| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略词表（Abbreviation） | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第12页 |
| 1.2 文献综述 | 第12-20页 |
| 1.2.1 基因间长链非编码RNA（lincRNA）及其特征 | 第12-14页 |
| 1.2.2 lincRNA的功能研究 | 第14-17页 |
| 1.2.3 部分lincRNA编码微肽 | 第17-19页 |
| 1.2.4 RPL41研究进展 | 第19-20页 |
| 1.3 研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 2 材料和方法 | 第21-45页 |
| 2.1 材料 | 第21-25页 |
| 2.1.1 数据与试验样品 | 第21页 |
| 2.1.2 引物及真核表达载体 | 第21-23页 |
| 2.1.3 主要试剂与抗体 | 第23页 |
| 2.1.4 主要仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.1.5 生物学数据库与相关网站 | 第24页 |
| 2.1.6 生物信息分析软件 | 第24-25页 |
| 2.2 方法 | 第25-45页 |
| 2.2.1 技术路线 | 第25页 |
| 2.2.2 引物设计 | 第25-31页 |
| 2.2.3 RNA提取及质量检测 | 第31-32页 |
| 2.2.4 RT-PCR验证新鉴定的lincRNA | 第32-33页 |
| 2.2.5 3’RACE确定新鉴定lincRNA的末端 | 第33-36页 |
| 2.2.6 RPL41(G14)物种间多序列比对 | 第36页 |
| 2.2.7 RPL41(G14)第3个内含子的确定 | 第36页 |
| 2.2.8 重组质粒的构建 | 第36-39页 |
| 2.2.9 重组质粒转染细胞 | 第39-43页 |
| 2.2.10 相对荧光定量PCR检测 | 第43-45页 |
| 3 结果 | 第45-59页 |
| 3.1 猪多个组织lincRNA的高通量鉴定及基本特征分析 | 第45-48页 |
| 3.1.1 转录组数据筛选鉴定lincRNA | 第45页 |
| 3.1.2 lincRNA的基本特征 | 第45-48页 |
| 3.2 RT-PCR验证新鉴定的lincRNA | 第48页 |
| 3.3 3’RACE确定新鉴定lincRNA的末端 | 第48-50页 |
| 3.4 RPL41(G14)微肽基因的序列分析与功能研究 | 第50-54页 |
| 3.4.1 猪RPL41序列与其他物种多序列比对 | 第50-51页 |
| 3.4.2 真核表达载体pc DNA3.1-RPL41-EGFP重组质粒的构建 | 第51页 |
| 3.4.3 pcDNA3.1-RPL41-EGFP重组质粒的表达验证及siRNA干扰效果 | 第51-53页 |
| 3.4.4 RPL41对荧光素酶表达的影响 | 第53-54页 |
| 3.5 超表达及干扰RPL41后数据分析及初步实验验证 | 第54-59页 |
| 3.5.1 二代测序数据及差异表达基因的GO分析结果 | 第54-57页 |
| 3.5.2 Q-PCR验证部分差异表达基因在细胞内的表达 | 第57-59页 |
| 4 讨论 | 第59-63页 |
| 4.1 lincRNA的筛选及验证的相关讨论 | 第59页 |
| 4.2 部分lincRNA中存在s ORF且能编码微肽的相关讨论 | 第59-60页 |
| 4.3 利用双荧光素酶报告系统研究RPL41的作用 | 第60-61页 |
| 4.4 关于RPL41在基因转录过程中的作用的相关讨论 | 第61-63页 |
| 5 小结 | 第63-65页 |
| 5.1 本研究的主要结论 | 第63页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第63页 |
| 5.3 本研究的不足之处与进一步的工作展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 附录 | 第70-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
