| 英文缩略词表 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第1章 前言 | 第15-27页 |
| 1.1 抗生素耐药性 | 第15-18页 |
| 1.1.1 抗生素耐药性的产生与危害 | 第15-16页 |
| 1.1.2 耐药菌获得耐药基因的方式 | 第16-18页 |
| 1.2 水环境中耐药菌和耐药基因的来源与污染现状 | 第18-20页 |
| 1.2.1 地表水是耐药菌和耐药基因的巨大储存库 | 第18-19页 |
| 1.2.2 水产养殖场是耐药菌和耐药基因富集的重要场所 | 第19-20页 |
| 1.3 耐药菌及耐药基因在动物体内的定植和转移 | 第20-23页 |
| 1.3.1 耐药菌及耐药基因在动物体内的定植 | 第20-21页 |
| 1.3.2 耐药基因在动物体内的转移 | 第21-22页 |
| 1.3.3 耐药基因在动物肠道内的转移模型 | 第22-23页 |
| 1.4 耐药基因转移的检测方法 | 第23-24页 |
| 1.5 课题的提出 | 第24页 |
| 1.6 课题的研究内容,目的意义及创新点 | 第24-27页 |
| 1.6.1 研究内容 | 第24-25页 |
| 1.6.2 研究目的和意义 | 第25-26页 |
| 1.6.3 创新点 | 第26-27页 |
| 第2章 用于研究耐药基因水平转移的水生动物模型的建立 | 第27-50页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 材料和方法 | 第27-42页 |
| 2.2.1 质粒和菌株 | 第27-30页 |
| 2.2.2 主要实验材料和仪器设备 | 第30页 |
| 2.2.3 主要试剂、培养基和溶液 | 第30-34页 |
| 2.2.4 试剂盒 | 第34页 |
| 2.2.5 引物的设计 | 第34-35页 |
| 2.2.6 实验动物 | 第35页 |
| 2.2.7 实验方法 | 第35-42页 |
| 2.3 结果 | 第42-48页 |
| 2.3.1 供体菌K12CM:RP4的构建 | 第42-45页 |
| 2.3.2 斑马鱼的适应性饲养及粪便固有细菌耐药谱和RP4鉴定 | 第45-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-50页 |
| 第3章 耐药基因随斑马鱼粪便的体外排出规律研究 | 第50-67页 |
| 3.1 引言 | 第50-51页 |
| 3.2 材料和方法 | 第51-57页 |
| 3.2.1 质粒和菌株 | 第51页 |
| 3.2.2 主要实验材料和仪器设备 | 第51页 |
| 3.2.3 主要试剂、培养基和溶液 | 第51-53页 |
| 3.2.4 试剂盒和引物合成: | 第53页 |
| 3.2.5 实验动物分组 | 第53页 |
| 3.2.6 实验方法 | 第53-57页 |
| 3.2.7 数据统计和分析 | 第57页 |
| 3.3 结果 | 第57-65页 |
| 3.3.1 用于检测目的基因的QPCR方法的建立 | 第57-59页 |
| 3.3.2 粪便中耐药基因和可培养耐药菌随时间的排出变化规律 | 第59-65页 |
| 3.4 讨论 | 第65-67页 |
| 第4章 耐药菌和耐药基因在斑马鱼肠道内的时空分布规律 | 第67-81页 |
| 4.1 引言 | 第67页 |
| 4.2 材料和方法 | 第67-71页 |
| 4.2.1 质粒和菌株 | 第67-68页 |
| 4.2.2 主要实验材料和仪器设备 | 第68页 |
| 4.2.3 主要试剂、培养基和溶液 | 第68-69页 |
| 4.2.4 荧光探针的设计和合成 | 第69-70页 |
| 4.2.5 实验动物分组 | 第70页 |
| 4.2.6 实验方法 | 第70-71页 |
| 4.3 结果 | 第71-79页 |
| 4.3.1 不同时期不同肠段中耐药菌和耐药基因的检测 | 第71-76页 |
| 4.3.2 不同时期不同肠段中总的可培养细菌的检测(TCB) | 第76页 |
| 4.3.3 荧光原位杂交分析 | 第76-79页 |
| 4.4 讨论 | 第79-81页 |
| 第5章 肠道和粪便中接合子的细菌种属鉴定和丰度分析 | 第81-102页 |
| 5.1 引言 | 第81-82页 |
| 5.2 材料和方法 | 第82-91页 |
| 5.2.1 质粒和菌株 | 第82-84页 |
| 5.2.2 主要实验材料和仪器设备 | 第84页 |
| 5.2.3 主要试剂、培养基和溶液 | 第84-85页 |
| 5.2.4 试剂盒和引物 | 第85-86页 |
| 5.2.5 实验动物分组 | 第86页 |
| 5.2.6 实验方法 | 第86-91页 |
| 5.3 结果 | 第91-100页 |
| 5.3.1 双荧光供体菌K12Td-Tomato: RK2(EGFP)的构建 | 第91-96页 |
| 5.3.2 供体菌K12Td-Tomato: RK2 (EGFP)与粪便固有菌群的体外接合转移 | 第96-97页 |
| 5.3.3 斑马鱼肠道和粪便中供体菌和接合子的流式细胞分选 | 第97-98页 |
| 5.3.4 接合子的细菌物种和丰度分析 | 第98-100页 |
| 5.4 讨论 | 第100-102页 |
| 第6章 RP4接合转移调控基因的mRNA表达 | 第102-110页 |
| 6.1 引言 | 第102页 |
| 6.2 材料和方法 | 第102-106页 |
| 6.2.1 质粒和菌株 | 第103页 |
| 6.2.2 主要实验材料和仪器设备 | 第103页 |
| 6.2.3 主要试剂、培养基和溶液 | 第103-104页 |
| 6.2.4 试剂盒和引物合成 | 第104页 |
| 6.2.5 实验方法 | 第104-105页 |
| 6.2.6 数据统计和分析 | 第105-106页 |
| 6.3 结果 | 第106-108页 |
| 6.3.1 调控基因trbBp和trfAp的标准曲线建立 | 第106-107页 |
| 6.3.2 斑马鱼不同肠段细菌中调控基因mRNA表达的定量检测 | 第107-108页 |
| 6.4 讨论 | 第108-110页 |
| 第7章 结论 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-127页 |
| 附录 | 第127-147页 |
| 致谢 | 第147-148页 |
