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猪源肠外致病性大肠杆菌六型分泌系统PPECC3300229基因缺失株的构建及功能研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略词表 (Abbreviation)第11-12页
1 文献综述第12-25页
    1.1 革兰氏阴性菌中分泌系统的概述第12-15页
        1.1.1 I型分泌系统第12页
        1.1.2 II型分泌系统第12-13页
        1.1.3 III型分泌系统第13页
        1.1.4 IV型分泌系统第13-14页
        1.1.5 V型分泌系统第14页
        1.1.6 VI型分泌系统第14-15页
    1.2 VI型分泌系统详述第15-23页
        1.2.1 VI型分泌系统的组成第15-18页
        1.2.2 T6SS的效应分子第18-21页
            1.2.2.1 T6SS效应分子的发现第18-19页
            1.2.2.2 效应分子的分泌机制第19-21页
        1.2.3 VI型分泌系统的调控第21-23页
            1.2.3.1 组蛋白样蛋白:H-NS或H-NS样蛋白第21-22页
            1.2.3.2 σ54 及bEBPs第22页
            1.2.3.3 群体感应第22-23页
            1.2.3.4 TfoX及TfoY第23页
    1.3 肠外致病性大肠杆菌T6SS的研究进展第23-25页
2 研究目的与意义第25-26页
3 材料与方法第26-47页
    3.1 实验材料第26-33页
        3.1.1 菌株、质粒与细胞第26-29页
        3.1.2 细胞及实验动物第29页
        3.1.3 工具酶及主要试剂、试剂盒及仪器第29-30页
        3.1.4 实验所用手术器械第30页
        3.1.5 培养基与抗生素及其配制第30页
        3.1.6 主要缓冲液与相关溶液及其配制第30-32页
            3.1.6.1 琼脂糖凝胶电泳缓冲液及其配制第30-31页
            3.1.6.2 大肠杆菌感受态细胞制备用试剂第31页
            3.1.6.3 大肠杆菌电转化缓冲液第31页
            3.1.6.4 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)缓冲液及试剂第31-32页
            3.6.1.5 其它缓冲液的制备第32页
        3.1.7 使用的引物第32-33页
    3.2 实验方法第33-47页
        3.2.1 猪源肠外致病性大肠杆菌的培养及基因组的提取第33页
        3.2.2 大肠杆菌感受态制备(氯化钙法)第33-34页
        3.2.3 猪源肠外致病性大肠杆菌感受态细胞的制备第34页
        3.2.4 猪源肠外致病性大肠杆菌的电转化第34页
        3.2.5 细胞的培养第34-35页
            3.2.5.1 RAW264.7 细胞培养第34-35页
            3.2.5.2 HBMEC细胞培养第35页
        3.2.6 缺失株 Δ0229 构建第35-39页
            3.2.6.1 pRE112Δ0229重组质粒的构建第35-37页
            3.2.6.2 缺失株 Δ0229 的筛选及PCR鉴定第37-39页
        3.2.7 互补菌株 Δ0229-0229 的构建第39页
            3.2.7.1 pHSG396-0229重组质粒的构建第39页
            3.2.7.2 互补菌株 Δ0229-0229 的筛选及鉴定第39页
        3.2.8 0229 编码蛋白aec28的原核表达第39-41页
            3.2.8.1 pET28a-0229 原核表达质粒的构建第39页
            3.2.8.2 aec28的体外诱导表达第39-40页
            3.2.8.3 aec28蛋白的SDS-PAGE鉴定及Western blot鉴定第40-41页
        3.2.9 生长特性测定第41页
        3.2.10 细菌间竞争能力分析第41页
        3.2.11 吞噬后存活试验第41-42页
        3.2.12 粘附侵入能力试验第42-43页
        3.2.13 猪全血杀菌试验第43页
        3.2.14 组织载菌量测定第43页
        3.2.15 细菌RNA的提取及浓度的测定第43-44页
        3.2.16 cDNA模板制备第44-45页
            3.2.16.1 gDNA去除第44页
            3.2.16.2 逆转录cDNA第44-45页
        3.2.17 SYBR Green法荧光定量PCR第45-46页
        3.2.18 使用生物学软件第46页
        3.2.19 统计学分析第46-47页
4 结果与分析第47-60页
    4.1 基因PPECC33_00229(0229)的氨基酸序列分析第47页
    4.2 猪源肠外致病性大肠杆菌缺失株 Δ0229 的构建及鉴定第47-50页
        4.2.1 重组自杀性质粒pRE112-Δ0229 的构建第47-49页
        4.2.2 缺失株 Δ0229 的构建及鉴定第49-50页
    4.3 Δ0229 互补菌株 Δ0229-0229 的构建及鉴定第50-51页
    4.4 菌株生长特性测定第51-52页
    4.5 细菌间竞争能力分析第52页
    4.6 吞噬后存活能力比较第52-53页
    4.7 粘附侵入比较第53-54页
    4.8 全血杀菌试验第54-55页
    4.9 小鼠体内组织载菌量比较第55页
    4.10 T6SS相关基因转录水平检测第55-56页
    4.11 猪源肠外致病性大肠杆菌aec28的原核表达第56-60页
        4.11.1 0229 基因的克隆及pET28a-0229 原核表达质粒的构建第56-57页
        4.11.2 aec28-His融合蛋白的表达第57-60页
5 讨论第60-63页
6 结论第63-64页
参考文献第64-77页
致谢第77页

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