中文摘要 | 第16-19页 |
Abstract | 第19-23页 |
符号说明 | 第24-25页 |
第一章 文献综述 | 第25-31页 |
1.1 鲍氏不动杆菌简介 | 第25-26页 |
1.2 鲍氏不动杆菌导致的医院内感染 | 第26-28页 |
1.2.1 感染性肺炎 | 第26-27页 |
1.2.2 伤口感染 | 第27页 |
1.2.3 血流感染 | 第27页 |
1.2.4 皮肤和软组织感染 | 第27-28页 |
1.3 鲍氏不动杆菌的生物膜形成能力及机制 | 第28-29页 |
1.4 鲍氏不动杆菌的多重耐药性 | 第29-31页 |
第二章 鲍氏不动杆菌在不同培养表面形成生物膜的能力分析 | 第31-45页 |
引言 | 第31页 |
2.1 实验材料 | 第31-34页 |
2.1.1 菌株与培养介质 | 第31-32页 |
2.1.2 培养基 | 第32页 |
2.1.3 实验试剂 | 第32-33页 |
2.1.4 仪器耗材 | 第33-34页 |
2.2 实验方法 | 第34-38页 |
2.2.1 鲍氏不动杆菌耐多粘菌素E突变菌株的筛选 | 第34页 |
2.2.2 接触角实验 | 第34页 |
2.2.3 Zeta电位实验 | 第34-35页 |
2.2.4 生物膜形成实验 | 第35-36页 |
2.2.5 生物膜定量实验 | 第36页 |
2.2.6 激光共聚焦实验 | 第36-37页 |
2.2.7 相对疏水性分析 | 第37-38页 |
2.2.8 生物膜去除实验 | 第38页 |
2.3 结果与分析 | 第38-44页 |
2.3.1 不同培养表面的亲疏水性 | 第38-39页 |
2.3.2 不同细胞表面的Zeta电位 | 第39-40页 |
2.3.3 相对疏水性实验 | 第40页 |
2.3.4 不同培养表面形成生物膜的能力 | 第40-42页 |
2.3.5 激光共聚焦实验 | 第42-43页 |
2.3.6 生物膜去除实验 | 第43-44页 |
2.4 本章小结 | 第44-45页 |
第三章 抗生素TA的发酵、纯化及活性检测 | 第45-59页 |
引言 | 第45页 |
3.1 实验材料 | 第45-48页 |
3.1.1 菌株 | 第45-46页 |
3.1.2 培养基 | 第46页 |
3.1.3 实验试剂 | 第46-47页 |
3.1.4 仪器耗材 | 第47-48页 |
3.2 实验方法 | 第48-51页 |
3.2.1 抗生素TA发酵培养基的筛选 | 第48-49页 |
3.2.2 发酵液中抗生素TA含量的检测 | 第49页 |
3.2.3 抗生素TA的发酵 | 第49-50页 |
3.2.4 抗生素TA的分离纯化 | 第50-51页 |
3.2.5 抗生素TA的抑菌活性检测 | 第51页 |
3.3 结果与分析 | 第51-57页 |
3.3.1 抗生素TA检测参数的确定 | 第52页 |
3.3.2 抗生素TA发酵培养基的筛选 | 第52-54页 |
3.3.3 抗生素TA的检测 | 第54-57页 |
3.4 本章小结 | 第57-59页 |
第四章 鲍氏不动杆菌胞外LPS阻碍抗生素TA的入侵 | 第59-87页 |
引言 | 第59页 |
4.1 实验材料 | 第59-63页 |
4.1.1 菌株 | 第59页 |
4.1.2 培养基 | 第59-60页 |
4.1.3 实验试剂 | 第60-62页 |
4.1.4 仪器耗材 | 第62-63页 |
4.2 实验方法 | 第63-77页 |
4.2.1 黄色粘球菌DK1622捕食实验 | 第63-64页 |
4.2.2 黄色粘球菌DK1622抑菌实验 | 第64-65页 |
4.2.3 抗生素TA抑菌活性实验 | 第65-66页 |
4.2.4 抗生素TA最小抑菌浓度实验 | 第66-67页 |
4.2.5 抗生素TA靶点蛋白LspA的序列分析 | 第67-68页 |
4.2.6 总RNA的提取 | 第68-70页 |
4.2.7 反转录PCR | 第70-71页 |
4.2.8 荧光定量PCR | 第71-73页 |
4.2.9 基因lpxA、lpxC、lpxD序列分析 | 第73页 |
4.2.10 胞外LPS的提取 | 第73-74页 |
4.2.11 SDS-PAGE电泳检测LPS | 第74-75页 |
4.2.12 银染 | 第75-76页 |
4.2.13 等温滴定量热实验 | 第76-77页 |
4.2.14 细胞外膜通透性实验 | 第77页 |
4.3 结果与分析 | 第77-86页 |
4.3.1 黄色粘球菌DK1622的捕食实验 | 第77-79页 |
4.3.2 黄色粘球菌DK1622的抑菌实验 | 第79页 |
4.3.3 抗生素TA的抑菌活性 | 第79-80页 |
4.3.4 抗生素TA靶点蛋白LspA的序列分析 | 第80-83页 |
4.3.5 胞外LPS分析 | 第83-84页 |
4.3.6 抗生素TA与LPS的ITC实验 | 第84-85页 |
4.3.7 外膜通透性实验 | 第85-86页 |
4.4 本章小结 | 第86-87页 |
附录 第一章 文献综述 | 第87-93页 |
1.1 浓香型白酒简介 | 第87-88页 |
1.2 窖泥池微生物的研究概况 | 第88-90页 |
1.2.1 窖泥微生物的来源与分类 | 第88页 |
1.2.2 窖泥微生物的群落研究 | 第88-89页 |
1.2.3 窖泥微生物多样性研究策略 | 第89-90页 |
1.3 高通量测序技术简介 | 第90-92页 |
1.3.1 测序技术的历史变革 | 第90-91页 |
1.3.2 Roche 454测序技术 | 第91-92页 |
1.4 窖泥池微生物研究展望 | 第92-93页 |
附录 第二章 窖泥中细菌种群结构分析 | 第93-127页 |
引言 | 第93页 |
2.1 实验材料 | 第93-95页 |
2.1.1 窖泥样品 | 第93页 |
2.1.2 实验试剂 | 第93-94页 |
2.1.3 仪器耗材 | 第94-95页 |
2.1.4 数据分析网站及软件 | 第95页 |
2.2 实验方法 | 第95-109页 |
2.2.1 样品采集 | 第95页 |
2.2.2 总基因组DNA的提取 | 第95-96页 |
2.2.3 引物设计及评估 | 第96-100页 |
2.2.4 PCR反应体系及条件优化 | 第100-101页 |
2.2.5 PCR产物检测及纯化 | 第101-102页 |
2.2.6 454高通量测序 | 第102-103页 |
2.2.7 数据分析流程 | 第103页 |
2.2.8 454高通量测序数据处理 | 第103-109页 |
2.3 结果与分析 | 第109-124页 |
2.3.1 窖泥总基因组DNA的提取 | 第109-110页 |
2.3.2 PCR条件优化 | 第110-114页 |
2.3.3 有效序列数据统计 | 第114页 |
2.3.4 优质序列数据统计 | 第114-115页 |
2.3.5 各样品测序数据统计 | 第115-119页 |
2.3.6 全样品聚类分析 | 第119页 |
2.3.7 窖泥样品中古细菌和细菌群落组成 | 第119-124页 |
2.4 本章小结 | 第124-127页 |
附录 第三章 窖泥细菌分离、鉴定及发酵产物分析 | 第127-144页 |
引言 | 第127页 |
3.1 实验材料 | 第127-130页 |
3.1.1 窖泥样品 | 第127页 |
3.1.2 培养基 | 第127-128页 |
3.1.3 实验试剂 | 第128-129页 |
3.1.4 仪器耗材 | 第129-130页 |
3.1.5 数据分析网站及软件 | 第130页 |
3.2 实验方法 | 第130-136页 |
3.2.1 窖泥中细菌的分离 | 第130-131页 |
3.2.2 感受态细胞的制备 | 第131页 |
3.2.3 分离菌株的16S rRNA基因扩增 | 第131-133页 |
3.2.4 TA克隆及蓝白斑筛选 | 第133页 |
3.2.5 重组质粒筛选及测序 | 第133-134页 |
3.2.6 测序数据分析 | 第134页 |
3.2.7 可培养细菌发酵产物分析 | 第134-136页 |
3.3 结果与分析 | 第136-143页 |
3.3.1 窖泥细菌的分离及鉴定 | 第136-139页 |
3.3.2 原浆白酒中易挥发组分分析 | 第139-140页 |
3.3.3 分离细菌的发酵产物分析 | 第140-143页 |
3.4 本章小结 | 第143-144页 |
附录表1 各样品中门的分类水平上细菌群落结构组成 | 第144-145页 |
附录表2 各个样品中所检测到的各个属的序列条数 | 第145-152页 |
附录表3 采用GC/MS对浓香型白酒中有机化合物进行相对定量分析 | 第152-154页 |
参考文献 | 第154-167页 |
致谢 | 第167-168页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第168-169页 |
附录 | 第169-187页 |
附件 | 第187页 |