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基于二代测序技术的肝癌转录组中选择性剪接的分析

致谢第1-6页
摘要第6-7页
ABSTRACT第7-9页
专业词汇中英文对照表第9-13页
1 引言第13-31页
   ·肝细胞癌及乙型肝炎病毒简介第13-14页
   ·肿瘤信号通路第14-19页
     ·p53信号通路第14页
     ·NF-kB信号通路第14-16页
     ·Ras-MAPK及PI3K-Akt信号通路第16-17页
     ·JAK-STAT信号通路第17页
     ·Wnt信号通路第17-19页
   ·选择性剪接及其机制第19-22页
   ·国内外相关研究成果第22-26页
     ·选择性剪接与肿瘤相关性研究第22-23页
     ·snoRNA与肿瘤及选择性剪接的关系第23-24页
     ·选择性剪接的进化研究第24-26页
   ·研究选择性剪接的技术第26-27页
   ·RNA-seq技术原理简介第27-28页
     ·Illumina Solexa测序平台第27页
     ·ABI SOLiD测序平台第27-28页
     ·Roche 454测序平台第28页
   ·基于二代测序技术的选择性剪接研究方法第28-29页
   ·本论文的研究意义与主要内容第29-31页
     ·选题依据和研究意义第29-30页
     ·研究目的与主要内容第30-31页
2 选择性剪接在肝癌发生发展中的作用研究第31-63页
   ·材料第31-33页
     ·病理第31页
     ·样品准备第31-32页
     ·实验步骤第32-33页
     ·数据产出第33页
   ·方法第33-41页
     ·RNA-seq数据转录组分析方法第33-40页
     ·剪接异构体多样性分析方法第40页
     ·功能分析方法第40-41页
   ·结果第41-59页
     ·剪接异构体的表达水平第41-45页
     ·选择性剪接的差异第45-47页
     ·剪接异构体的多样性第47-49页
     ·剪接异构体表达相似性第49-50页
     ·选择性剪接对肝癌的影响第50-53页
     ·样品特异性表达的剪接异构体第53-55页
     ·选择性剪接在肝癌中的调节第55-56页
     ·snoRNA和肝癌的关系第56-58页
     ·验证结果第58-59页
   ·讨论及结论第59-63页
     ·讨论第59-60页
     ·结论第60-63页
3 物种间同源基因选择性剪接的比较第63-69页
   ·材料第63页
     ·样品准备第63页
     ·数据产出第63页
   ·方法第63-64页
     ·RNA-seq转录组分析方法移植第63-64页
     ·选择性剪接保守性研究方法第64页
   ·结果第64-68页
     ·同源基因及其表达水平第64-65页
     ·同源基因在不同物种中选择性剪接形式保守性第65页
     ·不同物种中选择性剪接形式保守的剪接异构体表达水平第65-66页
     ·选择性剪接形式保守的剪接异构体功能分析结果第66-68页
   ·讨论及结论第68-69页
4 硕士期间其他工作第69-73页
   ·肝癌样品中乙型肝炎病毒相关研究第69-71页
     ·HBV蛋白表达第69-70页
     ·肝癌特异性HBV突变第70-71页
   ·血清中小RNA作为肿瘤标志物可行性研究第71-72页
   ·分布式计算机处理基因组序列定位和拼接可行性研究第72-73页
附录第73-75页
参考文献第75-81页
作者简介及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第81页

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