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迟钝爱德华氏菌EIB202 Sigma(54)编码基因rpoN的敲除及功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第1章 综述与导言第10-21页
   ·水产养殖的现状第10页
   ·迟钝爱德华氏菌介绍第10-12页
     ·迟钝爱德华氏菌第10-11页
     ·迟钝爱德华氏菌是目前具有极大危害的海水养殖水生动物致病菌第11页
     ·迟钝爱德华氏菌致病机理的研究现状第11-12页
     ·迟钝爱德华氏菌的耐药性第12页
   ·减毒疫苗是防范海水养殖型生物病原菌侵染的最佳工具第12-13页
   ·σ因子概述第13-17页
     ·σ因子控制与DNA的结合第13页
     ·RpoN是Sigma(54)家族的唯一成员第13-16页
     ·RpoN在氮源调控、压力调控及毒力调控方面具有重要作用第16-17页
   ·相关实验技术综述第17-19页
     ·自杀质粒系统第17-18页
     ·实时荧光定量PCR技术第18页
     ·差异显示PCR技术第18-19页
   ·课题研究背景及工作目标第19-21页
     ·研究背景第19-20页
     ·工作目标第20-21页
第2章 材料与方法第21-40页
   ·材料与仪器第21-29页
     ·化学药品与试剂第21页
     ·生物药品与试剂第21-22页
     ·培养基第22页
     ·缓冲液第22-24页
     ·实验仪器设备第24-25页
     ·菌株与质粒第25-26页
     ·引物第26-28页
     ·生物学软件第28-29页
   ·微生物学方法第29页
     ·细菌培养条件第29页
     ·菌种的保藏第29页
   ·遗传学方法第29-30页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第29页
     ·迟钝爱德华氏菌电转感受态细胞制备第29-30页
     ·大肠杆菌的转化(钙转)第30页
     ·迟钝爱德华氏菌的电转化第30页
   ·分子生物学方法(DNA相关)第30-35页
     ·质粒DNA提取第30-31页
     ·染色体DNA的大量抽提第31-32页
     ·DNA的酶切第32页
     ·DNA的连接第32页
     ·DNA的乙醇沉淀第32页
     ·DNA的琼脂糖凝胶电泳第32-33页
     ·DNA的琼脂糖凝胶回收第33-34页
     ·Sourthern blot第34-35页
   ·分子生物学方法(RNA相关)第35-40页
     ·迟钝爱德华氏菌RNA提取第35-37页
     ·RNA质量检测第37页
     ·逆转录PCR第37-38页
     ·实时荧光定量PCR第38-39页
     ·差异显示PCR第39页
     ·银染第39-40页
第3章 结果与分析第40-68页
   ·rpoN序列及功能区域分析第40-42页
   ·rpoN敲除株、过表达株及回补株构建第42-48页
     ·自杀质粒系统构建rpoN敲除株第42-47页
     ·RpoN过表达株及回补株构建第47-48页
   ·实时荧光定量PCR考察rpoN在生长周期中规律变化第48-53页
     ·迟钝爱德华氏菌生长曲线测定及菌体收集第48页
     ·细胞总RNA提取第48-49页
     ·RNA样品中基因组DNA的成功去除第49-50页
     ·逆转录PCR验证基因组DNA去除第50-51页
     ·实时荧光定量PCR比较各时期rpoN表达量第51-53页
   ·rpoN框内部分缺失株未对上下游基因造成影响第53-55页
     ·逆转录PCR考察rpoN部分缺失株未对其上下游基因造成影响第53-54页
     ·实时荧光定量PCR考察rpoN部分缺失株未对其上下游基因造成影响第54页
     ·rpoN及其上下游基因共转录第54-55页
   ·RpoN对Sigma(70)家族成员在转录水平上的调控第55-57页
   ·RpoN在细菌生长方面发挥重要作用第57-58页
     ·迟钝爱德华氏菌rpoN框内部分缺失株生长曲线测定第57-58页
     ·迟钝爱德华氏菌rpoN框内部分缺失株P_Ⅱ protein编码基因考察第58页
   ·RpoN是重要的压力调控因子第58-60页
     ·RpoN在氧化应激能力调控方面发挥重要作用第58页
     ·RpoN与饥饿耐受能力相关第58-59页
     ·RpoN与高渗耐受相关第59页
     ·RpoN与酸耐受性相关第59-60页
   ·RpoN与毒力相关第60-64页
     ·rpoN缺失株提高了对模式生物斑马鱼的半数致死量及感染周期第60-62页
     ·RpoN与生物被膜形成相关第62页
     ·RpoN与硫酸软骨素酶活性相关第62-63页
     ·RpoN与多粘菌素B抗性无相关性第63-64页
   ·差异显示PCR筛选差异基因第64-65页
     ·差异显示PCR技术第64页
     ·实时荧光定量PCR验证疑似差异基因第64-65页
   ·RpoN与鞭毛合成相关第65-66页
     ·实时荧光定量PCR考察flhABCDE转录表达水平第65-66页
     ·RpoN与鞭毛运动性相关第66页
   ·RpoN调控启动子区域的Sequence logos第66-68页
第4章 讨论第68-70页
第5章 结论及展望第70-72页
   ·主要结论第70页
   ·展望第70-72页
参考文献第72-77页
攻读硕士学位期间撰写的论文第77-78页
致谢第78-79页

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