基于转录组学研究文蛤对Cd2+的响应机制
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第一章 文献综述 | 第8-18页 |
1 转录组分析技术在贝类中的应用 | 第8-12页 |
1.1 转录组分析技术的发展现状 | 第8-9页 |
1.2 高通量转录组测序技术在贝类研究的应用 | 第9-12页 |
1.2.1 开发分子标记 | 第9-10页 |
1.2.2 功能基因或新基因挖掘 | 第10-11页 |
1.2.3 miRNA发现和功能研究的应用 | 第11-12页 |
2 重金属镉污染与生物对镉的响应机制 | 第12-15页 |
2.1 镉的污染来源及现状 | 第12-13页 |
2.2 镉在贝类中的蓄积 | 第13页 |
2.3 镉的毒理机制 | 第13页 |
2.4 贝类镉胁迫反应的研究进展 | 第13-14页 |
2.5 文蛤及其研究进展 | 第14-15页 |
3 功能基因介绍 | 第15-16页 |
3.1 CYP450介绍 | 第15页 |
3.2 Hsps基因介绍 | 第15-16页 |
3.3 GPA基因介绍 | 第16页 |
3.4 SOD基因介绍 | 第16页 |
3.5 CAT基因介绍 | 第16页 |
4 本研究的目的与意义 | 第16-18页 |
第二章 辽河口沉积物环境污染指标的调查分析 | 第18-25页 |
1 前言 | 第18页 |
2 材料与方法 | 第18-22页 |
2.1 取样方法 | 第18-19页 |
2.2 样品分析 | 第19-20页 |
2.3 数据分析 | 第20页 |
2.4 分析评价方法 | 第20-22页 |
2.4.1 污染系数 | 第20页 |
2.4.2 累积指数 | 第20-21页 |
2.4.3 潜在生态风险系数 | 第21-22页 |
3 结果与分析 | 第22-24页 |
3.1 沉积物中各重金属污染的含量 | 第22页 |
3.2 沉积物中镉含量的空间分布 | 第22-23页 |
3.3 沉积物中汞含量的空间分布 | 第23-24页 |
4 讨论 | 第24-25页 |
第三章 文蛤转录组测序 | 第25-36页 |
1 前言 | 第25页 |
2 材料与方法 | 第25-27页 |
2.1 实验材料的采集 | 第25-26页 |
2.2 实验流程 | 第26页 |
2.3 高通量数据分析 | 第26-27页 |
3 结果与分析 | 第27-34页 |
3.1 文蛤转录组短片段的测序和重新组装 | 第27-28页 |
3.2 基因功能注释 | 第28-34页 |
4 讨论 | 第34-36页 |
第四章 文蛤对Cd离子的响应表达 | 第36-44页 |
1 前言 | 第36页 |
2 实验材料的采集 | 第36页 |
3 文蛤总RNA的提取 | 第36-43页 |
3.1 总RNA提取样品 | 第36-38页 |
3.1.1 总RNA提取试剂盒及实验器材 | 第37-38页 |
3.1.2 RNA质量检测 | 第38页 |
3.2 qRT-PCR | 第38-40页 |
3.2.1 试剂盒试剂说明 | 第38页 |
3.2.2 去除基因组DNA反应 | 第38-39页 |
3.2.3 反转录反应 | 第39页 |
3.2.4 Real Time PCR | 第39-40页 |
3.3 结果与分析 | 第40-43页 |
4 讨论 | 第43-44页 |
第五章 结论 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-54页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第54-57页 |
致谢 | 第57页 |