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龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的克隆及其表达分析

缩写词第1-12页
摘要第12-15页
Abstract第15-19页
第一章 引言第19-31页
 1 植物体胚发生研究进展第20-23页
   ·植物体胚的发育途径第20-21页
   ·植物生长调节剂对体胚发生的影响第21页
   ·植物体胚发生过程中不同基因的表达分析第21-23页
     ·细胞周期相关基因第21-22页
     ·激素应答相关基因第22页
     ·胁迫相关基因第22页
     ·信号转导相关基因第22-23页
 2 植物谷胱甘肽代谢研究进展第23-27页
   ·植物谷胱甘肽代谢的相关酶类第23-24页
   ·植物谷胱甘肽对体胚发生的氧化还原调控第24-27页
     ·谷胱甘肽氧化还原状态的改变对生长和发育的调控第24-25页
     ·谷胱甘肽在胚胎形成和植株再生过程中的作用第25-26页
     ·谷胱甘肽处理的胚胎结构和生理变化第26-27页
 3 转录组技术的应用第27-28页
 4 龙眼生物技术研究进展第28-29页
 5 本研究的意义及主要研究内容第29-31页
   ·本研究的意义第29页
   ·本研究的主要内容第29-31页
第二章 龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析第31-36页
 1 材料与方法第31页
   ·材料与数据库第31页
   ·序列搜索与登录第31页
 2 结果与分析第31-34页
   ·龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析第31-34页
     ·γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶相关基因第33页
     ·谷胱甘肽合成酶相关基因第33页
     ·谷胱甘肽还原酶相关基因第33页
     ·谷胱甘肽过氧化物酶相关基因第33-34页
     ·谷胱甘肽转移酶相关基因第34页
 3 讨论第34-36页
   ·龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽的合成与降解第34-35页
   ·转录组分析在龙眼胚性愈伤组织研究中的应用第35-36页
第三章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的克隆第36-74页
 第一节 龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的克隆第36-45页
  1 材料与方法第36-39页
   ·材料第36-37页
   ·方法第37-39页
     ·龙眼胚性愈伤组织 DNA 与总 RNA 的提取及质量检测第37页
     ·龙眼愈伤胚性组织 cDNA 的合成第37页
     ·龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因的引物设计及 PCR 扩增第37-38页
     ·目的片段的回收、克隆和测序第38页
     ·序列拼接及分析第38-39页
  2 结果与分析第39-43页
   ·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因转录组序列的验证结果第39-40页
   ·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果第40页
   ·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果第40-41页
   ·龙眼胚性愈伤组织γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证第41-43页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因 cDNA 全长序列分析第43页
  3 讨论第43-45页
   ·γ-ECS 在龙眼胚性愈伤组织中可能是单拷贝基因第43页
   ·龙眼胚性愈伤组织γ-ECS 基因克隆的意义第43-45页
 第二节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的克隆第45-53页
  1 材料与方法第45页
   ·材料第45页
   ·方法第45页
  2 结果与分析第45-52页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因转录组序列的验证结果第45-46页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果第46-47页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果第47-48页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证第48-49页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因基因组 DNA 序列的获得第49-50页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽合成酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析第50-52页
  3 讨论第52-53页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GSHS 基因克隆的难点第52页
   ·TA 克隆长片段 PCR 产物的策略第52-53页
 第三节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的克隆第53-61页
  1 材料与方法第53-54页
   ·材料第54页
   ·方法第54页
  2 结果与分析第54-60页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因转录组序列的验证结果第54-55页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增结果第55-56页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 的 5'RACE 扩增结果第56-57页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 全长的序列拼接及 ORF 验证第57-58页
   ·谷胱甘肽还原酶基因基因组 DNA 序列的获得第58页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽还原酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析第58-60页
  3 讨论第60-61页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GR 基因克隆的意义第60-61页
   ·TA 克隆长片段 PCR 产物的策略第61页
 第四节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的克隆第61-67页
  1 材料与方法第61-62页
   ·材料第62页
   ·方法第62页
  2 结果与分析第62-66页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因转录组序列的验证结果第62-63页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的 3'RACE 扩增第63页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 的 5' RACE 扩增第63-64页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 全长的序列拼接第64-65页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因基因组 DNA 序列的获得第65页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽过氧化物酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析第65-66页
  3 讨论第66-67页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GPX 基因克隆的意义第66-67页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GPX 基因组外显子和内含子影响基因的时空表达第67页
 第五节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的克隆第67-74页
  1 材料与方法第67-68页
   ·材料第67-68页
   ·方法第68页
  2 结果与分析第68-72页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽 S 转移酶基因转录组序列的验证结果第68-69页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的 3' RACE 扩增第69页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 的 5' RACE 扩增第69-70页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 全长的序列拼接第70-71页
   ·龙眼愈伤胚性组织谷胱甘肽 S 转移酶基因基因组 DNA 序列的获得第71页
   ·龙眼胚性愈伤组织谷胱甘肽 S 转移酶基因 cDNA 全长及基因组 DNA 序列分析第71-72页
  3 讨论第72-74页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GST 基因克隆的难点第72-73页
   ·龙眼胚性愈伤组织 GST 基因克隆的意义第73-74页
第四章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的生物信息学分析第74-107页
 第一节 龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因的生物信息学分析第74-79页
  1 材料与方法第74-75页
   ·材料第74页
   ·方法第74-75页
  2 结果与分析第75-79页
   ·蛋白质的理化性质预测与分析第75页
   ·蛋白质跨膜结构预测第75页
   ·蛋白质信号肽及亚细胞定位预测第75-76页
   ·蛋白质磷酸化结构的预测第76页
   ·蛋白质功能位点的预测第76-77页
   ·蛋白质保守结构域分析第77页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测第77页
   ·蛋白质二级结构及三级结构预测第77-78页
   ·γ-ECS 系统进化树构建第78-79页
  3 讨论第79页
 第二节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽合成酶基因的生物信息学分析第79-86页
  1 材料与方法第79-80页
   ·材料第79页
   ·方法第79-80页
  2 结果与分析第80-85页
   ·蛋白的基本理化性质比较分析第80页
   ·蛋白质跨膜结构预测第80页
   ·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测第80-82页
   ·蛋白质磷酸化位点预测与分析第82页
   ·蛋白质功能基序分析第82-83页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测第83页
   ·保守结构域及进化分析第83-84页
   ·蛋白质二级结构及三级结构预测第84-85页
   ·GSHS 系统进化树构建第85页
  3 讨论第85-86页
   ·利用生物信息学推测 GSHS 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理第85-86页
   ·GSHS 蛋白保守结构域对谷胱甘肽合成酶功能的影响第86页
 第三节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因的生物信息学分析第86-93页
  1 材料与方法第86页
   ·材料第86页
   ·方法第86页
  2 结果与分析第86-92页
   ·龙眼体胚谷胱甘肽还原酶蛋白的基本理化性质比较分析第87页
   ·蛋白质跨膜结构预测第87页
   ·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测第87-88页
   ·蛋白质磷酸化位点预测与分析第88-89页
   ·蛋白质功能基序分析第89-90页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测第90页
   ·保守结构域及进化分析第90-91页
   ·蛋白质二级结构及三级结构预测第91页
   ·GR 系统进化树构建第91-92页
  3 讨论第92-93页
 第四节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因的生物信息学分析第93-100页
  1 材料与方法第93页
   ·材料第93页
   ·方法第93页
  2 结果与分析第93-99页
   ·龙眼体胚谷胱甘肽过氧化物酶蛋白的基本理化性质比较分析第93-94页
   ·蛋白质跨膜结构预测第94页
   ·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测第94-95页
   ·蛋白质磷酸化位点预测与分析第95-96页
   ·蛋白质功能基序分析第96页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测第96-97页
   ·保守结构域及进化分析第97页
   ·蛋白质二级结构及三级结构预测第97-98页
   ·GPX 系统进化树构建第98-99页
  3 讨论第99-100页
   ·利用生物信息学推测 GPX 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理第99页
   ·GPX 蛋白保守结构域对谷胱甘肽过氧化物酶功能的影响第99-100页
 第五节 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽 S 转移酶基因的生物信息学分析第100-107页
  1 材料与方法第100页
   ·材料第100页
   ·方法第100页
  2 结果与分析第100-105页
   ·龙眼体胚谷胱甘肽 S 转移酶蛋白的基本理化性质比较分析第100页
   ·蛋白质跨膜结构预测第100-101页
   ·蛋白质信号肽与亚细胞定位预测第101-102页
   ·蛋白质磷酸化位点预测与分析第102-103页
   ·蛋白质功能基序分析第103页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测第103页
   ·保守结构域及进化分析第103-104页
   ·蛋白质二级结构及三级结构预测第104-105页
   ·GST 系统进化树构建第105页
  3 讨论第105-107页
   ·利用生物信息学推测 GST 在龙眼体胚谷胱甘肽代谢过程中的作用机理第105-106页
   ·GST 蛋白保守结构域对谷胱甘肽过氧化物酶功能的影响第106-107页
第五章 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的定量表达第107-117页
 1 材料与方法第107-109页
   ·材料第107页
   ·主要试剂和仪器第107页
   ·方法第107-109页
     ·龙眼体胚发生不同阶段材料总 RNA 提取及 cDNA 合成第107-108页
     ·引物设计及实时荧光定量 PCR第108-109页
     ·标准曲线的制定第109页
 2 结果与分析第109-113页
   ·龙眼体胚发生过程中γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶基因和谷胱甘肽合成酶基因的差异表达分析第109-111页
   ·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽还原酶基因的差异表达分析第111页
   ·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽过氧化物酶基因的差异表达分析第111-112页
   ·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽谷胱甘肽 S 转移酶基因的差异表达分析第112-113页
 3 讨论第113-117页
   ·龙眼体胚发生过程中γ-ECS 和 GSHS 基因的转录水平变化可能与还原型谷胱甘肽含量的变化相关第113-114页
   ·龙眼体胚发生过程中 GR 基因可能参与还原型谷胱甘肽合成的补救途径第114页
   ·GPX 基因在龙眼体胚发生过程中表达量的变化可能与 GPX 对活性氧的清除作用相关第114-115页
   ·GST 基因在龙眼体胚发生过程中表达量的变化可能与 GST 的解毒作用相关第115页
   ·龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的相互作用分析第115-117页
第六章 小结第117-121页
 1 龙眼胚性愈伤组织中谷胱甘肽代谢相关基因的全转录组学分析第117页
 2 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的克隆第117-118页
 3 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的生物信息学分析第118-119页
 4 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因的定量表达第119-121页
参考文献第121-132页
附录第132-157页
 附录1 图版及图版说明第132-134页
 附录2 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢相关基因等 qPCR 分析相关曲线图版第134-137页
 附录3 龙眼体胚发生过程中谷胱甘肽代谢若干关键酶基因序列登录 GenBank(9 条)第137-157页
攻读硕士期间发表论文情况与参加学术会议情况第157-158页
致谢第158页

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