| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 英文缩略词 | 第7-12页 |
| 1 前言 | 第12-23页 |
| 1.1 植物自交不亲和性概述 | 第12页 |
| 1.2 花柱S-RNase基因的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3 花粉S基因的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 非S因子与自交不亲和 | 第14-15页 |
| 1.5 泛素/26S蛋白酶体途径与自交不亲和 | 第15-19页 |
| 1.5.1 泛素/26S蛋白酶体途径的组成 | 第15-17页 |
| 1.5.2 泛素/26S蛋白酶体途径的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.5.2.1 泛素/26S蛋白酶体途径与孢子体自交不亲和 | 第18页 |
| 1.5.2.2 泛素/26S蛋白酶体途径与配子体自交不亲和 | 第18-19页 |
| 1.6 转录组测序（RNA-Seq）技术及其应用 | 第19-21页 |
| 1.6.1 RNA-Seq技术简介 | 第19-20页 |
| 1.6.2 RNA-Seq技术的应用 | 第20-21页 |
| 1.7 本课题研究的目的意义及技术路线 | 第21-23页 |
| 1.7.1 本课题研究的目的意义 | 第21-22页 |
| 1.7.2 本课题研究的技术路线 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23页 |
| 2.1.2 菌株和质粒 | 第23页 |
| 2.1.3 主要试剂与培养基 | 第23-24页 |
| 2.2 主要仪器设备 | 第24页 |
| 2.3 RNA和DNA的提取及检测 | 第24页 |
| 2.4 cDNA第一链的合成 | 第24页 |
| 2.5 RNA-Seq测序方法 | 第24-30页 |
| 2.5.1 RNA-Seq文库制备及测序 | 第24-25页 |
| 2.5.2 生物信息分析 | 第25-27页 |
| 2.5.2.1 测序产量统计及组装质量评估 | 第26页 |
| 2.5.2.2 RNA-Seq整体测序质量评估 | 第26页 |
| 2.5.2.3 基因表达量统计 | 第26-27页 |
| 2.5.2.4 差异表达基因筛选 | 第27页 |
| 2.5.2.5 Unigene功能注释 | 第27页 |
| 2.5.3 qPCR分析转录组测序结果 | 第27-30页 |
| 2.6 SI泛素代谢途径相关基因的克隆 | 第30-32页 |
| 2.6.1 目的基因的筛选 | 第30页 |
| 2.6.2 引物的设计 | 第30-31页 |
| 2.6.3 目的基因的扩增与检测 | 第31页 |
| 2.6.4 目的基因片段的回收 | 第31页 |
| 2.6.5 载体的连接与转化 | 第31页 |
| 2.6.6 测序结果分析 | 第31-32页 |
| 2.7 SI泛素代谢途径相关基因的表达分析 | 第32-33页 |
| 3. 结果与分析 | 第33-63页 |
| 3.1 总RNA和基因组DNA的提取 | 第33-34页 |
| 3.2 转录组数据分析 | 第34-39页 |
| 3.2.1 测序产量统计及评估 | 第34-35页 |
| 3.2.2 RNA-Seq整体测序质量评估 | 第35-39页 |
| 3.3 差异表达基因筛选 | 第39-40页 |
| 3.4 Unigene功能注释 | 第40-44页 |
| 3.4.1 Unigene的功能注释分析 | 第40-42页 |
| 3.4.2 差异表达基因的注释 | 第42-44页 |
| 3.5 转录组数据q PCR验证 | 第44-48页 |
| 3.6 转录组中SI泛素代谢途径相关基因分析 | 第48-52页 |
| 3.6.1 泛素/26S蛋白酶体途径中差异表达基因分析 | 第48-50页 |
| 3.6.2 泛素/26S蛋白酶途径中差异基因在自交、异交授粉过程中的表达情况 | 第50-52页 |
| 3.7 SI泛素代谢途径相关基因的筛选 | 第52-54页 |
| 3.8 SI泛素代谢途径相关基因的克隆及序列分析 | 第54-60页 |
| 3.9 SI泛素代谢途径相关基因的时空表达分析 | 第60-63页 |
| 4. 讨论与结论 | 第63-68页 |
| 4.1 讨论 | 第63-66页 |
| 4.2 结论 | 第66-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-78页 |
