| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第13-24页 |
| 1.1 研究的目的与意义 | 第13-14页 |
| 1.2 国内外研究现状及发展趋势 | 第14-22页 |
| 1.2.1 植物的光合代谢途径 | 第14页 |
| 1.2.2 CAM代谢途径的不同阶段 | 第14-15页 |
| 1.2.3 CAM代谢途径环境适应性特点 | 第15-16页 |
| 1.2.4 CAM代谢途径的不同表现形式 | 第16-17页 |
| 1.2.5 兰科植物CAM代谢途径研究 | 第17-20页 |
| 1.2.6 CAM代谢途径分子机制研究 | 第20-22页 |
| 1.3 研究目标和主要内容 | 第22-23页 |
| 1.3.1 关键的科学问题与研究目标 | 第22页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第22-23页 |
| 1.4 研究技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 兰科植物CAM代谢途径分布研究 | 第24-58页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-26页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第26页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第26-56页 |
| 2.2.1 结果 | 第26-54页 |
| 2.2.2 讨论 | 第54-56页 |
| 2.3 小结 | 第56-58页 |
| 第三章 PEPC基因家族分析 | 第58-79页 |
| 3.1 材料与方法 | 第59-62页 |
| 3.1.1 数据来源 | 第59页 |
| 3.1.2 同源基因鉴定和多序列比对 | 第59-60页 |
| 3.1.3 系统进化关系重建和共线性分析 | 第60页 |
| 3.1.4 总RNA提取和转录组测序 | 第60-61页 |
| 3.1.5 从头组装和单基因簇拼接 | 第61-62页 |
| 3.1.6 RNA-Seq表达量分析 | 第62页 |
| 3.2 结果与分析 | 第62-78页 |
| 3.2.1 绿色植物PEPC基因的进化历史 | 第62-64页 |
| 3.2.2 双子叶植物PPC-1 系统进化分析 | 第64-65页 |
| 3.2.3 单子叶植物PPC-1 系统进化分析 | 第65-66页 |
| 3.2.4 PPC-1M1中CAM和C4功能相关PEPC分析 | 第66-67页 |
| 3.2.5 单子叶植物PEPC基因的古老重复事件和CAM功能PEPC基因起源 | 第67-78页 |
| 3.3 小结 | 第78-79页 |
| 第四章 铁皮石斛干旱胁迫转录组分析 | 第79-92页 |
| 4.1 材料与方法 | 第80-83页 |
| 4.1.1 植物材料及干旱处理 | 第80-81页 |
| 4.1.2 RNA提取及转录组测序 | 第81页 |
| 4.1.3 转录组数据分析 | 第81-83页 |
| 4.2 结果与分析 | 第83-90页 |
| 4.2.1 测序结果评估和组装 | 第83-85页 |
| 4.2.2 基因注释 | 第85-88页 |
| 4.2.3 编码蛋白框（CDS）预测 | 第88-89页 |
| 4.2.4 干旱胁迫差异基因表达 | 第89-90页 |
| 4.3 小结 | 第90-92页 |
| 第五章 结论 | 第92-94页 |
| 5.1 结论 | 第92-93页 |
| 5.2 展望 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-105页 |
| 附录 | 第105-112页 |
| 在读期间的学术研究 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113页 |