基于时序网络的蛋白质复合物挖掘与疾病基因预测研究
摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 课题研究背景 | 第10-13页 |
1.2 课题研究意义 | 第13-14页 |
1.3 论文主要创新 | 第14-15页 |
1.4 本文的组织结构 | 第15-16页 |
第二章 蛋白质相互作用网络相关研究进展 | 第16-22页 |
2.1 蛋白质网络拓扑特征 | 第16-17页 |
2.2 关键节点识别的相关研究 | 第17-18页 |
2.3 蛋白质复合物识别算法的相关研究 | 第18-19页 |
2.4 基于相互作用网络的致病基因预测的相关研究 | 第19-20页 |
2.5 本章小结 | 第20-22页 |
第三章 基于时序网络和局部策略的蛋白质复合物挖掘 | 第22-44页 |
3.1 引言 | 第22-23页 |
3.2 算法设计与实现 | 第23-30页 |
3.2.1 时序网络的构建 | 第23-25页 |
3.2.2 基于邻居节点紧密度的划分策略 | 第25-27页 |
3.2.3 算法流程 | 第27-30页 |
3.3 实验结果分析 | 第30-43页 |
3.3.1 实验数据 | 第30页 |
3.3.2 算法有效性分析 | 第30-35页 |
3.3.3 蛋白质复合物动态特性分析 | 第35-40页 |
3.3.4 功能富集分析 | 第40-43页 |
3.4 本章小结 | 第43-44页 |
第四章 基于蛋白质功能模块排序的疾病基因预测 | 第44-56页 |
4.1 引言 | 第44-45页 |
4.2 算法设计与实现 | 第45-49页 |
4.2.1 模块相互作用网络的构建及其初始化 | 第45-48页 |
4.2.2 Mpagerank方法 | 第48-49页 |
4.3 实验分析 | 第49-55页 |
4.3.1 实验数据 | 第49页 |
4.3.2 基因排序比较分析 | 第49-50页 |
4.3.3 影响模块排名因素的分析 | 第50-53页 |
4.3.4 乳腺癌疾病模块化分析 | 第53页 |
4.3.5 模块重叠化分析 | 第53-55页 |
4.4 本章小结 | 第55-56页 |
第五章 总结与展望 | 第56-58页 |
5.1 本文总结 | 第56-57页 |
5.2 展望 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-68页 |
在校期间发表的论文和参与的项目 | 第68-69页 |
致谢 | 第69页 |