| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第12-14页 |
| 第一部分 玉米干旱相关代谢物的全基因组关联分析 | 第14-57页 |
| 1 前言 | 第14-27页 |
| 1.1 玉米重要性 | 第14页 |
| 1.2 关联分析 | 第14-23页 |
| 1.2.1 关联分析概念及优点 | 第14-16页 |
| 1.2.2 群体结构对关联分析的影响 | 第16-18页 |
| 1.2.3 关联分析的模型发展 | 第18-19页 |
| 1.2.4 植物关联分析研究概况 | 第19-22页 |
| 1.2.5 玉米抗旱关联分析研究 | 第22-23页 |
| 1.3 干旱对玉米生长的影响 | 第23-24页 |
| 1.4 耐旱研究的困难及耐旱指标 | 第24-25页 |
| 1.5 本研究目的与意义 | 第25-27页 |
| 2 材料和方法 | 第27-33页 |
| 2.1 实验材料与田间设计 | 第27-28页 |
| 2.2 田间取样 | 第28-29页 |
| 2.3 代谢物测定 | 第29-30页 |
| 2.4 基因型数据及基因型填补 | 第30-31页 |
| 2.4.1 基因型数据 | 第30页 |
| 2.4.2 基因型推算 | 第30-31页 |
| 2.5 全基因组关联分析 | 第31-32页 |
| 2.6 杂交种的代谢物表现 | 第32-33页 |
| 3 结果和分析 | 第33-49页 |
| 3.1 推算基因型的准确性 | 第33-35页 |
| 3.2 全基因组关联分析 | 第35-45页 |
| 3.3 杂交种代谢物与生理性状变异分析 | 第45-49页 |
| 4 讨论 | 第49-57页 |
| 4.1 为何选CML312作为测验种 | 第49-50页 |
| 4.2 基因型推算 | 第50-51页 |
| 4.3 GWAS及验证 | 第51-55页 |
| 4.3.1 GWAS阈值选择 | 第51页 |
| 4.3.2 GWAS模型选择 | 第51-52页 |
| 4.3.3 PCA分析 | 第52页 |
| 4.3.4 与低密度标记结果比较 | 第52-55页 |
| 4.4 候选基因分析 | 第55页 |
| 4.5 总结 | 第55-57页 |
| 第二部分 基于高通量表型组和QTL分析解析玉米动态生长遗传结构 | 第57-93页 |
| 1 引言 | 第57-72页 |
| 1.1 作物遗传改良的方法与挑战 | 第57-60页 |
| 1.2 植物数量性状遗传研究 | 第60-63页 |
| 1.2.1 QTL定位的原理及方法 | 第60-61页 |
| 1.2.2 QTL的定位及克隆 | 第61-63页 |
| 1.3 高通量表型组学 | 第63-70页 |
| 1.3.1 表型组学概念及优点 | 第63-64页 |
| 1.3.2 表型平台常用光学技术 | 第64-66页 |
| 1.3.3 国内外表型平台发展及分类 | 第66-70页 |
| 1.3.3.1 环境可控的室内表型平台 | 第67页 |
| 1.3.3.2 植物根系表型平台 | 第67-68页 |
| 1.3.3.3 大田植物表型平台 | 第68-69页 |
| 1.3.3.4 国内表型平台发展 | 第69页 |
| 1.3.3.5 国内外表型组学相关会议 | 第69-70页 |
| 1.4 植物表型组学研究进展 | 第70-71页 |
| 1.5 表型组学未来挑战 | 第71页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第71-72页 |
| 2 材料与方法 | 第72-78页 |
| 2.1 实验材料、种植条件及实验设计 | 第72-74页 |
| 2.2 图像分析和性状提取 | 第74-76页 |
| 2.3 早期生长阶段的表型对产量的预测 | 第76-77页 |
| 2.4 遗传力分析 | 第77页 |
| 2.5 基因型，连锁图谱构建和QTL定位 | 第77页 |
| 2.6 性状-位点网络构建 | 第77-78页 |
| 3 结果与分析 | 第78-90页 |
| 3.1 玉米高通量表型平台 | 第78页 |
| 3.2 表型平台用于玉米表型鉴定的性能评估 | 第78-80页 |
| 3.3 玉米表型的自然变异 | 第80-82页 |
| 3.4 QTL分析 | 第82-88页 |
| 3.5 一些新性状可用作最终产量预测的指标 | 第88-90页 |
| 4 讨论 | 第90-93页 |
| 4.1 平台特性及优势 | 第90页 |
| 4.2 QTL分布特性 | 第90-91页 |
| 4.3 产量预测与理想株型 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-109页 |
| 附录 | 第109-134页 |
| 致谢 | 第134-136页 |