| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-13页 |
| ·课题背景及研究意义 | 第10页 |
| ·国内外研究的现状 | 第10-11页 |
| ·本文的主要工作 | 第11页 |
| ·本文的结构安排 | 第11-13页 |
| 第二章 蛋白质结构预测问题及其模型 | 第13-20页 |
| ·蛋白质层次结构 | 第13-14页 |
| ·蛋白质结构预测问题 | 第14-15页 |
| ·蛋白质结构预测的方法概述 | 第15-16页 |
| ·实验方法 | 第15-16页 |
| ·理论方法 | 第16页 |
| ·二维 HP 格点模型及其性质 | 第16-20页 |
| ·HP 格点模型简介 | 第16-17页 |
| ·二维 HP 格点模型的整数规划模型 | 第17-18页 |
| ·二维 HP 格点模型的性质 | 第18-20页 |
| 第三章 粒子群优化算法 | 第20-24页 |
| ·粒子群算法的基本理论 | 第20-21页 |
| ·粒子群算法的基本原理 | 第20页 |
| ·基本粒子群优化算法 | 第20-21页 |
| ·粒子群算法的性能分析 | 第21-22页 |
| ·粒子群优化算法的研究领域 | 第22页 |
| ·粒子群算法的特点 | 第22-24页 |
| 第四章 改进的粒子群算法求解二维紧致 HP 格点模型 | 第24-33页 |
| ·求解紧致情况下的 PSO 算法的改进方法 | 第24-25页 |
| ·解的表示 | 第24页 |
| ·速度表示 | 第24-25页 |
| ·改进的 PSO 算法描述 | 第25-26页 |
| ·算例分析 | 第26-33页 |
| ·方格网 | 第26-28页 |
| ·菱形网 | 第28-30页 |
| ·方格网和菱形网的比较 | 第30页 |
| ·三角网 | 第30-32页 |
| ·菱形网和三角网的比较 | 第32-33页 |
| 第五章 改进的粒子群算法求解二维非紧致 HP 格点模型 | 第33-43页 |
| ·求解非紧致情况下的 PSO 算法的改进方法 | 第33-34页 |
| ·解的表示 | 第33页 |
| ·速度表示 | 第33-34页 |
| ·改进的 PSO 算法描述 | 第34-36页 |
| ·算例分析 | 第36-43页 |
| ·方格网 | 第36-40页 |
| ·非紧致方格网 | 第36-38页 |
| ·紧致方格网 | 第38-39页 |
| ·结果比较 | 第39-40页 |
| ·非紧致菱形网 | 第40-41页 |
| ·非紧致三角网 | 第41-43页 |
| 第六章 总结与展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第49页 |