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百合体胚发生过程中miR171及其靶基因SCL6的鉴定与表达分析

中文摘要第12-13页
英文摘要第13-14页
1. 前言第15-22页
    1.1 百合体细胞胚发生的研究进展第15-18页
        1.1.1 基因型、外植体对百合体细胞胚发生的影响第15页
        1.1.2 常用激素对百合体细胞胚发生的影响第15-17页
        1.1.3 光照条件对百合体细胞胚发生的影响第17页
        1.1.4 基于体细胞胚的遗传转化受体系统的建立第17-18页
    1.2 miRNA对植物体细胞胚发生的调控作用第18-19页
    1.3 miR171及其靶基因研究进展第19-21页
        1.3.1 miR171及其靶基因对植物生长发育的调控第19-20页
        1.3.2 miR171及其靶基因对植物体细胞胚发生的调控第20-21页
    1.4 植物内源诱捕靶标(eTM)的研究进展第21页
    1.5 本文研究的目的与意义第21-22页
2. lpu-miR171a/b和lda-miR171a/c的克隆第22-29页
    2.1 材料与方法第22-27页
        2.1.1 试验材料第22页
        2.1.2 试验试剂及仪器第22页
        2.1.3 培养基和溶液的配制第22-23页
        2.1.4 RNA的提取第23-24页
        2.1.5 miR171的特异茎环反转录第24-25页
        2.1.6 lpu-miR171a/b和lda-miR171a/c的PCR扩增反应第25-26页
        2.1.7 PCR扩增产物的纯化第26页
        2.1.8 目的片段的连接、转化及测序第26-27页
    2.2 结果与分析第27-28页
        2.2.1 细叶百合及兰州百合总RNA提取结果第27-28页
        2.2.2 lpu-miR171a/b和lda-miR171a/c的克隆第28页
    2.3 讨论第28-29页
3. 靶基因LpSCL6-Ⅰ/Ⅱ和LdSCL6-Ⅲ的克隆及序列分析第29-36页
    3.1 材料与方法第29-31页
        3.1.1 试验材料第29页
        3.1.2 试验试剂及仪器第29页
        3.1.3 LpSCL6-Ⅰ、LpSCL6-Ⅱ和LdSCL6-Ⅲ的反转录第29-30页
        3.1.4 靶基因的PCR扩增反应第30页
        3.1.5 PCR产物测序及生物信息学分析第30-31页
    3.2 结果与分析第31-34页
        3.2.1 靶基因SCL6的PCR扩增第31页
        3.2.2 靶基因SCL6蛋白保守结构域分析第31页
        3.2.3 靶基因SCL6氨基酸序列比对分析第31-33页
        3.2.4 靶基因SCL6进化树构建第33页
        3.2.5 蛋白基本理化性质的预测第33-34页
        3.2.6 SCL6蛋白的二级结构预测及分析第34页
    3.3 讨论第34-36页
4. miR171靶基因作用位点的鉴定第36-43页
    4.1 材料方法第36-41页
        4.1.1 试验材料第36页
        4.1.2 试验试剂及仪器第36页
        4.1.3 总RNA提取及mRNA纯化第36-38页
        4.1.4 cDNA第一链的合成第38-39页
        4.1.5 RLM-5'RACE扩增第39-40页
        4.1.6 目的片段的回收、连接及转化第40-41页
        4.1.7 测序结果的比对分析第41页
    4.2 结果与分析第41-42页
        4.2.1 RLM-5'RACE扩增5'末端产物分析第41页
        4.2.2 miR171切割位点序列分析第41-42页
    4.3 讨论第42-43页
        4.3.1 miR171靶基因作用位点鉴定的必要性第42页
        4.3.2 百合体胚发育过程中miR171切割靶位点的特异性第42-43页
5. 百合体胚发生过程中miR171及靶基因SCL6表达谱构建第43-53页
    5.1 材料与方法第43-45页
        5.1.1 试验材料第43页
        5.1.2 试验试剂及仪器第43页
        5.1.3 RNA提取及cDNA合成第43页
        5.1.4 miR171及其靶基因SCL6的qRT-PCR引物设计第43-44页
        5.1.5 miR171及其靶基因SCL6的qRT-PCR分析第44-45页
        5.1.6 数据分析第45页
    5.2 结果分析第45-51页
        5.2.1 引物特异性分析第45-46页
        5.2.2 引物的扩增效率分析第46-50页
        5.2.3 百合体胚发育不同时期miR171及SCL6的表达关联性分析第50-51页
    5.3 讨论第51-53页
        5.3.1 miR171及其靶基因SCL6在百合体胚发育不同时期qRT-PCR分析第51-52页
        5.3.2 miR171及其靶基因SCL6在百合体胚发育不同时期的表达相关性分析第52-53页
6. miR171内源诱捕靶标的预测第53-57页
    6.1 材料与方法第53-55页
        6.1.1 转录组范围内内源诱捕靶标的预测第53页
        6.1.2 Python脚本的编写第53-55页
    6.2 结果分析第55-56页
        6.2.1 lpu-miR171a的内源诱捕靶标第55页
        6.2.2 lpu-miR171b的内源诱捕靶标第55-56页
        6.2.3 lda-miR171a的内源诱捕靶标第56页
        6.2.4 lda-miR171c的内源诱捕靶标第56页
    6.3 讨论第56-57页
总结第57-58页
主要创新点第58-59页
参考文献第59-66页
附录第66-67页
致谢第67-68页
攻读硕士学位期间发表文章第68页

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