木通红碦木虱线粒体基因组测定与分析
| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 综述 | 第9-17页 |
| 1.1 木虱科概况 | 第9-10页 |
| 1.1.1 木通红喀木虱 | 第9页 |
| 1.1.2 寄主植物木通 | 第9-10页 |
| 1.2 线粒体基因组 | 第10-15页 |
| 1.2.1 昆虫线粒体特征 | 第10-12页 |
| 1.2.2 线粒体基因的应用 | 第12-13页 |
| 1.2.3 同翅目线粒体基因的研究现状 | 第13-15页 |
| 1.3 研究的目的与意义 | 第15-16页 |
| 1.4 主要研究内容 | 第16-17页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第17-25页 |
| 2.1 材料与方法 | 第17-23页 |
| 2.1.1 供试虫源 | 第17页 |
| 2.1.2 实验仪器和试剂 | 第17-19页 |
| 2.1.3 DNA提取 | 第19-20页 |
| 2.1.4 PCR扩增和测序 | 第20-23页 |
| 2.2 数据处理和分析 | 第23-25页 |
| 2.2.1 测序结果的拼接 | 第23页 |
| 2.2.2 线粒体基因组基因注释 | 第23页 |
| 2.2.3 线粒体基因组基因组成情况的分析 | 第23-24页 |
| 2.2.4 tRNA的二级结构的预测 | 第24页 |
| 2.2.5 半翅目昆虫的线粒体谱系基因组学分析 | 第24-25页 |
| 第3章 木通红喀木虱线粒体基因组分析 | 第25-36页 |
| 3.1. 木通红喀木虱线粒体基因组结构及组成分析 | 第25-28页 |
| 3.1.1 基因组的结构分析 | 第25-27页 |
| 3.1.2 碱基组成特点 | 第27-28页 |
| 3.2 蛋白质编码基因及密码子使用情况 | 第28-31页 |
| 3.3 核糖体RNA(rRNA)基因 | 第31-32页 |
| 3.4 转运RNA(tRNA)基因 | 第32-36页 |
| 第4章 木虱科线粒体基因组特征分析 | 第36-43页 |
| 4.1 线粒体全基因组的大小和基因排序 | 第36-38页 |
| 4.2 基因重叠和间隔序列 | 第38页 |
| 4.3 线粒体基因组的碱基组成 | 第38-39页 |
| 4.4 非编码区 | 第39页 |
| 4.5 蛋白编码基因 | 第39-43页 |
| 4.5.1 蛋白编码基因的碱基组成 | 第39-40页 |
| 4.5.2 蛋白质编码基因推导的氨基酸组成分析 | 第40-41页 |
| 4.5.3 蛋白质编码基因置换 | 第41-43页 |
| 第5章 同翅目系统发育分析 | 第43-49页 |
| 5.1 物种选取 | 第43-44页 |
| 5.2 最大似然法建树 | 第44-46页 |
| 5.3 贝叶斯推断法建树 | 第46-48页 |
| 小结 | 第48-49页 |
| 第6章 结论与展望 | 第49-51页 |
| 6.1 结论 | 第49-50页 |
| 6.2 本研究不足之处 | 第50页 |
| 6.3 展望 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
