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N-末端乙酰转移酶NatB复合体的结构及催化机制研究

摘要第10-11页
Abstract第11页
第一章 前言第12-26页
    1.1 N-末端乙酰化第12-13页
    1.2 N-末端乙酰转移酶的分类第13-14页
    1.3 N-末端乙酰化的功能研究第14-17页
        1.3.1 N-末端乙酰化与蛋白的稳定性、折叠和降解第14-15页
        1.3.2 N-末端乙酰化与蛋白的亚细胞定位第15-16页
        1.3.3 N-末端乙酰化与蛋白的相互作用和复合物的形成第16页
        1.3.4 N-末端乙酰转移酶与生长发育、代谢和疾病第16-17页
        1.3.5 N-末端乙酰转移酶与癌症第17页
    1.4 N-末端乙酰转移酶的结构生物学研究进展第17-21页
    1.5 N-末端乙酰转移酶NatB的研究进展第21-24页
        1.5.1 酵母的N-末端乙酰转移酶NatB第22-23页
        1.5.2 人和植物的N-末端乙酰转移酶NatB第23-24页
    1.6 本论文的研究内容及意义第24-26页
第二章 材料与方法第26-49页
    2.1 材料第26-32页
        2.1.1 基因和引物第26页
        2.1.2 载体第26-28页
        2.1.3 菌株第28页
        2.1.4 实验主要酶和试剂第28-30页
        2.1.5 实验仪器第30-32页
        2.1.6 人工合成的多肽第32页
    2.2 方法第32-49页
        2.2.1 基因克隆第32-35页
        2.2.2 质粒的构建第35-37页
        2.2.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第37-38页
        2.2.4 电泳相关实验方法第38-40页
        2.2.5 重组蛋白的表达第40-41页
        2.2.6 重组蛋白的纯化第41-44页
        2.2.7 蛋白质晶体生长及收集第44-46页
        2.2.8 蛋白-蛋白相互作用的检测第46-47页
        2.2.9 蛋白免疫印迹第47-48页
        2.2.10 N-末端乙酰转移酶活性测定第48-49页
第三章 N-末端乙酰转移酶NatB的结构解析和活性研究第49-90页
    3.1 基因的克隆和载体的构建第49-50页
    3.2 重组蛋白的表达与纯化第50-54页
        3.2.1 重组蛋白的表达第50-51页
        3.2.2 重组蛋白的纯化第51-54页
    3.3 NatB复合物的晶体筛选、优化和衍射第54-56页
    3.4 筛选新的NatB复合物截取体第56-61页
        3.4.1 新的NatB截取体复合物表达质粒的构建第56-57页
        3.4.2 新的NatB截取体复合物的表达和纯化第57-59页
        3.4.3 新的NatB截取体晶体的筛选和衍射数据收集第59-61页
    3.5 获取硒代甲硫氨酸NatB复合物晶体第61-63页
        3.5.1 硒代甲硫氨酸NatB复合物的表达和纯化第61-63页
        3.5.2 硒代甲硫氨酸NatB复合物的结晶第63页
    3.6 NatB与底物多肽复合物的晶体筛选与衍射第63-65页
        3.6.1 NatB与十九肽底物复合物的晶体第64页
        3.6.2 NatB与双底物抑制剂复合物的晶体第64-65页
    3.7 衍射数据的收集与处理第65-66页
    3.8 NatB复合物晶体结构模型质量分析第66-70页
        3.8.1 电子密度的吻合情况第66-69页
        3.8.2 NatB复合物的立体化学分析第69-70页
        3.8.3 NatB复合物的温度因子分布第70页
    3.9 NatB复合物的整体结构研究第70-87页
        3.9.1 NatB复合物的整体结构第71-72页
        3.9.2 辅助亚基与催化亚基之间的相互作用第72-75页
        3.9.3 NatB复合物的亚基结构第75-77页
        3.9.4 与其他N-末端乙酰转移酶的结构比较第77-78页
        3.9.5 催化亚基Naa20和辅酶A的结合第78-81页
        3.9.6 NatB复合物底物的特异性识别和结合第81-82页
        3.9.7 NatB复合物的点突变和体外乙酰化反应第82-86页
        3.9.8 NatB复合物的可能催化机制第86-87页
    3.10 小结第87-90页
第四章 非复合物状态下NatB的亚基结构解析第90-95页
    4.1 催化亚基Naa20的表达和纯化第90页
    4.2 辅助亚基Naa25的表达和纯化第90-94页
        4.2.1 辅助亚基Naa25的晶体筛选和结构解析第92-94页
        4.2.2 复合体状态与非复合体状态的Naa25的结构比较第94页
    4.3 小结第94-95页
第五章 结果与讨论第95-97页
附录1 图表索引第97-99页
附录2 缩略语及中英文对照第99-100页
参考文献第100-112页
致谢第112页

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