缩写词 | 第1-12页 |
摘要 | 第12-15页 |
Abstract | 第15-19页 |
第一章 引言 | 第19-31页 |
1 植物体胚发生研究进展 | 第20-23页 |
·植物体胚的发育途径 | 第20-21页 |
·植物生长调节剂对体胚发生的影响 | 第21页 |
·植物体胚发生过程中不同基因的表达分析 | 第21-23页 |
·细胞周期相关基因 | 第21-22页 |
·激素应答相关基因 | 第22页 |
·胁迫相关基因 | 第22页 |
·信号转导相关基因 | 第22-23页 |
2 植物谷胱甘肽代谢研究进展 | 第23-27页 |
·植物谷胱甘肽代谢的相关酶类 | 第23-24页 |
·植物谷胱甘肽对体胚发生的氧化还原调控 | 第24-27页 |
·谷胱甘肽氧化还原状态的改变对生长和发育的调控 | 第24-25页 |
·谷胱甘肽在胚胎形成和植株再生过程中的作用 | 第25-26页 |
·谷胱甘肽处理的胚胎结构和生理变化 | 第26-27页 |
3 转录组技术的应用 | 第27-28页 |
4 龙眼生物技术研究进展 | 第28-29页 |
5 本研究的意义及主要研究内容 | 第29-31页 |
·本研究的意义 | 第29页 |
·本研究的主要内容 | 第29-31页 |
第二章 龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析 | 第31-36页 |
1 材料与方法 | 第31页 |
·材料与数据库 | 第31页 |
·序列搜索与登录 | 第31页 |
2 结果与分析 | 第31-34页 |
·龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析 | 第31-34页 |
·γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶相关基因 | 第33页 |
·谷胱甘肽合成酶相关基因 | 第33页 |
·谷胱甘肽还原酶相关基因 | 第33页 |
·谷胱甘肽过氧化物酶相关基因 | 第33-34页 |
·谷胱甘肽转移酶相关基因 | 第34页 |
3 讨论 | 第34-36页 |
·龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽的合成与降解 | 第34-35页 |
·转录组分析在龙眼胚性愈伤组织研究中的应用 | 第35-36页 |
第三章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的克隆 | 第36-74页 |
第一节 龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的克隆 | 第36-45页 |
1 材料与方法 | 第36-39页 |
·材料 | 第36-37页 |
·方法 | 第37-39页 |
·龙眼胚性愈伤组织 DNA 与总 RNA 的提取及质量检测 | 第37页 |
·龙眼愈伤胚性组织 cDNA 的合成 | 第37页 |
·龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因的引物设计及 PCR 扩增 | 第37-38页 |
·目的片段的回收、克隆和测序 | 第38页 |
·序列拼接及分析 | 第38-39页 |
2 结果与分析 | 第39-43页 |
·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因转录组序列的验证结果 | 第39-40页 |
·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果 | 第40页 |
·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果 | 第40-41页 |
·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证 | 第41-43页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 全长序列分析 | 第43页 |
3 讨论 | 第43-45页 |
·γ-ECS 在龙眼胚性愈伤组织中可能是单拷贝基因 | 第43页 |
·龙眼胚性愈伤组织γ-ECS 基因克隆的意义 | 第43-45页 |
第二节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的克隆 | 第45-53页 |
1 材料与方法 | 第45页 |
·材料 | 第45页 |
·方法 | 第45页 |
2 结果与分析 | 第45-52页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因转录组序列的验证结果 | 第45-46页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果 | 第46-47页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果 | 第47-48页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证 | 第48-49页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因基因组 DNA 序列的获得 | 第49-50页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析 | 第50-52页 |
3 讨论 | 第52-53页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GSHS 基因克隆的难点 | 第52页 |
·TA 克隆长片段 PCR 产物的策略 | 第52-53页 |
第三节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的克隆 | 第53-61页 |
1 材料与方法 | 第53-54页 |
·材料 | 第54页 |
·方法 | 第54页 |
2 结果与分析 | 第54-60页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因转录组序列的验证结果 | 第54-55页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果 | 第55-56页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果 | 第56-57页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证 | 第57-58页 |
·谷胱甘肽还原酶基因基因组 DNA 序列的获得 | 第58页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析 | 第58-60页 |
3 讨论 | 第60-61页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GR 基因克隆的意义 | 第60-61页 |
·TA 克隆长片段 PCR 产物的策略 | 第61页 |
第四节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的克隆 | 第61-67页 |
1 材料与方法 | 第61-62页 |
·材料 | 第62页 |
·方法 | 第62页 |
2 结果与分析 | 第62-66页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因转录组序列的验证结果 | 第62-63页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增 | 第63页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的 5' RACE 扩增 | 第63-64页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 全长的序列拼接 | 第64-65页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因基因组 DNA 序列的获得 | 第65页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析 | 第65-66页 |
3 讨论 | 第66-67页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GPX 基因克隆的意义 | 第66-67页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GPX 基因组外显子和内含子影响基因的时空表达 | 第67页 |
第五节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的克隆 | 第67-74页 |
1 材料与方法 | 第67-68页 |
·材料 | 第67-68页 |
·方法 | 第68页 |
2 结果与分析 | 第68-72页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽 S 转移酶基因转录组序列的验证结果 | 第68-69页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的 3' RACE 扩增 | 第69页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的 5' RACE 扩增 | 第69-70页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 全长的序列拼接 | 第70-71页 |
·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因基因组 DNA 序列的获得 | 第71页 |
·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析 | 第71-72页 |
3 讨论 | 第72-74页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GST 基因克隆的难点 | 第72-73页 |
·龙眼胚性愈伤组织 GST 基因克隆的意义 | 第73-74页 |
第四章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的生物信息学分析 | 第74-107页 |
第一节 龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因的生物信息学分析 | 第74-79页 |
1 材料与方法 | 第74-75页 |
·材料 | 第74页 |
·方法 | 第74-75页 |
2 结果与分析 | 第75-79页 |
·蛋白质的理化性质预测与分析 | 第75页 |
·蛋白质跨膜结构预测 | 第75页 |
·蛋白质信号肽及亚细胞定位预测 | 第75-76页 |
·蛋白质磷酸化结构的预测 | 第76页 |
·蛋白质功能位点的预测 | 第76-77页 |
·蛋白质保守结构域分析 | 第77页 |
·蛋白卷曲螺旋结构预测 | 第77页 |
·蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第77-78页 |
·γ-ECS 系统进化树构建 | 第78-79页 |
3 讨论 | 第79页 |
第二节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽合成酶基因的生物信息学分析 | 第79-86页 |
1 材料与方法 | 第79-80页 |
·材料 | 第79页 |
·方法 | 第79-80页 |
2 结果与分析 | 第80-85页 |
·蛋白的基本理化性质比较分析 | 第80页 |
·蛋白质跨膜结构预测 | 第80页 |
·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测 | 第80-82页 |
·蛋白质磷酸化位点预测与分析 | 第82页 |
·蛋白质功能基序分析 | 第82-83页 |
·蛋白卷曲螺旋结构预测 | 第83页 |
·保守结构域及进化分析 | 第83-84页 |
·蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第84-85页 |
·GSHS 系统进化树构建 | 第85页 |
3 讨论 | 第85-86页 |
·利用生物信息学推测 GSHS 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理 | 第85-86页 |
·GSHS 蛋白保守结构域对谷胱甘肽合成酶功能的影响 | 第86页 |
第三节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因的生物信息学分析 | 第86-93页 |
1 材料与方法 | 第86页 |
·材料 | 第86页 |
·方法 | 第86页 |
2 结果与分析 | 第86-92页 |
·龙眼体胚谷胱甘肽还原酶蛋白的基本理化性质比较分析 | 第87页 |
·蛋白质跨膜结构预测 | 第87页 |
·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测 | 第87-88页 |
·蛋白质磷酸化位点预测与分析 | 第88-89页 |
·蛋白质功能基序分析 | 第89-90页 |
·蛋白卷曲螺旋结构预测 | 第90页 |
·保守结构域及进化分析 | 第90-91页 |
·蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第91页 |
·GR 系统进化树构建 | 第91-92页 |
3 讨论 | 第92-93页 |
第四节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因的生物信息学分析 | 第93-100页 |
1 材料与方法 | 第93页 |
·材料 | 第93页 |
·方法 | 第93页 |
2 结果与分析 | 第93-99页 |
·龙眼体胚谷胱甘肽过氧化物酶蛋白的基本理化性质比较分析 | 第93-94页 |
·蛋白质跨膜结构预测 | 第94页 |
·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测 | 第94-95页 |
·蛋白质磷酸化位点预测与分析 | 第95-96页 |
·蛋白质功能基序分析 | 第96页 |
·蛋白卷曲螺旋结构预测 | 第96-97页 |
·保守结构域及进化分析 | 第97页 |
·蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第97-98页 |
·GPX 系统进化树构建 | 第98-99页 |
3 讨论 | 第99-100页 |
·利用生物信息学推测 GPX 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理 | 第99页 |
·GPX 蛋白保守结构域对谷胱甘肽过氧化物酶功能的影响 | 第99-100页 |
第五节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽 S 转移酶基因的生物信息学分析 | 第100-107页 |
1 材料与方法 | 第100页 |
·材料 | 第100页 |
·方法 | 第100页 |
2 结果与分析 | 第100-105页 |
·龙眼体胚谷胱甘肽 S 转移酶蛋白的基本理化性质比较分析 | 第100页 |
·蛋白质跨膜结构预测 | 第100-101页 |
·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测 | 第101-102页 |
·蛋白质磷酸化位点预测与分析 | 第102-103页 |
·蛋白质功能基序分析 | 第103页 |
·蛋白卷曲螺旋结构预测 | 第103页 |
·保守结构域及进化分析 | 第103-104页 |
·蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第104-105页 |
·GST 系统进化树构建 | 第105页 |
3 讨论 | 第105-107页 |
·利用生物信息学推测 GST 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理 | 第105-106页 |
·GST 蛋白保守结构域对谷胱甘肽过氧化物酶功能的影响 | 第106-107页 |
第五章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的定量表达 | 第107-117页 |
1 材料与方法 | 第107-109页 |
·材料 | 第107页 |
·主要试剂和仪器 | 第107页 |
·方法 | 第107-109页 |
·龙眼体胚发生不同阶段材料总 RNA 提取及 cDNA 合成 | 第107-108页 |
·引物设计及实时荧光定量 PCR | 第108-109页 |
·标准曲线的制定 | 第109页 |
2 结果与分析 | 第109-113页 |
·龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因和谷胱甘肽合成酶基因的差异表达分析 | 第109-111页 |
·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因的差异表达分析 | 第111页 |
·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因的差异表达分析 | 第111-112页 |
·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽谷胱甘肽 S 转移酶基因的差异表达分析 | 第112-113页 |
3 讨论 | 第113-117页 |
·龙眼体胚发生过程中γ-ECS 和 GSHS 基因的转录水平变化可能与还原型谷胱甘肽含量的变化相关 | 第113-114页 |
·龙眼体胚发生过程中 GR 基因可能参与还原型谷胱甘肽合成的补救途径 | 第114页 |
·GPX 基因在龙眼体胚发生过程中表达量的变化可能与 GPX 对活性氧的清除作用相关 | 第114-115页 |
·GST 基因在龙眼体胚发生过程中表达量的变化可能与 GST 的解毒作用相关 | 第115页 |
·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的相互作用分析 | 第115-117页 |
第六章 小结 | 第117-121页 |
1 龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析 | 第117页 |
2 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的克隆 | 第117-118页 |
3 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的生物信息学分析 | 第118-119页 |
4 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的定量表达 | 第119-121页 |
参考文献 | 第121-132页 |
附录 | 第132-157页 |
附录1 图版及图版说明 | 第132-134页 |
附录2 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因等 qPCR 分析相关曲线图版 | 第134-137页 |
附录3 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢若干关键酶基因序列登录 GenBank(9 条) | 第137-157页 |
攻读硕士期间发表论文情况与参加学术会议情况 | 第157-158页 |
致谢 | 第158页 |