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山羊卵泡期与黄体期“下丘脑—垂体—卵巢”miRNA分析及靶基因验证

致谢第6-7页
摘要第7-8页
Abstract第8-9页
英文缩略词表第14-15页
文章综述第15-24页
    1.“下丘脑-垂体-卵巢轴”研究第15-18页
        1.1“下丘脑-垂体-卵巢轴”组成与功能第15-16页
        1.2“下丘脑-垂体-卵巢轴”负反馈调控机制研究第16-17页
        1.3 动物发情周期过程“下丘脑-垂体-性腺轴”研究第17-18页
    2 TGF-β 家族在卵泡发育中的研究进展第18-19页
        2.1 TGF-β 家族简介第18页
        2.2 TGF-β 家族与卵泡发育第18-19页
    3“下丘脑-垂体-卵巢轴”中与繁殖相关miRNAs研究第19-24页
        3.1 miRNAs的起源与作用机制研究第19-20页
        3.2 miRNA与下丘脑-垂体研究第20-21页
        3.3 miRNA与动物卵巢的研究第21-24页
引言第24-25页
1 材料与方法第25-38页
    1.1 试验材料第25-26页
        1.1.1 试验动物及材料第25页
        1.1.2 主要仪器设备第25页
        1.1.3 主要试剂药品第25-26页
    1.2 试验方法与流程第26-38页
        1.2.1 卵泡期黄体期HPO差异表达miRNA分析第26-29页
            1.2.1.1 样本采集第26页
            1.2.1.2 总RNA提取第26页
            1.2.1.3 总RNA质量分析第26页
            1.2.1.4 测序文库的构建和测序分析第26页
            1.2.1.5 原始数据的过滤第26页
            1.2.1.6 Small RNA文库的分类注释第26-27页
            1.2.1.7 未知miRNA的预测第27页
            1.2.1.8 已知miRNA与未知miRNA的差异分析第27页
            1.2.1.9 表达模式聚类分析及其靶基因的预测第27页
            1.2.1.10 GO富集分析和KEGG通路分析miRNA的靶基因第27-28页
            1.2.1.11 定量验证高通量测序结果第28-29页
        1.2.2 山羊卵巢颗粒细胞的分离与鉴定第29页
            1.2.2.1 安淮山羊卵巢颗粒细胞分离第29页
            1.2.2.2 安淮山羊颗粒细胞的鉴定第29页
        1.2.3 验证chi-miR-144-3p靶向作用Follistian的试验第29-31页
            1.2.3.1 载体的构建第29-31页
        1.2.4 Follistian过表达与干扰载体的构建第31-35页
            1.2.4.1 载体构建FST基因CDS的扩增第31-32页
            1.2.4.2 PCR产物纯化第32页
            1.2.4.3 平末端克隆第32页
            1.2.4.5 p Topo-Blunt Simple载体与p LVX-IRES-Neo的双酶切第32-33页
            1.2.4.6 重组载体的构建第33-34页
            1.2.4.7 sh RNA2片段的设计与引物合成第34页
            1.2.4.8 引物退火第34-35页
            1.2.4.9 酶连及重组载体转化第35页
        1.2.5 慢病毒的包装以及感染卵巢颗粒细胞效果的验证第35-38页
            1.2.5.1 HEK-293T细胞的培养、转染以及病毒浓缩第35-36页
            1.2.5.2 病毒感染原代卵巢颗粒细胞效果的观察第36-38页
2 结果与分析第38-54页
    2.1 电泳检测总RNA质量第38页
    2.2 文库RNA的质量分析第38页
    2.3 小RNA文库片段长短分布第38-39页
    2.4 公共及特有序列第39-40页
    2.5 sRNA比对山羊基因组第40页
    2.6 sRNA的分类注释第40-41页
    2.7 已知miRNA比对和新miRNA预测第41-42页
    2.8 已知miRNA和新miRNA的差异分析第42-45页
    2.9 已知miRNAs的表达模式的聚类分析第45-46页
    2.10 差异表达miRNA靶基因的GO分析第46-48页
    2.11 差异表达miRNA靶基因的KEGG分析第48页
    2.12 定量验证测序结果的趋势第48-49页
    2.13 山羊卵巢颗粒细胞的分离验证第49-50页
    2.14 验证卵巢卵泡期黄体期差异表达chi-miR1443p与FST靶向作用第50-51页
    2.15 过表达载体的构建第51页
    2.16 shRNA载体的构建第51-52页
    2.17 感染原代卵巢颗粒细胞效果鉴定第52-53页
    2.18 定量验证过表达与干扰效率第53-54页
3. 讨论第54-57页
    3.1 山羊繁殖性状相关的miRNA挖掘第54页
    3.2 高通测序数据生物信息学分析第54-55页
    3.3 山羊卵巢颗粒细胞分离与鉴定第55页
    3.4 山羊目标miRNAs靶基因的验证第55-56页
    3.5 FST表达与干扰病毒载体构建与慢病毒的包装第56-57页
4. 结论第57-58页
参考文献第58-67页
作者简介第67页

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