| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-19页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·本文主要研究工作 | 第10-11页 |
| ·预备知识 | 第11-19页 |
| ·生物数据信息的收集和分析 | 第11-13页 |
| ·构建系统发生树 | 第13-15页 |
| ·马尔可夫过程和极大似然估计 | 第15-19页 |
| 第二章 基于残基相似性的密码子置换模型及应用 | 第19-27页 |
| ·引言 | 第19-20页 |
| ·模型和方法 | 第20-23页 |
| ·密码子置换模型 | 第20-22页 |
| ·似然函数 | 第22-23页 |
| ·模型比较 | 第23页 |
| ·模型的数据集应用 | 第23-24页 |
| ·结果 | 第24-25页 |
| ·结论 | 第25-27页 |
| 第三章 区分不同位置发生置换的密码子模型 | 第27-34页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·模型和方法 | 第27-31页 |
| ·密码子置换模型 | 第27-29页 |
| ·不同统计方法下密码子频率的比较 | 第29-30页 |
| ·极大似然估计 | 第30-31页 |
| ·检验方法 | 第31页 |
| ·实践结果 | 第31-33页 |
| ·结论 | 第33-34页 |
| 第四章 基因 GC 转换偏向对正选择检测的影响分析 | 第34-41页 |
| ·引言 | 第34页 |
| ·基因转换偏向的研究方法和结果 | 第34-38页 |
| ·基因重组水平上基因 GC 转换偏向的研究方法 | 第34-36页 |
| ·祖先序列重建方法 | 第36页 |
| ·数据集的实践结果 | 第36-38页 |
| ·密码子水平上基因 GC 转换偏向的研究方法 | 第38-39页 |
| ·引入 GC 转换偏向因子的置换模型 | 第38-39页 |
| ·似然方法分析 | 第39页 |
| ·总结 | 第39-41页 |
| 第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
| ·本文总结 | 第41页 |
| ·工作展望 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第48-49页 |
| 附录 | 第49页 |