| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究的背景、目的及意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-12页 |
| ·本文的内容和章节安排 | 第12-13页 |
| ·本文的创新点 | 第13-14页 |
| 第2章 序列比对基础知识 | 第14-31页 |
| ·序列比对的分类及简介 | 第14-16页 |
| ·序列比对分类 | 第14页 |
| ·双序列比对简介 | 第14-15页 |
| ·多序列比对简介 | 第15-16页 |
| ·序列相似性分析 | 第16-26页 |
| ·空位罚分概念及策略 | 第16-17页 |
| ·相似替换矩阵 | 第17-22页 |
| ·目标函数 | 第22-24页 |
| ·多序列比对的数据源及评价标准 | 第24-26页 |
| ·比对算法介绍 | 第26-31页 |
| ·双序列比对算法 | 第26-29页 |
| ·多序列比对算法 | 第29-31页 |
| 第3章 基于置换距离的蛋白质多序列比对算法的性能评估 | 第31-42页 |
| ·置换介绍 | 第31-32页 |
| ·最长公共子序介绍 | 第32-33页 |
| ·参与评价的多序列比对算法介绍 | 第33-35页 |
| ·置换距离评价算法的处理过程 | 第35-38页 |
| ·序列比对 | 第35-36页 |
| ·计算距离矩阵 | 第36-38页 |
| ·排序并生成置换 | 第38页 |
| ·计算置换距离 | 第38页 |
| ·基于BAliBASE 数据库的评价结果分析 | 第38-40页 |
| ·基于ROSE 数据的评价结果分析 | 第40-42页 |
| 第4章 相对熵蛋白质多序列比对算法 | 第42-52页 |
| ·相对熵的原理与方法 | 第42-44页 |
| ·相对熵处理过程 | 第44-45页 |
| ·BAliBASE 数据库数据实验结果 | 第45-47页 |
| ·ROSE 生成的数据实验结果 | 第47-50页 |
| ·运行时间比较 | 第50页 |
| ·实验结果分析 | 第50-52页 |
| 第5章 总结与研究展望 | 第52-54页 |
| ·总结 | 第52页 |
| ·存在的问题 | 第52页 |
| ·展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 攻读硕士学位期间取得的学术成果 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |