| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩写词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| ·cDNA文库构建与应用 | 第11-13页 |
| ·关于基因组文库和cDNA文库的简介 | 第11页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第11-12页 |
| ·全长cDNA文库的应用 | 第12-13页 |
| ·EST的应用 | 第13-15页 |
| ·构建遗传学图谱 | 第13页 |
| ·用于制备cDNA微阵列 | 第13-14页 |
| ·分析基因表达谱 | 第14-15页 |
| ·基因表达谱 | 第14页 |
| ·基因功能注释 | 第14页 |
| ·绘制基因表达谱的用途 | 第14-15页 |
| ·分离与筛选目的基因 | 第15页 |
| ·作为外显子标签用于基因组诠释 | 第15页 |
| ·棉花cDNA文库及大规模EST测序研究进展 | 第15-18页 |
| ·基因组学研究 | 第15-16页 |
| ·棉花cDNA文库研究进展 | 第16-17页 |
| ·棉花EST测序研究 | 第17-18页 |
| ·生物信息学研究 | 第18-19页 |
| ·序列比对 | 第18页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第18-19页 |
| ·棉花耐旱基因的研究进展 | 第19-21页 |
| ·渗透调节物质合成相关基因 | 第19-20页 |
| ·可溶性糖合成有关的基因 | 第20页 |
| ·调控耐旱基因表达和信号转导的转录因子 | 第20-21页 |
| ·本研究的技术路线 | 第21页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第23-28页 |
| ·实验材料、试剂和仪器 | 第23页 |
| ·实验所用材料 | 第23页 |
| ·实验试剂和仪器来源 | 第23页 |
| ·实验方法 | 第23-26页 |
| ·文库质量检测 | 第23-24页 |
| ·均一化文库插入片断长度检测 | 第23-24页 |
| ·复制文库及测序 | 第24页 |
| ·生物信息学分析 | 第24-26页 |
| ·EST数据组装 | 第24-25页 |
| ·基因注释及功能分类 | 第25-26页 |
| ·棉花耐旱相关基因的克隆及生物信息学分析 | 第26-28页 |
| 第三章 结果与分析 | 第28-44页 |
| ·均一化文库插入片断长度检测 | 第28-29页 |
| ·生物信息学分析 | 第29-37页 |
| ·高质量EST的获得 | 第29-30页 |
| ·拼接EST序列 | 第30-32页 |
| ·基因注释 | 第32-33页 |
| ·同源物种来源比较 | 第33-34页 |
| ·基因功能分类 | 第34-37页 |
| ·COG分析 | 第34-36页 |
| ·KEGG分析 | 第36页 |
| ·挖掘重要功能基因 | 第36-37页 |
| ·棉花耐旱相关基因克隆及生物信息学分析 | 第37-44页 |
| ·全长分析 | 第38-39页 |
| ·同源比对 | 第39-44页 |
| ·进化树分析 | 第40-41页 |
| ·分析疏水性 | 第41-42页 |
| ·分析亚细胞定位 | 第42-43页 |
| ·分析磷酸化位点 | 第43-44页 |
| 第四章 创新点 | 第44-45页 |
| 第五章 讨论 | 第45-50页 |
| ·cDNA文库技术在植物抗旱机制研究中的应用 | 第45-47页 |
| ·发现重要棉花耐旱基因 | 第47-48页 |
| ·石系亚1号全生育期全长cDNA文库的综合评述及应用前景 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录:EST分析方法备注 | 第58-61页 |
| 1 方法和参数介绍 | 第58页 |
| ·EST数据组装 | 第58页 |
| ·Unigene功能注释 | 第58页 |
| 2 使用到的数据库链接和版本号 | 第58-59页 |
| 3 文库中获得的完整ORF | 第59-61页 |
| 4 KEGG分析EST的代谢 | 第61页 |