| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第1章 综述 | 第11-27页 |
| ·丹参的研究概况 | 第11-13页 |
| ·丹参的植物学形态特征及生存环境 | 第11页 |
| ·丹参的药用及经济价值 | 第11-12页 |
| ·丹参的市场需求及资源利用现状 | 第12-13页 |
| ·植物干旱胁迫研究概况 | 第13-14页 |
| ·干旱对植物的危害 | 第13页 |
| ·植物抵抗干旱胁迫研究的现状 | 第13-14页 |
| ·植物MicroRNA的研究概况 | 第14-19页 |
| ·植物MicroRNA的概念及特征 | 第14-15页 |
| ·miRNA的生物合成及其作用机制 | 第15-16页 |
| ·MicroRNA的研究方法 | 第16-17页 |
| ·植物MicroRNA的生物学功能 | 第17-18页 |
| ·植物MicroRNA靶基因的预测及验证 | 第18-19页 |
| ·胁迫相关MicroRNA的研究进展 | 第19-24页 |
| ·病害胁迫 | 第19-20页 |
| ·营养胁迫 | 第20-21页 |
| ·干旱胁迫 | 第21-22页 |
| ·盐胁迫 | 第22-23页 |
| ·温度胁迫 | 第23页 |
| ·其它胁迫 | 第23-24页 |
| ·本论文研究的目的及意义 | 第24-27页 |
| 第2章 实验与方法 | 第27-37页 |
| ·实验材料与仪器 | 第27-28页 |
| ·试验材料 | 第27页 |
| ·试剂及耗材 | 第27页 |
| ·仪器 | 第27-28页 |
| ·实验方法 | 第28-30页 |
| ·干旱胁迫处理 | 第28页 |
| ·丹参总RNA的提取 | 第28-29页 |
| ·去除基因组DNA | 第29页 |
| ·总RNA的检测 | 第29-30页 |
| ·高通量测序 | 第30-32页 |
| ·实验流程 | 第30-31页 |
| ·测序结果的分析 | 第31-32页 |
| ·novel miRNA的生物信息分析 | 第32页 |
| ·反转录 | 第32-33页 |
| ·RNA反转录反应 | 第32-33页 |
| ·miRNA反转录反应 | 第33页 |
| ·Real time PCR验证 | 第33-37页 |
| ·Real time PCR中miRNA和内参基因的引物 | 第33页 |
| ·Real time PCR反应 | 第33-37页 |
| 第3章 丹参microRNA表达谱的构建与信息分析 | 第37-61页 |
| ·实验材料 | 第37页 |
| ·总RNA的提取 | 第37页 |
| ·去除基因组DNA | 第37页 |
| ·总RNA的检测 | 第37-38页 |
| ·正常生长的丹参miRNA表达谱的构建 | 第38-46页 |
| ·小RNA测序数据处理及片段长度分布 | 第38-39页 |
| ·sRNA在基因组上的表达和分布 | 第39-40页 |
| ·siRNA鉴定 | 第40-41页 |
| ·小RNA分类注释 | 第41-42页 |
| ·正常生长丹参miRNA表达谱的构建 | 第42页 |
| ·正常生长丹参中新miRNA及其茎环结构的预测 | 第42页 |
| ·正常生长丹参中新miRNA靶基因预测及分析 | 第42-46页 |
| ·干旱胁迫下的丹参miRNA表达谱的构建 | 第46-54页 |
| ·小RNA测序数据处理及片段长度分布 | 第46-47页 |
| ·sRNA在基因组上的表达和分布 | 第47-48页 |
| ·siRNA鉴定 | 第48页 |
| ·小RNA分类注释 | 第48-49页 |
| ·干旱胁迫下丹参miRNA表达谱的构建 | 第49页 |
| ·干旱胁迫下丹参中新miRNA及其茎环结构的预测 | 第49-50页 |
| ·干旱胁迫下丹参中新miRNA靶基因预测及分析 | 第50-54页 |
| ·丹参保守miRNAs的RT-PCR验证及靶基因预测 | 第54-61页 |
| ·实验材料 | 第54页 |
| ·总RNA的提取 | 第54-55页 |
| ·去除基因组DNA | 第55页 |
| ·总RNA的检测 | 第55页 |
| ·miRNA反转录反应 | 第55页 |
| ·保守miRNAs在丹参幼苗根茎叶中的表达 | 第55-56页 |
| ·正常生长和干旱胁迫下丹参保守miRNAs的差异表达 | 第56-57页 |
| ·部分丹参保守miRNAs靶基因预测 | 第57-61页 |
| 第4章 干旱胁迫下丹参差异表达miRNA图谱构建及RT-PCR验证 | 第61-71页 |
| ·两个样品间小RNA公共及特有序列分析 | 第61页 |
| ·样品的差异分析 | 第61-63页 |
| ·差异分析的方法 | 第61-62页 |
| ·差异分析的结果 | 第62-63页 |
| ·差异表达miRNA的筛选 | 第63页 |
| ·差异表达miRNA的PT-PCR验证 | 第63-64页 |
| ·RT-PCR反应 | 第63页 |
| ·RT-PCR反应结果分析 | 第63-64页 |
| ·靶基因的预测及其功能分析 | 第64-71页 |
| ·靶基因预测方法 | 第64页 |
| ·靶基因预测结果 | 第64-71页 |
| 第5章 结论 | 第71-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 附录 | 第81-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第107页 |
