| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第16-17页 |
| 第一部分 文献综述 | 第17-35页 |
| 第一章 棉花黄萎病菌及其致病基因的研究进展 | 第17-25页 |
| 1 棉花黄萎病菌的概述 | 第17-20页 |
| ·棉花黄萎病菌病原菌 | 第17-18页 |
| ·棉花黄萎病的发病症状及危害 | 第18页 |
| ·黄萎病菌致病机理 | 第18页 |
| ·棉花黄萎病菌的侵染过程 | 第18-20页 |
| 2 棉花黄萎病菌致病相关基因的研究进展 | 第20-22页 |
| ·大丽轮枝菌的全基因组测序 | 第20页 |
| ·棉花黄萎病菌致病基因的研究进展 | 第20-21页 |
| ·棉花黄萎病菌微菌核的研究进展 | 第21-22页 |
| 3 真菌MAPK信号通路及Msb基因 | 第22-25页 |
| ·MAPK信号通路 | 第22-23页 |
| ·MAPK在植物病原菌中的作用 | 第23页 |
| ·Msb基因的研究进展 | 第23-25页 |
| 第二章 几丁质相关基因在植物免疫系统中的研究进展 | 第25-34页 |
| 1 植物免疫系统概述 | 第25-26页 |
| 2 植物与病原菌的互作机理 | 第26-28页 |
| ·植物对病原相关分子模式的识别 | 第26-27页 |
| ·植物对病原菌效应因子的识别 | 第27-28页 |
| 3 LysM基因的研究进展 | 第28-31页 |
| ·LysM结构域概述 | 第28页 |
| ·植物中LysM基因的结构特征及分类 | 第28-29页 |
| ·LysM基因在植物抗病中的作用 | 第29-31页 |
| 4 几丁质酶基因的研究进展 | 第31-34页 |
| ·几丁质酶基因的结构特征及分类 | 第31-32页 |
| ·几丁质酶在植物抗病中的作用 | 第32-33页 |
| ·棉花中几丁质酶基因的研究进展 | 第33-34页 |
| 本研究的目的与意义 | 第34-35页 |
| 第二部分 研究报告 | 第35-113页 |
| 第三章 黄萎病菌致病相关基因Msb的克隆及功能研究 | 第35-67页 |
| 1 材料与方法 | 第36-52页 |
| ·黄萎病菌菌株和培养条件 | 第36页 |
| ·细菌菌株和质粒 | 第36页 |
| ·培养基 | 第36-38页 |
| ·序列分析 | 第38-39页 |
| ·真菌DNA的提取 | 第39-40页 |
| ·基因组序列的PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·PCR扩增产物的电泳、回收和连接 | 第41页 |
| ·连接产物的转化、菌液检测及阳性克隆的质粒提取 | 第41-43页 |
| ·真菌总RNA的提取及RT-PCR扩增 | 第43-45页 |
| ·真菌载体的农杆菌转化 | 第45-46页 |
| ·农杆菌介导的黄萎病菌遗传转化及阳性转化子鉴定 | 第46-47页 |
| ·Southern杂交分析 | 第47-51页 |
| ·棉花和拟南芥的种植与接种 | 第51页 |
| ·电镜扫描分析 | 第51-52页 |
| ·黄萎病菌侵染后棉花维管束症状观察 | 第52页 |
| 2 结果和分析 | 第52-63页 |
| ·VdMsb基因的克隆及生物信息学分析 | 第52-54页 |
| ·VdMsb基因缺失突变体的获得 | 第54-56页 |
| ·VdMsb基因互补突变体的获得 | 第56-57页 |
| ·野生型与突变体菌株的RT-PCR检测 | 第57页 |
| ·野生型与突变体菌株的Southern杂交分析 | 第57-58页 |
| ·野生型与突变体菌株的表型观察 | 第58-59页 |
| ·VdMsb基因对黄萎病致病力的影响 | 第59-61页 |
| ·VdMsb基因影响致病力机理的初步研究 | 第61-63页 |
| 3 讨论 | 第63-67页 |
| ·Msb类基因的保守性 | 第63-64页 |
| ·VdMsb基因影响黄萎病菌的微菌核形成 | 第64-65页 |
| ·VdMsb基因调控黄萎病菌的致病力 | 第65-66页 |
| ·黄萎病菌致病基因的研究在棉花抗病育种中的应用前景 | 第66-67页 |
| 第四章 棉花LysM基因家族的全基因组鉴定及功能分析 | 第67-95页 |
| 1 材料与方法 | 第68-75页 |
| ·实验材料 | 第68页 |
| ·棉花幼苗的培养及病菌接种 | 第68页 |
| ·棉花幼苗的不同胁迫处理 | 第68页 |
| ·棉花RNA的提取及反转录方法 | 第68-70页 |
| ·生物信息学分析 | 第70页 |
| ·基因家族成员的荧光定量PCR分析 | 第70-72页 |
| ·目的基因的克隆 | 第72-73页 |
| ·病毒介导的基因沉默(VIGS)方法 | 第73-75页 |
| 2 结果与分析 | 第75-90页 |
| ·LysM基因家族全基因组注释 | 第75-78页 |
| ·LysM基因的保守结构域及系统进化分析 | 第78-80页 |
| ·LysM基因的内含子-外显子结构分析 | 第80-82页 |
| ·海岛棉LysM基因的表达分析 | 第82-86页 |
| ·海岛棉GbLYK5和GbLYP1基因的克隆 | 第86-87页 |
| ·利用VIGS技术对GbLYK5和GbLYP1基因功能的初步验证 | 第87-90页 |
| 3 讨论 | 第90-95页 |
| ·LysM基因家族在棉花中的分布特征及分类 | 第90-92页 |
| ·棉花中LysM基因家族成员的表达特征 | 第92页 |
| ·GbLYK5和GbLYP1基因影响棉花对黄萎病菌的抗性 | 第92-95页 |
| 第五章 棉花几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及功能分析 | 第95-113页 |
| 1 材料与方法 | 第95-96页 |
| 2 结果与分析 | 第96-110页 |
| ·几丁质酶基因家族全基因组注释 | 第96-99页 |
| ·几丁质酶基因的系统进化分析 | 第99-100页 |
| ·几丁质酶基因的内含子_外显子结构分析 | 第100-102页 |
| ·海岛棉几丁质酶基因的表达分析 | 第102-107页 |
| ·海岛棉GbChi22基因的克隆 | 第107-108页 |
| ·利用VIGS技术对GbChi22基因功能的初步验证 | 第108-110页 |
| 3 讨论 | 第110-113页 |
| ·几丁质酶基因家族在棉花中的分布特征及分类 | 第110-111页 |
| ·棉花中几丁质酶基因的表达特征及功能分析 | 第111-113页 |
| 全文结论 | 第113-115页 |
| 附录 | 第115-123页 |
| 参考文献 | 第123-133页 |
| 攻读博士学位期间已发表的论文 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135页 |
