| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-27页 |
| 1 根围生态系统中的微生物与植物 | 第12-20页 |
| ·植物对根围微生物的影响 | 第12-15页 |
| ·根围微生物对植物的影响 | 第15-18页 |
| ·根围微生物群落与植物的关系 | 第18-20页 |
| 2 湿地生态系统中微生物群落多样性的研究概况 | 第20-21页 |
| 3 微生物生态学研究中主要的分子方法 | 第21-24页 |
| ·DNA解链及复性分析 | 第21-22页 |
| ·标记核酸探针杂交 | 第22页 |
| ·基于PCR技术的研究方法 | 第22-24页 |
| 4 本研究的目的、意义及研究方法概述 | 第24-27页 |
| 第二章 九段沙三种优势植物根围细菌群落的季节变化 | 第27-54页 |
| 1 九段沙湿地植物群落的基本特征 | 第27-30页 |
| 2 材料方法 | 第30-37页 |
| ·样品的采集 | 第30-31页 |
| ·实验仪器和设备 | 第31页 |
| ·总DNA的抽提 | 第31-33页 |
| ·PCR扩增 | 第33页 |
| ·DGGE电泳分析 | 第33-34页 |
| ·回收DNA的扩增、纯化和克隆 | 第34-36页 |
| ·阳性克隆的检验 | 第36-37页 |
| ·测序和数据分析 | 第37页 |
| 3 实验结果 | 第37-49页 |
| ·三种植物根围土样总DNA | 第37-38页 |
| ·根围细菌DNA的PCR扩增8f(GC-clamp)和534r | 第38-39页 |
| ·三种植物根围土壤样品PCR扩增产物的DGGE电泳分析 | 第39-42页 |
| ·阳性克隆的检验 | 第42-44页 |
| ·三种植物根围细菌群落的系统发育分析 | 第44-49页 |
| 4 讨论 | 第49-54页 |
| ·植物根围细菌群落的差异 | 第49-51页 |
| ·利用分子手段研究微生物群落的一些局限 | 第51-54页 |
| 第三章 九段沙植被演替与根围细菌群落多样性的关系 | 第54-72页 |
| 1 材料方法 | 第54-58页 |
| ·样品的采集 | 第54-55页 |
| ·总DNA的提取 | 第55页 |
| ·样品16S rDNA的PCR扩增以及纯化 | 第55-56页 |
| ·PCR扩增产物的克隆、测序 | 第56-57页 |
| ·数据分析 | 第57-58页 |
| ·核酸序列在GenBank数据库的登录号 | 第58页 |
| 2 实验结果 | 第58-68页 |
| ·三种植物根围不同类群细菌的相对多度 | 第58-59页 |
| ·三种植物根围细菌的系统发育分析 | 第59-65页 |
| ·均匀度 | 第65页 |
| ·Chao 1分析 | 第65-68页 |
| 3 讨论 | 第68-72页 |
| ·不同植物根围细菌群落OTUs丰度及分布 | 第68-69页 |
| ·根围细菌群落的系统发育多样性 | 第69-72页 |
| 第四章 三种植物根围硫酸盐还原菌以及亚硝化细菌组成及变化 | 第72-90页 |
| 1 材料方法 | 第73-75页 |
| ·样品的采集 | 第73页 |
| ·总DNA的提取 | 第73页 |
| ·PCR扩增 | 第73-74页 |
| ·DGGE电泳分析 | 第74-75页 |
| ·回收DNA的扩增和克隆测序 | 第75页 |
| 2 实验结果 | 第75-86页 |
| ·三种植物根围土壤样品的DGGE电泳分析 | 第75-80页 |
| ·三种植物根围细菌的系统发育分析 | 第80-86页 |
| 3 讨论 | 第86-90页 |
| 第五章 小结与展望 | 第90-94页 |
| 1 小结 | 第90-92页 |
| 2 展望 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-109页 |
| 在读期间完成的论文 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
