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日本七鳃鳗非受体酪氨酸激酶BTK的全长cDNA克隆和生物信息学分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
引言第10-12页
1 酪氨酸激酶BTK 的研究进展第12-20页
   ·BTK 的染色体定位、基因结构和分布第12-13页
   ·参与多种信号通路第13-17页
     ·参与B 细胞介导的信号通路第13-15页
     ·BTK 参与Toll 样受体介导的信号通路第15-16页
     ·BTK 参与肥大细胞脱颗粒第16-17页
   ·其他的BTK 参与信号通路第17-18页
   ·性联无丙种球蛋白血症(XLA)的临床表现第18页
   ·小结第18-20页
2 日本七鳃鳗非受体酪氨酸激酶的BTK 基因克隆第20-33页
   ·材料和方法第20-27页
     ·材料第20页
     ·日本七鳃鳗白细胞总RNA 的提取第20-22页
     ·已知序列验证第22页
     ·cDNA3′末端快速扩增反应(3′ RACE)第22-24页
     ·cDNA5′末端快速扩增反应(5′RACE)第24-25页
     ·序列拼接、BLAST 搜索和最终验证第25页
     ·CDS 区克隆第25-27页
   ·结果第27-30页
     ·日本七鳃鳗白细胞的总RNA 提取第27-28页
     ·cDNA3′末端快速扩增反应(3′ RACE)实验结果第28-29页
     ·cDNA5′末端快速扩增反应(5′RACE)实验结果第29页
     ·克隆结果第29页
     ·PCR 扩增目的基因CDS 区电泳结果第29-30页
     ·载体处理后电泳结果(图2-5)第30页
   ·讨论第30-31页
     ·基本的局部联配搜索工具BLAST 的使用第30-31页
     ·RACE 实验中的遇到的实际问题和解决方法第31页
   ·结论第31-33页
3 日本七鳃鳗BTK 基因生物信息学分析第33-45页
   ·材料和方法第33-34页
     ·收集其他物种的BTK 氨基酸序列第33页
     ·功能结构域预测第33页
     ·一级结构比对第33页
     ·高级结构的预测和分析第33页
     ·保守基序(Motif)分析第33页
     ·氨基酸序列跨膜结构域预测第33-34页
     ·信号肽结构预测第34页
     ·分子系统发育分析第34页
     ·氨基酸序列理化性质分析第34页
   ·结果第34-43页
     ·功能结构域预测结果第34页
     ·一级结构比对第34-37页
     ·高级结构预测结果第37-40页
     ·保守基序分析结果第40-41页
     ·氨基酸序列跨膜结构域预测第41页
     ·氨基酸序列信号肽结构预测第41页
     ·分子系统发育分析第41-42页
     ·理化性质分析结果第42-43页
   ·讨论第43-44页
     ·BTK 基因保守基序的进化第43-44页
     ·BTK 的系统发育关系第44页
   ·结论第44-45页
4 全文总结第45-47页
   ·结构分析第45页
   ·保守基序分析第45页
   ·构建系统发育树第45-47页
参考文献第47-51页
附录A 已知序列第51-52页
附录B 日本七鳃鳗BTK 基因mRNA 全长第52-54页
附录C 日本七鳃鳗BTK 基因CDS 区序列第54-56页
附录D 日本七鳃鳗BTK 基因CDS 区翻译后的氨基酸序列第56-57页
附录E 不同物种的BTK 基因的FASTA 格式氨基酸序列第57-62页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第62-63页
致谢第63页

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