| 提要 | 第1-7页 |
| 第1章 绪 论 | 第7-15页 |
| ·生物信息学简介 | 第7-8页 |
| ·蛋白质组学 | 第8-9页 |
| ·蛋白质三级结构比对概述 | 第9-15页 |
| ·蛋白质结构以及分类 | 第10-12页 |
| ·蛋白质三级结构比对原理概述 | 第12-14页 |
| ·研究蛋白质结构比对的意义 | 第14-15页 |
| 第2章 蛋白质三级结构比对 | 第15-20页 |
| ·蛋白质两两结构比对 | 第15-18页 |
| ·蛋白质结构比对算法的评价标准 | 第15-16页 |
| ·基于动态规划算法的蛋白质两两结构比对 | 第16-17页 |
| ·基于几何哈希法的蛋白质两两结构比对 | 第17-18页 |
| ·基于层次算法的蛋白质两两结构比对 | 第18页 |
| ·蛋白质多重结构比对 | 第18-19页 |
| ·本文主要工作 | 第19-20页 |
| 第3章 基于距离矩阵蛋白质结构比对 | 第20-34页 |
| ·数据提取 | 第20-22页 |
| ·PDB数据库 | 第20-21页 |
| ·距离矩阵 | 第21-22页 |
| ·打分函数 | 第22-23页 |
| ·动态规划算法 | 第23-26页 |
| ·最优化原理 | 第23-24页 |
| ·算法思想 | 第24页 |
| ·问题求解模式 | 第24-25页 |
| ·算法实现 | 第25页 |
| ·最长公共子序列问题 | 第25-26页 |
| ·MatAlign蛋白质结构比对算法 | 第26-33页 |
| ·计算初始比对 | 第27-29页 |
| ·对初始比对进行迭代求精 | 第29-31页 |
| ·时间复杂度分析 | 第31页 |
| ·实验结果分析 | 第31-33页 |
| ·本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 排序距离矩阵蛋白质结构比对 | 第34-44页 |
| ·引言 | 第34页 |
| ·SortMatAlign蛋白质结构比对算法 | 第34-36页 |
| ·快速排序预处理距离矩阵 | 第34-35页 |
| ·时间复杂度分析 | 第35-36页 |
| ·实验结果分析 | 第36-37页 |
| ·生物相关性分析 | 第37-40页 |
| ·SCOP数据库 | 第37-39页 |
| ·查询实验结果分析 | 第39-40页 |
| ·SortMatAlign在蛋白质结构分类上的应用 | 第40-42页 |
| ·结构分类问题 | 第40-41页 |
| ·用SortMatAlign建立结构分类器 | 第41页 |
| ·分类结果分析 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 第5章 总结与展望 | 第44-45页 |
| ·总结 | 第44页 |
| ·展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 摘要 | 第50-52页 |
| ABSTRACT | 第52-53页 |