致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
英文缩略词表 | 第14-15页 |
文献综述 | 第15-19页 |
1.猪卵巢生殖调控 | 第15-16页 |
1.1 猪卵巢与发情周期 | 第15页 |
1.2 卵泡的发育与闭锁 | 第15-16页 |
1.3 颗粒细胞与卵泡 | 第16页 |
2 miRNA与卵巢功能调控 | 第16-18页 |
2.1 卵巢中miRNA的表达研究 | 第16-17页 |
2.2 miRNA参与颗粒细胞凋亡及卵泡闭锁调控 | 第17-18页 |
3 本研究的目的意义 | 第18-19页 |
引言 | 第19-20页 |
1.材料与方法 | 第20-26页 |
1.1 试验材料 | 第20-21页 |
1.1.1 试验动物与样品采集 | 第20页 |
1.1.2 主要仪器、试剂和软件 | 第20-21页 |
1.2 试验方法与流程 | 第21-26页 |
1.2.1 总RNA提取 | 第21-22页 |
1.2.2 卵巢miRNA测序文库的构建和高通量测序 | 第22-23页 |
1.2.3 测序原始数据处理 | 第23页 |
1.2.4 miRNA表达和差异分析 | 第23页 |
1.2.5 miRNA进化分析与家族分析 | 第23-24页 |
1.2.6 差异miRNA的靶基因预测 | 第24页 |
1.2.7 差异miRNA靶基因的GO富集和KEGG通路分析 | 第24页 |
1.2.8 miRNA-靶基因调控网络图 | 第24页 |
1.2.9 miRNA测序结果的qRT-PCR验证 | 第24-26页 |
1.2.10 卵泡分类与颗粒细胞的分离 | 第26页 |
2.结果与分析 | 第26-38页 |
2.1 总RNA质量检测 | 第26-27页 |
2.2 测序数据概述 | 第27-29页 |
2.3 序列长度分布 | 第29页 |
2.4 小RNA分类注释 | 第29-30页 |
2.5 猪卵巢黄体期和卵泡期miRNA差异表达 | 第30-31页 |
2.6 测序结果中新miRNA的预测 | 第31-32页 |
2.7 miRNA在不同物种上的分布 | 第32-33页 |
2.8 miRNA家族分析 | 第33页 |
2.9 差异miRNA的靶基因预测 | 第33页 |
2.10 miRNA靶基因的GO富集分析 | 第33-34页 |
2.11 miRNA靶基因的KEGG富集分析 | 第34-35页 |
2.12 miRNA-靶基因-通路调控网络构建 | 第35-36页 |
2.13 miRNA测序结果的qRT-PCR验证 | 第36-37页 |
2.14 miR-214在猪发情不同天数卵巢及颗粒细胞中的表达规律 | 第37-38页 |
3.讨论 | 第38-43页 |
3.1 猪卵巢卵泡期到黄体期差异miRNA的筛选 | 第38-39页 |
3.2 与卵泡发育相关的KEGG信号通路 | 第39-41页 |
3.2.1 PI3K/AKT信号通路 | 第39-40页 |
3.2.2 mTOR信号通路 | 第40页 |
3.2.3 MAPK信号通路 | 第40页 |
3.2.4 cAMP信号通路 | 第40页 |
3.2.5 Hippo信号通路 | 第40-41页 |
3.3 miRNA-靶基因-通路调控网络分析 | 第41页 |
3.4 miR-214对猪发情周期的调控 | 第41-43页 |
4.结论 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-53页 |
附录A 猪卵巢卵泡期和黄体期差异表达的miRNAs | 第53-56页 |
附录B 60个差异显著的KEGG通路 | 第56-58页 |
作者简介 | 第58页 |