| Acknowledgement | 第6-18页 |
| Abstract | 第18-23页 |
| 摘要 | 第24-28页 |
| CHAPTER 1 LITERATURE REVIEW | 第28-49页 |
| 1.1. THE ORIGIN CENTER AND SPREAD OF CITRUS | 第28-29页 |
| 1.2. THE DISTRIBUTION AND PREVIOUS RESEARCHES OF CTV | 第29-31页 |
| 1.3. THE HOST RANGE OF CTV | 第31-32页 |
| 1.4. SYMPTOMS INDUCED BY CTV | 第32-33页 |
| 1.4.1 Quick decline or tristeza disease | 第32页 |
| 1.4.2 Seedling yellows disease | 第32-33页 |
| 1.4.3 Stem-pitting disease | 第33页 |
| 1.5. THE TRANSMISSION APPROACH AND EPIDEMIOLOGY OF CTV | 第33-35页 |
| 1.6. CONTROL STRATEGIES FOR CTV | 第35-37页 |
| 1.7. CTV STRUCTURE, GENOME ORGANIZATION AND EXPRESSION | 第37-40页 |
| 1.8. DIAGNOSIS OF CTV | 第40-49页 |
| 1.8.1 Identification by Indicator Plants | 第41页 |
| 1.8.2 Inclusion Identification by Electron Microscopy | 第41-42页 |
| 1.8.3 Serological Identification | 第42-43页 |
| 1.8.4 Polypeptide Mapping Analysis of Capsid Protein | 第43页 |
| 1.8.5 Western Blot | 第43-44页 |
| 1.8.6 dsRNA Electrophoresis Analysis | 第44页 |
| 1.8.7 Northern Blot | 第44-45页 |
| 1.8.8 RT-PCR Based Assays | 第45页 |
| 1.8.9 RFLP Analysis | 第45-46页 |
| 1.8.10 Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) Analysis | 第46-47页 |
| 1.8.11 Sequence Analysis | 第47-49页 |
| CHAPTER 2 | 第49-59页 |
| 2.1 INTRODUCTION | 第49页 |
| 2.2 MATERIAL AND METHOD | 第49-53页 |
| 2.2.1 Plant samples | 第49-50页 |
| 2.2.2 Direct tissue blot immuno assay (DTBIA) | 第50页 |
| 2.2.3 Nucleic acid extraction methods | 第50-51页 |
| 2.2.4 Nucleic acid amplification by RT-PCR | 第51-53页 |
| 2.3 RESULTS | 第53-57页 |
| 2.3.1 Direct tissue blot immuno-assay | 第53-54页 |
| 2.3.2 Synthesis of p25 by RT-PCR | 第54-55页 |
| 2.3.3 Synthesis of cDNA of p18 | 第55-56页 |
| 2.3.4 Synthesis of cDNA of gene p20 | 第56-57页 |
| 2.4. DISCUSION | 第57-59页 |
| CHAPTER 3 VARIABILITY AND SEQUENCE DIVERSITY OF CITRUS TRISTEZA VIRUSISOLATES FROM PAKISTAN | 第59-87页 |
| 3.1 INTRODUCTION | 第59-61页 |
| 3.2 MATERIAL AND METHODS | 第61-64页 |
| 3.2.1 CTV isolates | 第61页 |
| 3.2.2 cDNA synthesis and PCR amplification of p25, p23,p20 and p18 | 第61页 |
| 3.2.3 Cloning of PCR products | 第61页 |
| 3.2.4 Nucleotide sequence and phylogenetic analysis | 第61-62页 |
| 3.2.5 Nucleotide sequence accession numbers | 第62-64页 |
| 3.3 RESULTS | 第64-84页 |
| 3.3.1 Cloning and sequencing of the CTV isolates | 第64页 |
| 3.3.2 Sequence identity analysis | 第64-72页 |
| 3.3.3 Phylogenetic relationships between the isolates | 第72-78页 |
| 3.3.4 Alignment of deduced amino acid sequences analysis | 第78-84页 |
| 3.4 DISCUSION | 第84-87页 |
| CHAPTER 4 CTV ISOLATES GROUP COMPOSITION ANALYSIS | 第87-93页 |
| 4.1 INTRODUCTION | 第87页 |
| 4.2 MATERIAL AND METHODS | 第87-89页 |
| 4.2.1 Nucleic acid extraction | 第88页 |
| 4.2.2 Nucleic acid amplification by RT-PCR | 第88页 |
| 4.2.3 RFLP ananlysis of p25 | 第88页 |
| 4.2.4 SSSCP analysis of p25 | 第88-89页 |
| 4.3 RESULTS | 第89-91页 |
| 4.3.1 Synthesis of p25 by RT-PCR | 第89页 |
| 4.3.2 RFLP profiles of the CP gene from different CTV isolates | 第89-90页 |
| 4.3.3 SSCP patterns of p25 of different CTV Isolates | 第90-91页 |
| 4.4 DISCUSION | 第91-93页 |
| CHAPTER 5 CHARACTERIZATION OF CTV ISOLATES BY BIOLOGICAL INDEXING | 第93-107页 |
| 5.1 INTRODUCTION | 第93-95页 |
| 5.2 MATERIAL AND METHODS | 第95-96页 |
| 5.2.1 Virus isolates | 第95页 |
| 5.2.2 Evaluation of tristeza symptomatology | 第95页 |
| 5.2.3 Biological indexing | 第95-96页 |
| 5.3 RESULTS | 第96-106页 |
| 5.3.1 Conformation through DTBIA | 第96-97页 |
| 5.3.2 Biological indexing | 第97-106页 |
| 5.4 DISCUSION | 第106-107页 |
| CHAPTER 6 PRELIMINARY IDENTIFICATION OF CITRUS VIROIDS IN PUNJAB, PAKISTAN | 第107-114页 |
| 6.1 INTRODUCTION | 第107-108页 |
| 6.2 MATERIAL AND METHODS | 第108-114页 |
| 6.2.1 Collection of samples | 第108页 |
| 6.2.2 Nucleic acid extraction | 第108页 |
| 6.2.3 Nucleic acid amplification by RT-PCR | 第108-109页 |
| 6.2.4 Evaluation of symptoms | 第109页 |
| 6.2.5 Cloning and sequencing | 第109-114页 |
| CHAPTER 7 MAIN CONCLUSION AND FUTUTRE RESEARCHES | 第114-119页 |
| 7.1 MAJOR CONCLUSION | 第114页 |
| 7.1.1 Collection of samples and conformation of CTV | 第114页 |
| 7.2 GROUP COMPOSITION ANALYSIS | 第114-115页 |
| 7.2.1 RFLP analysis | 第114-115页 |
| 7.3 GENETIC SEQUENCE ANALYSIS | 第115-116页 |
| 7.3.1 Sequence identify analysis | 第115页 |
| 7.3.2 Phylogenetic analysis | 第115-116页 |
| 7.3.3 Alignment of deduced amino acid sequences analysis | 第116页 |
| 7.4 BIOLOGICAL INDEXING | 第116-117页 |
| 7.5 THE INNOVATION OF THIS STUDY | 第117页 |
| 7.6 THIS STUDY CONFIRMS | 第117页 |
| 7.7 RECOMMENDED FURTHER RESEARCH | 第117-119页 |
| REFERENCES | 第119-149页 |
| 攻读期成果 | 第149-150页 |
| APPENDIX | 第150-212页 |
