致谢 | 第1-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
专业词汇中英文对照表 | 第10-13页 |
第一章 引言 | 第13-27页 |
·癌症生物学研究里程碑回顾 | 第14-15页 |
·肿瘤基因组学研究进展 | 第15-18页 |
·肿瘤细胞的异质性 | 第15-16页 |
·肿瘤微环境的异质性 | 第16页 |
·肿瘤的形成和细胞群体的进化理论模型 | 第16-17页 |
·有待解决的问题 | 第17-18页 |
·肺癌简介 | 第18页 |
·Solexa测序原理简介 | 第18-20页 |
·激光捕获微取样技术(LCM) | 第20页 |
·全基因组扩增技术(WGA)原理与应用 | 第20-22页 |
·全基因组扩增原理 | 第21页 |
·全基因组扩增流程 | 第21-22页 |
·全基因组扩增应用 | 第22页 |
·外显子捕获技术及测序文库构建简介 | 第22-24页 |
·Sequenom SNP基因分型原理 | 第24-26页 |
·本课题实验方案流程总结 | 第26页 |
·本课题研究的主要内容 | 第26-27页 |
第二章 材料和方法 | 第27-33页 |
·实验材料 | 第27-30页 |
·肺癌组织材料 | 第27-28页 |
·实验试剂 | 第28-29页 |
·实验仪器 | 第29页 |
·生物信息学分析平台及软件 | 第29页 |
·生物信息学数据库 | 第29-30页 |
·实验方法 | 第30-33页 |
·分子生物学方法 | 第30-33页 |
·血液DNA的提取 | 第30页 |
·全基因组扩增(WGA)方法 | 第30-31页 |
·外显子捕获文库构建方法 | 第31页 |
·Sequenom验证 | 第31-33页 |
·生物信息学分析方法 | 第33页 |
第三章 实验结果 | 第33-42页 |
·外显子组测序数据分析结果 | 第33-36页 |
·Sequenom SNP基因分型结果 | 第36页 |
·Polyphen-2:人类非同义突变(nsSNP)功能影响预测 | 第36-37页 |
·Polyphen-2非同义突变功能影响预测原理 | 第36-37页 |
·Polyphen-2非同义突变功能影响预测结果 | 第37页 |
·肿瘤特异性突变基因信号通路及GO分子功能分析 | 第37-41页 |
·PANTHER信号通路分析 | 第37-38页 |
·KEGG信号通路分析 | 第38-40页 |
·PANTHER GO分子功能分析 | 第40-41页 |
·不同样品间谱系发生树 | 第41-42页 |
第四章 结论 | 第42-44页 |
·本论文的结论 | 第42页 |
·不同的肺癌肿瘤细胞群体间存在异质性 | 第42页 |
·不同的肺癌肿瘤细胞群体可能来自于同一共同祖先细胞 | 第42页 |
·关键基因的突变可能改变肿瘤细胞群体的适应性 | 第42页 |
·本论文的创新之处和研究意义 | 第42-43页 |
·本研究存在的不足和未来研究展望 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
附录 | 第48-54页 |
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第54页 |