| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第1章 药物分子对接方法的研究进展 | 第13-35页 |
| 1.1 引言 | 第13-15页 |
| 1.2 对接策略 | 第15-19页 |
| 1.2.1 柔性对接 | 第15-18页 |
| 1.2.2 共价对接 | 第18-19页 |
| 1.3 打分函数 | 第19-25页 |
| 1.3.1 传统打分函数 | 第19-21页 |
| 1.3.2 基于机器学习的打分函数 | 第21-25页 |
| 1.4 结论与展望 | 第25-27页 |
| 参考文献 | 第27-35页 |
| 第2章 靶向EV713C蛋白酶抑制剂的发现和作用机理研究 | 第35-59页 |
| 2.1 引言 | 第35-37页 |
| 2.2 研究方法 | 第37-41页 |
| 2.2.1 基于对接方法的虚拟筛选 | 第37-38页 |
| 2.2.2 蛋白酶的表达和纯化 | 第38页 |
| 2.2.3 酶活抑制实验 | 第38-39页 |
| 2.2.4 结合实验 | 第39页 |
| 2.2.5 荧光淬灭实验 | 第39页 |
| 2.2.6 化学合成 | 第39-40页 |
| 2.2.7 分子动力学模拟 | 第40页 |
| 2.2.8 圆二色性测量 | 第40-41页 |
| 2.2.9 抗病毒与毒性实验 | 第41页 |
| 2.3 研究结果与讨论 | 第41-53页 |
| 2.3.1 虚拟筛选结果 | 第41-42页 |
| 2.3.2 酶活抑制实验 | 第42页 |
| 2.3.3 抑制类型实验 | 第42-43页 |
| 2.3.4 类似物结构与活性 | 第43-45页 |
| 2.3.5 结合模式分析 | 第45-46页 |
| 2.3.6 分子动力学模拟 | 第46-47页 |
| 2.3.7 突变实验验证 | 第47-51页 |
| 2.3.8 抗病毒活性与毒性 | 第51-53页 |
| 2.4 小结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 第3章 靶向登革热病毒NS2B/NS3蛋白酶抑制剂的发现研究 | 第59-87页 |
| 3.1 引言 | 第59-60页 |
| 3.2 研究方法 | 第60-70页 |
| 3.2.1 数据收集 | 第60-67页 |
| 3.2.2 药效团模型的建立 | 第67-68页 |
| 3.2.3 药效团模型测试 | 第68页 |
| 3.2.4 数据库准备 | 第68页 |
| 3.2.5 筛选流程 | 第68-69页 |
| 3.2.6 酶活抑制实验 | 第69页 |
| 3.2.7 分子对接 | 第69-70页 |
| 3.2.8 抗病毒活性测试 | 第70页 |
| 3.3 研究结果与讨论 | 第70-79页 |
| 3.3.1 药效团生成与验证 | 第70-72页 |
| 3.3.2 药效团筛选 | 第72-73页 |
| 3.3.3 酶抑制试验 | 第73-74页 |
| 3.3.4 模型匹配分析 | 第74-75页 |
| 3.3.5 相似性搜索 | 第75-77页 |
| 3.3.6 构效关系分析 | 第77页 |
| 3.3.7 对接模式分析 | 第77-78页 |
| 3.3.8 抗病毒测试结果 | 第78-79页 |
| 3.4 小结 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-87页 |
| 第4章 蛋白质精氨酸甲基转移酶 5（PRMT5）选择性抑制剂的发现研究 | 第87-115页 |
| 4.1 引言 | 第87-90页 |
| 4.2 研究方法 | 第90-93页 |
| 4.2.1 虚拟筛选 | 第90-91页 |
| 4.2.2 酶抑制实验 | 第91页 |
| 4.2.3 基于相似性搜索 | 第91页 |
| 4.2.4 细胞抗增殖活性实验 | 第91-92页 |
| 4.2.5 化学合成 | 第92-93页 |
| 4.3 研究结果和讨论 | 第93-106页 |
| 4.3.1 基于对接的虚拟筛选 | 第93-95页 |
| 4.3.2 PRMT5酶抑制实验 | 第95-96页 |
| 4.3.3 相似性搜索 | 第96-97页 |
| 4.3.4 DC_P33结合模式分析 | 第97-99页 |
| 4.3.5 Hit优化以及SAR分析 | 第99-102页 |
| 4.3.6 选择性实验 | 第102-105页 |
| 4.3.7 细胞活性实验 | 第105-106页 |
| 4.4 小结 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-115页 |
| 论文总结 | 第115-117页 |
| 附录 发表论文 | 第117-143页 |
| 作者简历 | 第143-145页 |
| 致谢 | 第145-146页 |
