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约克夏猪卵巢黄体期到卵泡期转变的关键miRNA的筛选与功能分析

致谢第6-7页
摘要第7-8页
ABSTRACT第8-9页
英文缩略词表第14-15页
文献综述第15-19页
    1.猪卵巢生殖调控第15-16页
        1.1 猪卵巢与发情周期第15页
        1.2 卵泡的发育与闭锁第15-16页
        1.3 颗粒细胞与卵泡第16页
    2 miRNA与卵巢功能调控第16-18页
        2.1 卵巢中miRNA的表达研究第16-17页
        2.2 miRNA参与颗粒细胞凋亡及卵泡闭锁调控第17-18页
    3 本研究的目的意义第18-19页
引言第19-20页
1.材料与方法第20-26页
    1.1 试验材料第20-21页
        1.1.1 试验动物与样品采集第20页
        1.1.2 主要仪器、试剂和软件第20-21页
    1.2 试验方法与流程第21-26页
        1.2.1 总RNA提取第21-22页
        1.2.2 卵巢miRNA测序文库的构建和高通量测序第22-23页
        1.2.3 测序原始数据处理第23页
        1.2.4 miRNA表达和差异分析第23页
        1.2.5 miRNA进化分析与家族分析第23-24页
        1.2.6 差异miRNA的靶基因预测第24页
        1.2.7 差异miRNA靶基因的GO富集和KEGG通路分析第24页
        1.2.8 miRNA-靶基因调控网络图第24页
        1.2.9 miRNA测序结果的qRT-PCR验证第24-26页
        1.2.10 卵泡分类与颗粒细胞的分离第26页
2.结果与分析第26-38页
    2.1 总RNA质量检测第26-27页
    2.2 测序数据概述第27-29页
    2.3 序列长度分布第29页
    2.4 小RNA分类注释第29-30页
    2.5 猪卵巢黄体期和卵泡期miRNA差异表达第30-31页
    2.6 测序结果中新miRNA的预测第31-32页
    2.7 miRNA在不同物种上的分布第32-33页
    2.8 miRNA家族分析第33页
    2.9 差异miRNA的靶基因预测第33页
    2.10 miRNA靶基因的GO富集分析第33-34页
    2.11 miRNA靶基因的KEGG富集分析第34-35页
    2.12 miRNA-靶基因-通路调控网络构建第35-36页
    2.13 miRNA测序结果的qRT-PCR验证第36-37页
    2.14 miR-214在猪发情不同天数卵巢及颗粒细胞中的表达规律第37-38页
3.讨论第38-43页
    3.1 猪卵巢卵泡期到黄体期差异miRNA的筛选第38-39页
    3.2 与卵泡发育相关的KEGG信号通路第39-41页
        3.2.1 PI3K/AKT信号通路第39-40页
        3.2.2 mTOR信号通路第40页
        3.2.3 MAPK信号通路第40页
        3.2.4 cAMP信号通路第40页
        3.2.5 Hippo信号通路第40-41页
    3.3 miRNA-靶基因-通路调控网络分析第41页
    3.4 miR-214对猪发情周期的调控第41-43页
4.结论第43-44页
参考文献第44-53页
附录A 猪卵巢卵泡期和黄体期差异表达的miRNAs第53-56页
附录B 60个差异显著的KEGG通路第56-58页
作者简介第58页

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