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长非编码RNA-AK004418对成肌细胞增殖和分化的影响

摘要第8-9页
Abstract第9页
缩略词表第10-11页
第一章 文献综述第11-21页
    1 成肌细胞增殖和分化过程第11-13页
    2 长非编码RNA第13-19页
        2.1 长非编码RNA概述第13-14页
        2.2 lncRNA的功能研究第14-17页
            2.2.1 lncRNA对细胞增殖的影响第14-15页
            2.2.2 lncRNA对肌细胞分化的调控第15-16页
            2.2.3 lncRNAs与肌肉疾病第16-17页
        2.3 lncRNA的分子机制第17-18页
        2.4 lncRNA研究技术第18-19页
    3 本研究的目的和意义第19-21页
第二章 材料和方法第21-42页
    1 实验材料第21-26页
        1.1 实验样品第21页
            1.1.1 组织样品第21页
            1.1.2 细胞样品第21页
            1.1.3 克隆载体第21页
        1.2 主要仪器设备第21-22页
        1.3 主要试剂和试剂盒第22-23页
        1.4 常用试剂及其配制第23-24页
        1.5 表达谱芯片第24-25页
        1.6 主要数据库和软件第25页
        1.7 所用载体第25-26页
    2 试验方法第26-42页
        2.1 构建小鼠组织表达谱第26-28页
            2.1.1 小鼠组织样总RNA提取第26-27页
            2.1.2 RNA质量浓度检测第27页
            2.1.3 RNA反转录成cDNA第27-28页
        2.2 细胞培养第28-29页
            2.2.1 细胞的复苏第28页
            2.2.2 细胞的冻存第28-29页
            2.2.3 细胞的增殖培养第29页
            2.2.4 细胞的分化培养第29页
        2.3 AK004418-siRNA片段的选取第29-30页
        2.4 AK00418超表达载体构建第30-33页
            2.4.1 AK004418 cDNA的克隆第30-31页
            2.4.2 琼脂糖凝胶电泳和成像第31页
            2.4.3 PCR产物的胶回收和克隆测序第31-33页
            2.4.4 质粒提取第33页
            2.4.5 pcDNA3.1-AK004418真核表达载体的酶切鉴定第33页
        2.5 脂质体介导的细胞转染(6 孔板)第33-34页
        2.6 细胞RNA提取第34页
        2.7 Quantitative real-time PCR分析第34-37页
            2.7.1 cDNA的合成第34页
            2.7.2 PCR的引物设计第34-36页
            2.7.3 荧光实时定量PCR第36页
            2.7.4 定量数据分析第36-37页
        2.8 RACE扩增及序列检测第37-39页
            2.8.1 制备 5’/3’ RACE第一链第37页
            2.8.2 设计PCR扩增引物第37-38页
            2.8.3 快速扩增cDNA Ends第38-39页
            2.8.4 琼脂糖凝胶电泳和成像第39页
            2.8.5 PCR产物的胶回收和克隆测序第39页
        2.9 细胞核和细胞质的RNA分离第39页
        2.10 蛋白检测分析第39-41页
            2.10.1 蛋白的提取第39页
            2.10.2 蛋白质的检测第39-41页
        2.11 免疫荧光第41-42页
第三章 研究结果第42-59页
    1 AK004418与侧翼基因SYNPO2的基本特性第42-44页
        1.1 AK004418的 5’RACE和 3’RACE第42页
        1.2 软件预测AK004418的蛋白编码能力第42-43页
        1.3 AK004418与SYNPO2的组织表达谱第43页
        1.4 AK004418与SYNPO2在细胞分化不同时期的表达情况第43-44页
        1.5 AK004418的核质定位第44页
    2 干涉AK004418对SYNPO2基因的表达以及成肌细胞增殖和分化的影响第44-50页
        2.1 AK004418的干涉效率第44-45页
        2.2 干涉AK004418对SYNPO2基因表达的影响第45-46页
        2.3 干涉AK004418对成肌细胞增殖的影响第46-47页
        2.4 干涉AK004418对成肌细胞分化相关基因表达的影响第47-50页
    3 超表达AK004418对SYNPO2基因表达以及成肌细胞增殖和分化的影响第50-55页
        3.1 AK004418超表达载体的酶切鉴定及超表达效率检测第50页
        3.2 超表达AK004418对SYNPO2基因表达的影响第50-51页
        3.3 超表达AK004418对成肌细胞增殖的影响第51-52页
        3.4 超表达AK004418对成肌细胞分化相关基因表达的影响第52-55页
    4 利用microarray检测基因表达的变化情况并做相关分析第55-59页
        4.1 芯片结果统计及定量验证第55-57页
        4.2 GO分析第57-58页
        4.3 Pathway分析第58-59页
第四章 讨论第59-63页
    1 长非编码RNA AK004418功能分析第59-61页
    2 长非编码RNA AK004418调控机制的预测第61-62页
    3 下一步计划第62-63页
小结第63-64页
参考文献第64-73页
致谢第73-74页

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