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大肠杆菌sRNA编码基因yigP结构与功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第1章 综述与导言第10-28页
   ·yigP基因背景介绍第10-11页
   ·基因的敲除及功能回补第11-13页
     ·利用温敏质粒敲除基因第11-13页
     ·质粒的功能回补第13页
   ·定点突变第13-14页
   ·启动子第14-18页
     ·启动子的结构与分类第15-16页
     ·启动子的研究方法第16-18页
   ·操纵子第18-20页
     ·操纵子的结构第18页
     ·操纵子的调控第18-19页
     ·操纵子的预测与鉴定方法第19-20页
   ·sRNA第20-27页
     ·非编码RNA简介第20页
     ·细菌中sRNA简介第20-21页
     ·sRNA的发现第21-23页
     ·sRNA的研究方法第23-24页
     ·sRNA与蛋白质的关系第24-25页
     ·生物信息学在sRNA研究中的应用第25-27页
   ·课题研究背景及工作目标第27-28页
     ·研究背景第27页
     ·工作目标第27-28页
第2章 材料与方法第28-42页
   ·材料与器材第28-36页
     ·药品与试剂第28-30页
     ·实验仪器第30-31页
     ·细菌培养基第31页
     ·缓冲液第31-33页
     ·菌种与质粒第33-36页
     ·生物学软件及数据库第36页
   ·微生物方法第36-37页
     ·细菌培养条件第36页
     ·菌种的保藏和活化第36-37页
   ·遗传学方法第37页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第37页
     ·大肠杆菌的转化第37页
   ·分子生物学方法第37-42页
     ·大肠杆菌质粒DNA提取第37-38页
     ·DNA纯化回收第38-39页
     ·DNA的酶切第39页
     ·DNA的连接第39页
     ·DNA的琼脂糖凝胶电泳第39页
     ·DNA序列的测定第39页
     ·RNA相关实验方法第39-40页
     ·β-半乳糖苷酶测活第40-41页
     ·southern blot第41-42页
第3章 结果和分析第42-78页
   ·大肠杆菌yigP基因最小功能片段的确定第42-49页
     ·yigP基因功能片段的第一轮缩小第42-46页
     ·yigP基因功能片段上游边界的缩短第46-47页
     ·yigP基因功能片段下游边界的缩短第47-49页
   ·大肠杆菌yigP基因启动子边界的确定及序列分析第49-63页
     ·β-半乳糖苷酶测活体系的建立第50-52页
     ·yigP基因启动子下游边界的确定第52-54页
     ·yigP基因启动子上游边界的确定第54-56页
     ·以绿色荧光蛋白为报告基因检测启动子活性第56-57页
     ·yigP启动子-10区的鉴定第57-59页
     ·yigP启动子-35区的鉴定第59-61页
     ·yigP启动子并非‘extended-10’启动子第61-63页
   ·yigP负调控序列的分析第63-66页
     ·P42V3和P43V3片段启动子活性比较第63-64页
     ·单碱基突变对该负调控序列的影响第64-66页
   ·大肠杆菌yigP基因编码一个生长必需的sRNA第66-73页
     ·yigP基因开放阅读框的分析第66页
     ·移码突变回补质粒的构建第66-71页
     ·yigP为ncRNA第71-72页
     ·yigPRNA二级结构的预测第72-73页
   ·大肠杆菌yigP基因的操纵子分析第73-78页
第4章 讨论第78-82页
   ·前期实验结果的讨论第78-79页
   ·启动子调控序列第79页
   ·yigP靶点预测第79-80页
   ·RT-PCR中基因组DNA的去除第80页
   ·处于操纵子中的yigP第80-81页
   ·课题前景及展望第81-82页
结论第82-83页
参考文献第83-88页
致谢第88页

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