| 摘要 | 第1-14页 |
| ABSTRACT | 第14-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-38页 |
| 1 分子生物学概述 | 第19-20页 |
| 2 选题背景 | 第20-23页 |
| ·核糖开关及其调控作用 | 第20-22页 |
| ·半胱氨酸蛋白酶和凋亡抑制蛋白对细胞凋亡的调控作用 | 第22-23页 |
| 3 研究进展 | 第23-26页 |
| ·鸟嘌呤核糖开关的研究进展 | 第24-25页 |
| ·细胞凋亡抑制蛋白的研究进展 | 第25-26页 |
| 4 研究方法 | 第26-30页 |
| ·量子化学方法 | 第26-27页 |
| ·分子对接方法 | 第27-29页 |
| ·分子动力学方法 | 第29-30页 |
| 5 本文工作 | 第30-32页 |
| 参考文献 | 第32-38页 |
| 第二章 修饰嘧啶和嘌呤与嘌呤核糖开关相互作用的理论研究 | 第38-57页 |
| 1 研究背景 | 第38-40页 |
| 2 研究方法 | 第40-42页 |
| ·AutoDock分子对接 | 第40-41页 |
| ·分子动力学模拟 | 第41-42页 |
| 3 结果与讨论 | 第42-51页 |
| ·AutoDock结果分析 | 第42-46页 |
| ·动力学结果分析 | 第46-51页 |
| 4 结论 | 第51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 第三章 鸟嘌呤类似物与鸟嘌呤核糖开关相互作用的理论研究 | 第57-78页 |
| 1 研究背景 | 第57-58页 |
| 2 研究方法 | 第58-61页 |
| ·分子对接参数设置 | 第59-60页 |
| ·分子动力学模拟参数设置 | 第60-61页 |
| 3 结果与讨论 | 第61-72页 |
| ·分子对接结果 | 第61-69页 |
| ·分子动力学模拟 | 第69-72页 |
| 4 结论 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 第四章 含有七元环的双环核心Smac类似物与XIAP BIR3相互作用的研究 | 第78-97页 |
| 1.研究背景 | 第78-79页 |
| 2 研究方法 | 第79-82页 |
| ·分子对接参数设置 | 第80页 |
| ·分子动力学模拟参数设置 | 第80-81页 |
| ·结合自由能计算和能量分解参数设置 | 第81-82页 |
| 3 结果与讨论 | 第82-90页 |
| ·分子对接 | 第82-85页 |
| ·分子动力学模拟 | 第85-88页 |
| ·结合自由能的计算和能量分解 | 第88-90页 |
| 4 结论 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-97页 |
| 第五章 双环和三环核心一价Smac类似物与XIAP-BIR3相互作用的研究 | 第97-117页 |
| 1 研究背景 | 第97-98页 |
| 2 计算细节 | 第98-100页 |
| ·分子对接 | 第99页 |
| ·动力学模拟 | 第99-100页 |
| ·结合自由能计算 | 第100页 |
| 3 结果与讨论 | 第100-109页 |
| ·对接结果 | 第100-105页 |
| ·分子动力学模拟 | 第105-109页 |
| 4 结论 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 博士期间发表的论文 | 第118-121页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第121-122页 |
| 外文论文 | 第122-174页 |
