| 符号说明 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第13-32页 |
| 1.1 多粘类芽孢杆菌概述 | 第13-14页 |
| 1.2 多粘类芽孢杆菌对植物的促生作用 | 第14-20页 |
| 1.2.1 多粘类芽孢杆菌生防机制 | 第14-19页 |
| 1.2.1.1 抗菌活性物质 | 第15页 |
| 1.2.1.2 抗菌蛋白类 | 第15页 |
| 1.2.1.3 抗生素类 | 第15-19页 |
| 1.2.2 多粘类芽孢杆菌与病原菌竞争作用 | 第19页 |
| 1.2.3 多粘类芽孢杆菌诱导植物抗性 | 第19-20页 |
| 1.3 AraC/XylS家族调节蛋白 | 第20-22页 |
| 1.4 MsmR转录激活因子 | 第22-24页 |
| 1.5 转录组技术 | 第24-29页 |
| 1.5.1 目前研究转录组的方法 | 第25-26页 |
| 1.5.2 RNA-Seq的主要用途 | 第26-27页 |
| 1.5.2.1 表达谱测序 | 第26页 |
| 1.5.2.2 SmallRNA测序 | 第26-27页 |
| 1.5.2.3 LncRNA测序 | 第27页 |
| 1.5.3 转录组测序基本流程 | 第27-29页 |
| 1.6 多粘类芽孢杆菌基因组学研究进展 | 第29-30页 |
| 1.7 立题依据、研究内容及技术路线 | 第30-32页 |
| 1.7.1 立题依据 | 第30-31页 |
| 1.7.2 研究内容 | 第31页 |
| 1.7.3 技术路线 | 第31-32页 |
| 2 材料和方法 | 第32-41页 |
| 2.1 材料 | 第32-34页 |
| 2.1.1 菌株及质粒 | 第32页 |
| 2.1.2 培养基 | 第32页 |
| 2.1.3 酶和生化试剂 | 第32-33页 |
| 2.1.4 常用溶液及缓冲液 | 第33-34页 |
| 2.2 方法 | 第34-41页 |
| 2.2.1 多粘类芽孢杆菌SC2-M1基因组的提取 | 第34页 |
| 2.2.2 PCR扩增特异性引物设计 | 第34-35页 |
| 2.2.3 PCR扩增目的片段 | 第35页 |
| 2.2.4 酶切以及连接反应 | 第35-36页 |
| 2.2.5 连接产物的转化及鉴定 | 第36-37页 |
| 2.2.6 质粒提取 | 第37页 |
| 2.2.7 大肠杆菌SCS110感受态细胞的制备 | 第37页 |
| 2.2.8 质粒DNA去甲基化 | 第37页 |
| 2.2.9 质粒电转化 | 第37-38页 |
| 2.2.10 msmR1重组菌株的筛选 | 第38页 |
| 2.2.11 msmR1重组菌株原位回补 | 第38页 |
| 2.2.12 生长曲线测定 | 第38页 |
| 2.2.13 碳源利用能力测定 | 第38-39页 |
| 2.2.14 抑菌活性测定 | 第39页 |
| 2.2.15 RNA提取 | 第39-40页 |
| 2.2.16 实时荧光定量PCR | 第40页 |
| 2.2.17 转录组测序分析 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-66页 |
| 3.1 多粘类芽孢杆菌SC2-M1菌株msmR1基因敲除 | 第41-43页 |
| 3.2 重组菌株msmR1的原位回补 | 第43-44页 |
| 3.3 SC2-M1、msmR1重组菌株及回补菌株生长曲线 | 第44-45页 |
| 3.4 SC2-M1、msmR1重组菌株及回补菌株抑菌性能 | 第45页 |
| 3.5 SC2-M1、msmR1重组菌株碳源利用 | 第45-46页 |
| 3.6 SC2-M1、msmR1重组菌株抑菌活性和pmxE转录表达动态 | 第46-48页 |
| 3.7 转录组分析 | 第48-66页 |
| 3.7.1 测序数据质量统计 | 第48-50页 |
| 3.7.2 样品相关性检测 | 第50-52页 |
| 3.7.3 SC2-M1、msmR1重组菌株差显基因分析 | 第52-66页 |
| 4 讨论 | 第66-68页 |
| 5 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 攻读学位期间发表的论文及成果 | 第77页 |
