致谢 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
专业词汇中英文对照表 | 第9-13页 |
1 引言 | 第13-31页 |
·肝细胞癌及乙型肝炎病毒简介 | 第13-14页 |
·肿瘤信号通路 | 第14-19页 |
·p53信号通路 | 第14页 |
·NF-kB信号通路 | 第14-16页 |
·Ras-MAPK及PI3K-Akt信号通路 | 第16-17页 |
·JAK-STAT信号通路 | 第17页 |
·Wnt信号通路 | 第17-19页 |
·选择性剪接及其机制 | 第19-22页 |
·国内外相关研究成果 | 第22-26页 |
·选择性剪接与肿瘤相关性研究 | 第22-23页 |
·snoRNA与肿瘤及选择性剪接的关系 | 第23-24页 |
·选择性剪接的进化研究 | 第24-26页 |
·研究选择性剪接的技术 | 第26-27页 |
·RNA-seq技术原理简介 | 第27-28页 |
·Illumina Solexa测序平台 | 第27页 |
·ABI SOLiD测序平台 | 第27-28页 |
·Roche 454测序平台 | 第28页 |
·基于二代测序技术的选择性剪接研究方法 | 第28-29页 |
·本论文的研究意义与主要内容 | 第29-31页 |
·选题依据和研究意义 | 第29-30页 |
·研究目的与主要内容 | 第30-31页 |
2 选择性剪接在肝癌发生发展中的作用研究 | 第31-63页 |
·材料 | 第31-33页 |
·病理 | 第31页 |
·样品准备 | 第31-32页 |
·实验步骤 | 第32-33页 |
·数据产出 | 第33页 |
·方法 | 第33-41页 |
·RNA-seq数据转录组分析方法 | 第33-40页 |
·剪接异构体多样性分析方法 | 第40页 |
·功能分析方法 | 第40-41页 |
·结果 | 第41-59页 |
·剪接异构体的表达水平 | 第41-45页 |
·选择性剪接的差异 | 第45-47页 |
·剪接异构体的多样性 | 第47-49页 |
·剪接异构体表达相似性 | 第49-50页 |
·选择性剪接对肝癌的影响 | 第50-53页 |
·样品特异性表达的剪接异构体 | 第53-55页 |
·选择性剪接在肝癌中的调节 | 第55-56页 |
·snoRNA和肝癌的关系 | 第56-58页 |
·验证结果 | 第58-59页 |
·讨论及结论 | 第59-63页 |
·讨论 | 第59-60页 |
·结论 | 第60-63页 |
3 物种间同源基因选择性剪接的比较 | 第63-69页 |
·材料 | 第63页 |
·样品准备 | 第63页 |
·数据产出 | 第63页 |
·方法 | 第63-64页 |
·RNA-seq转录组分析方法移植 | 第63-64页 |
·选择性剪接保守性研究方法 | 第64页 |
·结果 | 第64-68页 |
·同源基因及其表达水平 | 第64-65页 |
·同源基因在不同物种中选择性剪接形式保守性 | 第65页 |
·不同物种中选择性剪接形式保守的剪接异构体表达水平 | 第65-66页 |
·选择性剪接形式保守的剪接异构体功能分析结果 | 第66-68页 |
·讨论及结论 | 第68-69页 |
4 硕士期间其他工作 | 第69-73页 |
·肝癌样品中乙型肝炎病毒相关研究 | 第69-71页 |
·HBV蛋白表达 | 第69-70页 |
·肝癌特异性HBV突变 | 第70-71页 |
·血清中小RNA作为肿瘤标志物可行性研究 | 第71-72页 |
·分布式计算机处理基因组序列定位和拼接可行性研究 | 第72-73页 |
附录 | 第73-75页 |
参考文献 | 第75-81页 |
作者简介及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第81页 |