| 中文摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 第一章 前言 | 第15-19页 |
| 1.1 线粒体基因组的研究概况 | 第15-16页 |
| 1.1.1 线粒体概述 | 第15页 |
| 1.1.2 真菌线粒体基因组的结构和特征 | 第15-16页 |
| 1.2 冬虫夏草概述 | 第16-17页 |
| 1.2.1 分类地位 | 第16页 |
| 1.2.2 研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 论文研究目的和意义 | 第17页 |
| 1.4 技术路线 | 第17-19页 |
| 第二章 冬虫夏草菌线粒体基因组测序及注释分析 | 第19-47页 |
| 2.1 实验材料、仪器和试剂 | 第19页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第19页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 实验试剂的配制 | 第19-20页 |
| 2.2.2 菌株的培养 | 第20-21页 |
| 2.2.3 菌株的保藏 | 第21页 |
| 2.2.4 DNA的提取方法 | 第21-22页 |
| 2.2.5 PCR引物设计 | 第22-23页 |
| 2.2.6 DNA片段的扩增 | 第23页 |
| 2.2.7 PCR产物的回收和纯化 | 第23-24页 |
| 2.2.8 基因克隆 | 第24-25页 |
| 2.3 测序及序列分析 | 第25-26页 |
| 2.3.1 测序方法 | 第25页 |
| 2.3.2 洌序结果的采集 | 第25页 |
| 2.3.3 序列组装与拼接 | 第25页 |
| 2.3.4 基因注释 | 第25-26页 |
| 2.3.5 序列分析 | 第26页 |
| 2.4 冬虫夏草菌与其他真菌的比较线粒体基因组学分析 | 第26-28页 |
| 2.4.1 基因组大小及tRNA基因的比较 | 第26页 |
| 2.4.2 PCG基因及rRNA基因顺序的比较 | 第26-27页 |
| 2.4.3 tRNA基因顺序的比较 | 第27页 |
| 2.4.4 内含子位置的比较 | 第27-28页 |
| 2.4.5 系谱分析 | 第28页 |
| 2.5 结果分析 | 第28-47页 |
| 2.5.1 冬虫夏草菌线粒体基因组的基本结构 | 第28-29页 |
| 2.5.2 PCG基因和rRNA基因的分析 | 第29-34页 |
| 2.5.2.1 碱基含量的分析 | 第32-33页 |
| 2.5.2.2 PCG基因中密码子使用情况分析 | 第33-34页 |
| 2.5.2.3 PCG基因中氨基酸使用情况分析 | 第34页 |
| 2.5.3 tRNA基因的分析 | 第34-38页 |
| 2.5.4 冬虫夏草菌线粒体基因组内含子的分析 | 第38-39页 |
| 2.5.5 冬虫夏草菌与肉座菌目真菌的比较线粒体基因组学研究 | 第39-47页 |
| 2.5.5.1 基因组大小及tRNA基因的比较 | 第40-42页 |
| 2.5.5.2 PCG基困及rRNA基因排列顺序的比较 | 第42-43页 |
| 2.5.5.3 tRNA基因顺序的比较 | 第43-44页 |
| 2.5.5.4 内含子位置的比较 | 第44-45页 |
| 2.5.5.5 系谱分析 | 第45-47页 |
| 第三章 不同冬虫夏草菌株的比较线粒体基因组学研究 | 第47-55页 |
| 3.1 实验材料、仪器和试剂 | 第47页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第47页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第47页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第47页 |
| 3.2 实验方法 | 第47页 |
| 3.3 测序及序列分析 | 第47-49页 |
| 3.3.1 测序方法 | 第47-48页 |
| 3.3.2 序列组装与拼接 | 第48页 |
| 3.3.3 基因注释 | 第48页 |
| 3.3.4 序列分析 | 第48页 |
| 3.3.5 系谱分析 | 第48-49页 |
| 3.4 结果分析 | 第49-55页 |
| 3.4.1 线粒体基因组组织结构的比较 | 第49-50页 |
| 3.4.2 线粒体基因组序列的比较 | 第50-54页 |
| 3.4.3 系谱分析 | 第54-55页 |
| 第四章 总结 | 第55-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 个人简况及联系方式 | 第66-68页 |
