| 提要 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 目录 | 第11-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-57页 |
| 1.1 利用基于AFM的单分子力谱研究蛋白质的力学性能 | 第15-28页 |
| 1.1.1 单分子技术与基于原子力显微镜技术的单分子力谱的原理 | 第15-19页 |
| 1.1.2 蛋白质单分子的两种拉伸模式及其力谱 | 第19-22页 |
| 1.1.3 蛋白质折叠和解折叠过程中的动力学和能量路径 | 第22-25页 |
| 1.1.4 力学稳定性是一种动力学稳定性 | 第25页 |
| 1.1.5 利用单分子力谱方法绘制蛋白质的自由能图谱 | 第25-27页 |
| 1.1.6 单分子力谱与计算机模拟的结合 | 第27-28页 |
| 1.2 蛋白质工程结合单分子力谱在蛋白质力学解折叠研究中的应用 | 第28-40页 |
| 1.2.1 “蛋白质力学”的历史与成就 | 第29-33页 |
| 1.2.2 多聚蛋白质的设计允许了详尽地研究单个蛋白结构域 | 第33-36页 |
| 1.2.3 嵌合多聚蛋白质：研究力学上未表征过的蛋白质的重要手段 | 第36-40页 |
| 1.3 蛋白质工程结合AFM单分子力谱的新兴领域 | 第40-44页 |
| 1.3.1 没有天然折叠结构的蛋白质：本质无序蛋白(IDPs) | 第40-42页 |
| 1.3.2 力学化学领域的研究 | 第42-44页 |
| 1.4 本论文的研究思路 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-57页 |
| 第二章 疏水核堆积作用对蛋白质GB1力学稳定性的影响 | 第57-79页 |
| 2.1 本章引论 | 第57-59页 |
| 2.2 实验材料与方法部分 | 第59-63页 |
| 2.2.1 多蛋白的构筑 | 第59-60页 |
| 2.2.2 单分子力谱实验 | 第60页 |
| 2.2.3 蒙特卡罗模拟(Monte Carlo Simulation) | 第60-62页 |
| 2.2.4 Φ值分析法(Φ-Value Analysis) | 第62-63页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第63-73页 |
| 2.3.1 设计位点突变来探测其对蛋白质GB1力学稳定性的影响 | 第63-64页 |
| 2.3.2 侧链缩减对蛋白质GB1的力学解折叠稳定性的影响 | 第64-69页 |
| 2.3.3 力学Φ_U值分析法绘制蛋白质GB1的力学解折叠过渡态 | 第69-71页 |
| 2.3.4 疏水核堆积作用决定了蛋白质GB1的力学稳定性 | 第71-73页 |
| 2.4 本章小结 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-79页 |
| 第三章 β片层结构的形成因素对蛋白质GB1的力学稳定性的影响 | 第79-100页 |
| 3.1 本章引论 | 第79-81页 |
| 3.2 实验材料与方法部分 | 第81-84页 |
| 3.2.1 多蛋白的构筑 | 第81-82页 |
| 3.2.2 单分子力谱实验 | 第82页 |
| 3.2.3 蒙特卡罗模拟(Monte Carlo Simulation) | 第82-83页 |
| 3.2.4 化学变性实验 | 第83-84页 |
| 3.3 实验结果与讨论 | 第84-94页 |
| 3.3.1 客体位置的选择和主体环境的设计 | 第84-85页 |
| 3.3.2 形成β片层结构的固有倾向对蛋白质GB1的力学力稳定性的影响 | 第85-87页 |
| 3.3.3 中央β链段中心位点的侧链削减对蛋白质GB1的力学稳定性的影响 | 第87-92页 |
| 3.3.4 力学解折叠过渡态决定了蛋白质构成因素对其力学稳定性的影响 | 第92-94页 |
| 3.4 本章小结 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-100页 |
| 第四章 通过设计β片层结构上侧链间的相互作用来提高蛋白质的力学稳定性 | 第100-120页 |
| 4.1 本章引论 | 第100-101页 |
| 4.2 实验材料与方法部分 | 第101-103页 |
| 4.2.1 突变体的设计 | 第101-102页 |
| 4.2.2 利用马来酰亚胺—巯基之间的偶联反应构建多聚蛋白 | 第102页 |
| 4.2.3 单分子力谱实验 | 第102-103页 |
| 4.2.4 蒙特卡罗模拟(Monte Carlo Simulation) | 第103页 |
| 4.3 实验结果与讨论 | 第103-114页 |
| 4.3.1 客体位置的选择和主体环境的设计 | 第103-105页 |
| 4.3.2 β片层结构上侧链间相互作用对力学稳定性的影响 | 第105-109页 |
| 4.3.3 从蛋白质解折叠能量图谱分析侧链间相互作用导致的解折叠力的变化 | 第109-113页 |
| 4.3.4 调控β片层结构上侧链间相互作用是提高蛋白质力学稳定性的普适方法 | 第113-114页 |
| 4.4 本章小结 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-120页 |
| 作者简介 | 第120-121页 |
| 博士期间发表的论文(含待发表) | 第121-122页 |
| 博士期间参加的学术会议 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123页 |
