| 摘要 | 第4-5页 |
| SUMMARY | 第5-6页 |
| 英文缩略 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-19页 |
| 1 DNA条形码简介 | 第10页 |
| 2 植物DNA条形码的研究现状 | 第10-15页 |
| 2.1 单个片段植物DNA条形码研究现状 | 第12-14页 |
| 2.1.1 rbcL片段 | 第12页 |
| 2.1.2 mat K片段 | 第12-13页 |
| 2.1.3 trnH-psbA片段 | 第13页 |
| 2.1.4 ITS序列 | 第13-14页 |
| 2.2 多片段组合植物DNA条形码研究进展及优缺点分析 | 第14-15页 |
| 2.2.1 rpoC1+rpoB+mat K或rpoC1+matK+trnH-psbA | 第14-15页 |
| 2.2.2 mat K+atpF-atpH+psbK-psbI或matK+atpF-atpH+trnH-psbA | 第15页 |
| 3 DNA条形码技术在植物中的应用 | 第15-17页 |
| 3.1 DNA条形码在保护珍稀濒危植物物种中的应用 | 第15-16页 |
| 3.2 DNA条形码在鉴定物种及发现隐种方面发挥重要作用 | 第16页 |
| 3.3 DNA条形码在植物系统发育研究中的应用 | 第16-17页 |
| 4 DNA条形码的工作流程及分析方法 | 第17-18页 |
| 4.1 工作流程 | 第17页 |
| 4.2 分析方法 | 第17-18页 |
| 4.2.1 序列比对 | 第17页 |
| 4.2.2 计算K2P遗传距离，分析种内种间变异程度 | 第17页 |
| 4.2.3 构建系统发育树 | 第17-18页 |
| 5 存在的争议与展望 | 第18-19页 |
| 第二章 材料和方法 | 第19-31页 |
| 1 实验材料 | 第19-22页 |
| 1.1 实验牧草 | 第19-21页 |
| 1.2 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 1.3 主要试剂 | 第22页 |
| 2 实验方法 | 第22-29页 |
| 2.1 DNA提取 | 第22-23页 |
| 2.2 基因组DNA检测 | 第23-24页 |
| 2.2.1 琼脂糖凝胶电泳法检测 | 第23-24页 |
| 2.2.2 纯度系浓度检测 | 第24页 |
| 2.3 DNA Barcoding基因选择与引物设计 | 第24-28页 |
| 2.4 PCR扩增 | 第28页 |
| 2.4.1 反应体系 | 第28页 |
| 2.4.2 反应条件 | 第28页 |
| 2.5 胶回收PCR产物 | 第28-29页 |
| 2.6 克隆及测序 | 第29页 |
| 3 数据分析 | 第29-31页 |
| 第三章 结果与分析 | 第31-51页 |
| 1 PCR扩增引物筛选 | 第31-35页 |
| 2 DNA保守区识别 | 第35-36页 |
| 3 DNA Barcodes候选特异性片段多样性分析 | 第36-41页 |
| 3.1 mat K1片段多样性分析 | 第36-37页 |
| 3.2 mat K2片段多样性分析 | 第37-38页 |
| 3.3 mat K3片段多样性分析 | 第38-39页 |
| 3.4 rbc L片段多样性分析 | 第39-41页 |
| 4 单倍型分析 | 第41-46页 |
| 4.1 mat K1单倍型分析 | 第41-42页 |
| 4.2 mat K2单倍型分析 | 第42-43页 |
| 4.3 mat K3单倍型分析 | 第43-44页 |
| 4.4 rbc L单倍型分析 | 第44-46页 |
| 5 DNA Barcoding数据库的建立 | 第46-49页 |
| 5.1 禾本科牧草DNA Barcoding数据库 | 第46-47页 |
| 5.2 豆科牧草DNA Barcoding数据库 | 第47-49页 |
| 6 系统发育树的构建 | 第49-51页 |
| 第四章 讨论 | 第51-57页 |
| 1 常见牧草标记位点选择及引物设计 | 第51-52页 |
| 2 豆科和禾本科牧草的饲用价值及其DNA Barcoding研究的必要性 | 第52页 |
| 3 单片段及多片段组合方式鉴别效率比较 | 第52-56页 |
| 3.1 mat K基因4个标记位点 | 第53-54页 |
| 3.2 rbc L基因 | 第54页 |
| 3.3 trnH-psbA基因 | 第54-55页 |
| 3.4 ITS基因 | 第55页 |
| 3.5 mat K基因3个标记位点（matK1、mat K2和matK3）及rbc L基因联合鉴别效率 | 第55-56页 |
| 4 基于系统发育树的辅助鉴定 | 第56-57页 |
| 第五章 结论 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 附录 | 第66-67页 |
| 作者简介 | 第67-68页 |
| 导师简介 | 第68-69页 |
