载体研究第25-28页
        6.1 燃料乙醇基因工程研究进展第25-26页
        6.2 乳酸菌利用木质纤维素水解液发酵产乙醇的应用前景第26-27页
        6.3 畜禽粪便作为纤维素原料产燃料乙醇的应用前景第27页
        6.4 木质纤维素水解液中抑制物的研究第27-28页
    7 本研究目的与意义第28-30页
第二章 铁蛋白家族的进化分析研究第30-51页
    1 研究背景第30页
    2 材料方法第30-31页
        2.1 序列数据第30页
        2.2 铁蛋白的注释第30-31页
        2.3 铁蛋白进化树的构建第31页
        2.4 铁蛋白的结构分析第31页
    3 结果分析第31-48页
        3.1 铁蛋白在所选物种基因组中的分布第31-39页
        3.2 铁蛋白家族成员的聚类第39-43页
        3.3 铁蛋白家族保守基序的分析第43-46页
        3.4 铁蛋白家族的系统发育分析第46-48页
    4 讨论第48-49页
    5 小结第49-51页
第三章 转铁蛋白家族系统进化分析研究第51-66页
    1 研究背景第51页
    2 材料方法第51-53页
        2.1 数据来源第51页
        2.2 转铁蛋白的预测和注释第51-52页
        2.3 转铁蛋白进化树的构建第52页
        2.4 转铁蛋白的一级结构保守序列分析第52-53页
    3 结果分析第53-64页
        3.1 转铁蛋白在所选真核生物基因组中的分布第53-56页
        3.2 转铁蛋白家族进化树的构建第56-59页
        3.3 转铁蛋白家族主要成员的一级结构保守序列及活性位点氨基酸残基分析第59-62页
        3.4 转铁蛋白家族的进化关系构建第62-64页
    4 讨论第64-65页
    5 小结第65-66页
第四章 表面展示乳铁蛋白的食品级基因工程乳酸菌的构建第66-80页
    1 研究背景第66页
    2 材料方法第66-75页
        2.1 实验材料第66-68页
        2.2 主要实验仪器第68页
        2.3 实验方法第68-75页
    3 结果与分析第75-79页
        3.1 乳酸菌总DNA的提取第75页
        3.2 目的基因nisI、acm A和bLfcin的PCR扩增结果第75-76页
        3.3 重叠延伸PCR的扩增结果第76-77页
        3.4 重组质粒的提取以及其序列测定结果第77-78页
        3.5 电转化乳酸乳球菌后目的片段扩增结果第78-79页
    4 小结第79-80页
第五章 产燃料乙醇基因工程乳酸菌微型发酵研究第80-102页
    1 研究背景第80页
    2 材料方法第80-84页
        2.1 实验材料第80-82页
        2.2 实验方法第82-84页
    3 结果与分析第84-99页
        3.1 菌体浓度与OD_(600)的换算与校正第84-85页
        3.2 纤维素水解液中抑制物对产乙醇细菌生长的影响第85-88页
        3.3 抑制物相互作用对三株产燃料乙醇菌株生长比率的影响第88-91页
        3.4 木质纤维水解液中抑制物对乙醇发酵的影响第91-92页
        3.5 木质纤维素水解液中添加保护剂后对 L.casei 12AE1 生长的影响第92-94页
        3.6 L.casei 12AE1 在抑制因子中发酵参数,底物利用率及代谢终产物的研究第94-97页
        3.7 发酵过程中 L.casei 12AE1 在不同培养基中葡萄糖利用和酒精得率的研究第97-99页
    4 讨论第99-101页
    5 小结第101-102页
参考文献第102-115页
附录 1:bLfcin合成片段碱基序列第115页
附录 2:bLfcin-nisI测序结果第115页
附录 3:acmA-b Lfcin-nisI测序结果第115-117页
附录 4:合成水解液培养基配方第117-118页
致谢第118-121页
博士在读期间发表的论文第121-122页

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