| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-41页 |
| 1. 共生菌Wolbachia概述 | 第15-16页 |
| 2. Wolbachia的形态特征及在节肢动物中的分布 | 第16-18页 |
| 3. Wolbachia系统发育研究 | 第18-21页 |
| 4. Wolbachia在宿主中的感染特性及传播方式 | 第21-22页 |
| 5. Wolbachia对宿主的生殖调控作用及其机理研究 | 第22-27页 |
| ·Wolbachia诱导宿主细胞质不亲和研究现状 | 第22-25页 |
| ·Wolbachia诱导宿主孤雌生殖研究现状 | 第25页 |
| ·Wolbachia诱导宿主雌性化研究现状 | 第25-26页 |
| ·Wolbachia诱导杀雄研究现状 | 第26-27页 |
| 6. Wolbachia对宿主种群遗传的影响 | 第27-28页 |
| 7. Wolbachia对宿主的其他影响 | 第28-30页 |
| 8. 应用高通量测序技术研究宿主-Wolbachia互作的分子机理 | 第30-33页 |
| 9. 应用Wolbachia控制害虫及人类疾病 | 第33-35页 |
| 10. 叶螨中Wolbachia的研究进展 | 第35-38页 |
| 11. 本研究目的及意义 | 第38-41页 |
| 第二章 叶螨中Wolbachia株系wsp基因序列多样性与重组分析 | 第41-51页 |
| 1. 材料与方法 | 第42-44页 |
| ·供试材料 | 第42页 |
| ·叶螨总DNA提取 | 第42-43页 |
| ·wsp基因扩增与测序 | 第43页 |
| ·序列分析 | 第43-44页 |
| ·系统发育分析 | 第44页 |
| ·重组检测 | 第44页 |
| 2. 结果与分析 | 第44-48页 |
| ·叶螨种与wsp序列间的关系 | 第44-45页 |
| ·序列分析与系统发育树的建立 | 第45-47页 |
| ·wsp基因重组分析 | 第47-48页 |
| 3. 讨论 | 第48-51页 |
| 第三章 Wolbachia在叶螨种群中的感染特性与分布格局分析 | 第51-67页 |
| 1. 材料与方法 | 第52-55页 |
| ·叶螨采集与鉴定 | 第52-53页 |
| ·DNA提取、Wolbachia感染检测及多位点序列分型 | 第53-54页 |
| ·序列分析 | 第54-55页 |
| ·系统发育分析 | 第55页 |
| 2. 结果与分析 | 第55-64页 |
| ·不同叶螨种群中Wolbachia感染情况 | 第55-57页 |
| ·叶螨中Wolbachia株系的MLST鉴定及分析 | 第57-61页 |
| ·Wolbachia感染与宿主线粒体多样性的相关性分析 | 第61-62页 |
| ·Wolbachia感染与宿主地理分布的相关性分析 | 第62-64页 |
| 3. 讨论 | 第64-67页 |
| 第四章 山楂双叶螨中Wolbachia感染特性及其对宿主生殖的影响 | 第67-77页 |
| 1. 材料与方法 | 第69-71页 |
| ·样品采集 | 第69页 |
| ·Wolbachia检测与多位点序列分型 | 第69-70页 |
| ·山楂双叶螨COI基因扩增与测序 | 第70页 |
| ·系统发育分析 | 第70页 |
| ·生物学实验供试虫源 | 第70页 |
| ·杂交实验 | 第70-71页 |
| 2. 结果与分析 | 第71-74页 |
| ·自然种群山楂双叶螨Wolbachia感染情况 | 第71页 |
| ·山楂双叶螨感染Wolbachia株系类型及系统发育分析 | 第71-73页 |
| ·山楂双叶螨线粒体COI基因单倍型分析 | 第73页 |
| ·Wolbachia对山楂双叶螨生殖的影响 | 第73-74页 |
| 3. 讨论 | 第74-77页 |
| 第五章 Wolbachia对截形叶螨种群遗传的影响 | 第77-87页 |
| 1. 材料与方法 | 第78-81页 |
| ·供试材料 | 第78-79页 |
| ·Wolbachia基因、mtDNA-COI序列扩增与测序 | 第79-80页 |
| ·mtDNA序列及系统发育分析 | 第80页 |
| ·种群遗传分化分析 | 第80-81页 |
| 2. 结果与分析 | 第81-84页 |
| ·截形叶螨mtDNA-COI序列分析 | 第81-82页 |
| ·截形叶螨Wolbachia感染情况分析 | 第82页 |
| ·截形叶螨mtDNA-COI单倍型分析 | 第82-83页 |
| ·截形叶螨种群遗传分化分析 | 第83-84页 |
| 3. 讨论 | 第84-87页 |
| 第六章 Wolbachia对二斑叶螨基因表达的影响 | 第87-119页 |
| 1. 材料与方法 | 第90-99页 |
| ·叶螨饲养与样本收集 | 第90页 |
| ·RNA提取及质量检测 | 第90-91页 |
| ·测序文库构建及测序 | 第91-92页 |
| ·生物信息学分析 | 第92-97页 |
| ·测序数据质量评估 | 第93页 |
| ·测序数据过滤 | 第93-94页 |
| ·RNA-Seq整体质量评估 | 第94页 |
| ·与参考基因组序列比对分析 | 第94-95页 |
| ·可变剪切与新转录本分析 | 第95页 |
| ·基因表达水平分析 | 第95页 |
| ·不同叶螨样本间基因差异表达分析 | 第95-96页 |
| ·差异表达基因的GO富集及KEGG富集分析 | 第96-97页 |
| ·应用qRT-PCR方法验证RNA-Seq结果 | 第97-99页 |
| 2. 结果与分析 | 第99-114页 |
| ·二斑叶螨RNA质量检测结果 | 第99-100页 |
| ·测序数据结果统计 | 第100页 |
| ·测序数据整体质量评估 | 第100-102页 |
| ·测序数据与参考基因组比对结果 | 第102-103页 |
| ·基因表达水平分析 | 第103-104页 |
| ·Wolbachia感染对二斑叶螨基因表达的影响 | 第104-108页 |
| ·差异表达基因的GO富集分析 | 第108-109页 |
| ·差异表达基因的KEGG富集分析 | 第109-110页 |
| ·Wolbachia感染引起差异表达的其他候选基因 | 第110-112页 |
| ·qRT-PCR验证结果 | 第112-114页 |
| 3. 讨论 | 第114-119页 |
| 参考文献 | 第119-139页 |
| 附录 | 第139-155页 |
| 在读期间论文发表及奖励情况 | 第155-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
