| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第13-23页 |
| 1.1 高等植物中的钾 | 第13-15页 |
| 1.1.1 低钾处理对番茄生理生化代谢的影响 | 第13-14页 |
| 1.1.2 钾在植物体内的吸收与转运 | 第14-15页 |
| 1.2 miRNA的作用机制与特点 | 第15页 |
| 1.3 miRNA的研究方法 | 第15-17页 |
| 1.3.1 遗传学筛选法 | 第15页 |
| 1.3.2 直接克隆法 | 第15-16页 |
| 1.3.3 生物信息学分析法 | 第16页 |
| 1.3.4 高通量深度测序 | 第16-17页 |
| 1.4 植物中miRNA的靶基因研究 | 第17-18页 |
| 1.4.1 miRNA靶基因的预测 | 第17-18页 |
| 1.4.2 miRNA靶基因的验证 | 第18页 |
| 1.5 植物中已知miRNA的生物信息学功能 | 第18-21页 |
| 1.5.1 miRNA与生长发育 | 第18-19页 |
| 1.5.2 miRNA与胁迫响应 | 第19-21页 |
| 1.6 研究的目的与意义 | 第21-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1 实验材料与处理 | 第23-26页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.2 材料培养与处理 | 第23-26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-31页 |
| 2.2.1 Trizol法提取番茄总RNA | 第26页 |
| 2.2.2 RNA的纯度检验 | 第26页 |
| 2.2.3 RNA文库的建立 | 第26-27页 |
| 2.2.4 测序结果分析方法 | 第27页 |
| 2.2.5 对低钾胁迫响应的相关差异表达miRNA分析 | 第27-28页 |
| 2.2.6 靶基因的预测 | 第28页 |
| 2.2.7 实时荧光定量分析 | 第28-30页 |
| 2.2.8 实验数据分析 | 第30-31页 |
| 3 结果分析 | 第31-52页 |
| 3.1 样品中总RNA的提取与鉴定 | 第31-32页 |
| 3.1.1 琼脂糖凝胶电泳法鉴定样品中总RNA | 第31-32页 |
| 3.1.2 分光光度计法鉴定样品中总RNA | 第32页 |
| 3.2 测序结果分析 | 第32-38页 |
| 3.2.1 序列分析 | 第32-34页 |
| 3.2.2 sRNA长度分布 | 第34-35页 |
| 3.2.3 miRNA的家族分布 | 第35-37页 |
| 3.2.4 差异表达基因的筛选 | 第37-38页 |
| 3.3 差异表达miRNA的鉴定 | 第38-47页 |
| 3.3.1 qRT-PCR验证地下部差异基因 | 第38-43页 |
| 3.3.2 qRT-PCR验证地上部差异基因 | 第43-47页 |
| 3.4 miRNA差异表达靶基因的分析 | 第47-50页 |
| 3.4.1 mi167b靶基因的表达分析 | 第48页 |
| 3.4.2 mi168a靶基因的表达分析 | 第48-49页 |
| 3.4.3 mi171b靶基因的表达分析 | 第49-50页 |
| 3.5 miRNA和其相对应的靶基因之间相关性的分析 | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-56页 |
| 4.1 低钾胁迫下番茄miRNA基因家族表达分析 | 第52-53页 |
| 4.2 低钾处理下已知miRNA鉴定分析 | 第53-55页 |
| 4.3 低钾胁迫下miRNA与靶基因之间关系的分析 | 第55-56页 |
| 5 结论与展望 | 第56-57页 |
| 5.1 结论 | 第56页 |
| 5.2 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 攻读学位论文期间发表文章 | 第65页 |
