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生物地理学优化算法及其在生物序列模式发现中的应用

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-9页
缩略语表第16-18页
第一章 绪论第18-38页
    1.1 研究工作的背景与意义第18-19页
    1.2 序列模式发现问题的国内外研究历史与现状第19-35页
        1.2.1 序列模式表示第19-23页
        1.2.2 序列模式发现常用技术第23页
        1.2.3 序列模式发现的步骤第23-34页
        1.2.4 序列模式发现存在的问题第34-35页
    1.3 本文的主要工作与创新第35-36页
    1.4 本论文的结构安排第36-38页
第二章 进化算法第38-47页
    2.1 遗传算法第38-39页
    2.2 差分进化算法第39-41页
    2.3 蚁群算法第41-43页
        2.3.1 蚂蚁系统中的转移概率准则第41-42页
        2.3.2 蚂蚁系统中的局部调整准则第42页
        2.3.3 蚂蚁系统中的全局调整准则第42-43页
    2.4 粒子群算法第43-45页
    2.5 细菌觅食算法第45-46页
    2.6 文化算法第46页
    2.7 本章小结第46-47页
第三章 生物地理学优化算法第47-61页
    3.1 生物地理学优化算法第47-51页
    3.2 生物地理学优化算法研究进展第51-60页
        3.2.1 理论研究领域第51-54页
        3.2.2 算子改进策略第54-56页
        3.2.3 应用研究领域第56-60页
    3.3 本章小结第60-61页
第四章 生物地理学优化算法求解序列模式发现问题第61-83页
    4.1 引言第61-62页
    4.2 BBO算法第62-66页
    4.3 BBO算法的模式与框架第66-70页
    4.4 序列模式发现问题的BBO算法第70-76页
        4.4.1 序列模式发现问题第70页
        4.4.2 序列模式发现问题的目标函数第70-72页
        4.4.3 序列模式发现问题初始种群的选择第72-74页
        4.4.4 序列模式发现问题的迁移操作第74页
        4.4.5 序列模式发现问题的变异操作第74-75页
        4.4.6 序列模式发现问题的MDBBO算法第75-76页
    4.5 实验结果和讨论第76-80页
    4.6 本章小结第80-83页
第五章 一种增强算子的生物地理学优化算法第83-105页
    5.1 引言第83-84页
    5.2 准备知识第84-88页
        5.2.1 问题定义第84-86页
        5.2.2 差分进化第86页
        5.2.3 生物地理学优化算法第86-88页
    5.3 BBO/DE/GEN算法第88-96页
        5.3.1 BBO/DE/GEN算法的迁移算子第88-89页
        5.3.2 BBO/DE/GEN算法的变异算子第89页
        5.3.3 BBO/DE/GEN算法步骤第89-90页
        5.3.4 基准数据实验结果与讨论第90-96页
    5.4 序列模式发现问题实验结果与讨论第96-103页
        5.4.1 序列模式发现问题的BBO/DE/GEN算法第97-98页
        5.4.2 实验结果与讨论第98-103页
    5.5 本章小结第103-105页
第六章 一种自适应参数的生物地理学优化算法第105-115页
    6.1 引言第105页
    6.2 ABBO/DE/GEN算法第105-110页
        6.2.1 ABBO/DE/GEN算法的变异算子第106页
        6.2.2 ABBO/DE/GEN算法的迁移算子第106页
        6.2.3 自适应的BBO算法第106-107页
        6.2.4 ABBO/DE/GEN算法步骤第107页
        6.2.5 基准数据实验结果与讨论第107-110页
    6.3 序列模式发现问题实验结果与讨论第110-113页
        6.3.1 序列模式发现问题的ABBO/DE/GEN算法第111-112页
        6.3.2 实验结果与讨论第112-113页
    6.4 本章小结第113-115页
第七章 全文总结与展望第115-117页
    7.1 全文总结第115-116页
    7.2 后续工作展望第116-117页
致谢第117-118页
参考文献第118-127页
攻读博士学位期间取得的成果第127-129页

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