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全球多样性甘蓝型油菜种质表型性状的评价与全基因组关联分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
英文缩略表第12-13页
第一章 绪论第13-25页
    1.1. 甘蓝型油菜产量与农艺性状研究进展第13-16页
        1.1.1 产量及其相关农艺性状第13-14页
        1.1.2 产量及其相关农艺性状的相互关系第14页
        1.1.3 产量与农艺性状的QTL定位第14-16页
    1.2 甘蓝型油菜品质性状研究进展第16-19页
        1.2.1 甘蓝型油菜品质性状第16-17页
        1.2.2 甘蓝型油菜品质改良历史与目标第17页
        1.2.3 油菜品质性状相互关系第17-18页
        1.2.4 油菜品质性状与QTL定位第18-19页
    1.3 甘蓝型油菜遗传多样性研究进展第19页
    1.4 植物关联分析及其研究进展第19-22页
        1.4.1 关联分析的概念及特点第19-20页
        1.4.2 连锁不平衡与关联分析第20页
        1.4.3 影响关联分析的因素第20页
        1.4.4 关联分析的途径与步骤第20-21页
        1.4.5 关联分析在作物中的应用第21页
        1.4.6 关联分析的优缺点第21-22页
    1.5 关联分析在甘蓝型油菜中的应用第22页
    1.6 研究目的与意义第22-25页
        1.6.1 研究目的与意义第22-23页
        1.6.2 技术路线第23-25页
第二章 甘蓝型油菜产量与农艺性状的评价鉴定与遗传变异分析第25-47页
    2.1 前言第25页
    2.2 材料与方法第25-36页
        2.2.1 植物材料第25页
        2.2.2 田间试验第25-26页
        2.2.3 12个产量与农艺性状的评估及数据采集第26页
        2.2.4 12个产量与农艺性状的统计分析第26页
        2.2.5 12个产量与农艺性状的主成分分析第26-36页
    2.3 结果与分析第36-45页
        2.3.1 12个产量与农艺性状评估第36-40页
        2.3.2 优异基因资源与特异遗传材料的挖掘第40页
        2.3.3 12个产量与农艺性状基因型的变化第40页
        2.3.4 12个产量与农艺性状间的关系第40-41页
        2.3.5 12个产量与农艺性状的主成分分析第41-45页
    2.4 讨论第45-46页
    本章小结第46-47页
第三章 甘蓝型油菜品质性状的评价鉴定与遗传变异分析第47-58页
    3.1 前言第47页
    3.2 材料与方法第47-48页
        3.2.1 植物材料第47页
        3.2.2 田间试验第47页
        3.2.3 10个品质性状测定与数据采集第47页
        3.2.4 10个品质性状的统计分析第47页
        3.2.5 10个品质性状的主成分分析第47-48页
    3.3 结果与分析第48-56页
        3.3.1 10个品质性状的评价第48-51页
        3.3.2 品质性状表现优异的基因资源挖掘第51-53页
        3.3.3 10个品质性状的基因型变异第53页
        3.3.4 10个品质性状间的相互关系第53-54页
        3.3.5 10个品质性状的主成分分析第54-56页
    3.4 讨论第56-57页
    本章小结第57-58页
第四章 甘蓝型油菜农艺与产量性状全基因组关联分析第58-72页
    4.1 前言第58页
    4.2 材料与方法第58-60页
        4.2.1 植物材料第58页
        4.2.2 表型性状数据获取与最优线性无偏预测值、性状遗传力的计算第58页
        4.2.3 基因型数据获取第58-59页
            4.2.3.1 SNP基因型数据分型与过滤第58-59页
            4.2.3.2 SNP模拟图谱的定位第59页
            4.2.3.3 遗传多样性、群体结构与连锁不平衡分析第59页
        4.2.4 12个农艺与产量性状全基因组关联分析第59-60页
    4.3 结果与分析第60-69页
        4.3.1 12个农艺与产量性状遗传力的估计第60页
        4.3.2 SNP基因型分析第60-63页
            4.3.2.1 SNP质量评估与过滤第60-61页
            4.3.2.2 SNP模拟图谱定位与多样性第61页
            4.3.2.3 群体结构、亲缘关系和连锁不平衡第61-63页
        4.3.3 12个产量与农艺性状的关联作QQ-PLOT图第63页
        4.3.4 7个产量与农艺性状关联作Manhattan图第63-66页
        4.3.5 7个产量与农艺性状的关联SNP位点与关联位点的评估第66-69页
    4.4 讨论第69-71页
    本章小结第71-72页
第五章 甘蓝型油菜品质性状全基因组关联分析第72-91页
    5.1 前言第72页
    5.2 材料与方法第72页
        5.2.1 植物材料第72页
        5.2.2 表型性状数据获取与标准化第72页
        5.2.3 基因型数据获取第72页
        5.2.4 品质性状全基因组关联分析第72页
    5.3 结果与分析第72-89页
        5.3.1 10个品质性状遗传力的估计第72-73页
        5.3.2 10个品质性状的关联作QQ-PLOT图第73页
        5.3.3 8个品质性状的关联作Manhattan图第73-76页
        5.3.4 8个品质性状的关联SNP位点与关联位点的评估第76-89页
    5.4 讨论第89-90页
    本章小结第90-91页
第六章 全文结论第91-94页
    6.1 产量与农艺性状的评价鉴定与遗传变异分析第91页
    6.2 品质性状的评价鉴定与遗传变异分析第91-92页
    6.3 SNP基因型分析第92页
    6.4 产量与农艺性状关联分析第92-93页
    6.5 品质性状关联分析第93-94页
参考文献第94-104页
附录第104-110页
致谢第110-111页
作者简历第111页

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