| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| ·基因转录起始位点研究的意义 | 第11-13页 |
| ·转录调控是基因表达调控中的重要组分 | 第11页 |
| ·真核生物的转录研究 | 第11-12页 |
| ·真核生物转录组的复杂性 | 第11-12页 |
| ·转录起始是转录水平调控中最关键的步骤 | 第12页 |
| ·核心启动子（core promoter） | 第12-13页 |
| ·核心启动子在转录起始中的重要地位 | 第12-13页 |
| ·核心启动子的鉴别方法 | 第13页 |
| ·研究基因转录起始位点的方法 | 第13-19页 |
| ·帽分析基因表达法（Cap Analysis of Gene Expression；CAGE） | 第13-16页 |
| ·CAGE 方法简介 | 第13-15页 |
| ·从转录起始位点到核心启动子 | 第15-16页 |
| ·其他方法 | 第16-19页 |
| ·快速放大 cDNA5’末端法(5’RACE) | 第16-17页 |
| ·5’SAGE | 第17-18页 |
| ·nanoCAGE | 第18页 |
| ·GIS-PET | 第18-19页 |
| ·真核生物的转录起始模式 | 第19-23页 |
| ·哺乳动物的转录起始模式 | 第19-21页 |
| ·果蝇的转录起始模式 | 第21-23页 |
| 第二章 CAGE 技术的建立 | 第23-45页 |
| ·引言 | 第23-24页 |
| ·实验材料 | 第24-26页 |
| ·试剂 | 第24页 |
| ·仪器 | 第24-25页 |
| ·引物与接头序列 | 第25-26页 |
| ·实验方法 | 第26-38页 |
| ·酵母总 RNA 的提取:比较 Trizol 和裂解液破壁对总 RNA 质量的影响 | 第26-27页 |
| ·Rnase I 酶切条件的优化 | 第27-34页 |
| ·CAGE 短标签文库的构建 | 第34-38页 |
| ·实验结果 | 第38-44页 |
| ·提取酵母总 RNA 的电泳结果 | 第38-39页 |
| ·RNase I 酶切条件的优化 | 第39-40页 |
| ·不同酶量的 RNase I 处理比较 | 第39页 |
| ·RNase I 处理不同次数比较 | 第39-40页 |
| ·短暂升温对酶切效果的影响 | 第40页 |
| ·短标签 CAGE 文库方法的建立 | 第40-44页 |
| ·双链 cDNA 的电泳检测 | 第40-41页 |
| ·短标签文库扩增产物 | 第41-42页 |
| ·短标签文库结构 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第三章 利用 CAGE 技术研究裂殖酵母 S.pombe 的转录起始位点 | 第45-53页 |
| ·引文 | 第45页 |
| ·实验材料 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46页 |
| ·实验结果 | 第46-51页 |
| ·克隆测序结果 | 第46页 |
| ·高通量测序结果比对 | 第46页 |
| ·核糖体 RNA 的比例 | 第46-47页 |
| ·CAGE 标签的分布 | 第47-48页 |
| ·核心启动子形状 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 结束语 | 第53-55页 |
| ·主要工作与创新点 | 第53页 |
| ·后续研究工作 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
