| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-17页 |
| 符号说明 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-69页 |
| 一、SNP 分型检测方法研究 | 第19-44页 |
| 1. SNP 分型检测方法简介 | 第19-20页 |
| 2. SNP 分型检测方法 | 第20-39页 |
| ·杂交 | 第20-24页 |
| ·引物延伸法 | 第24-27页 |
| ·等位特异性连接反应 | 第27-32页 |
| ·侵入切割方法 | 第32-35页 |
| ·酶和化学切割 | 第35-39页 |
| 3. SNP 检测方式 | 第39-44页 |
| ·基因芯片法 | 第39-40页 |
| ·毛细管电泳 | 第40-41页 |
| ·质谱法 | 第41-42页 |
| ·荧光检测方法 | 第42-43页 |
| ·其它检测方式 | 第43-44页 |
| 4. 小结 | 第44页 |
| 二、RNase H 的研究进展 | 第44-52页 |
| 1. RNase H 的分类 | 第44-45页 |
| 2. RNase H 结构与功能的研究进展 | 第45-49页 |
| ·复制过程中DNA 滞后链中RNA 引物的切除 | 第45-46页 |
| ·DNA 错配修复中的作用 | 第46-48页 |
| ·RNase H 的转录功能 | 第48页 |
| ·逆转录酶的 RNase H 结构域的功能 | 第48-49页 |
| 3. RNase H 的酶切作用 | 第49页 |
| 4. RNase H 的应用 | 第49-50页 |
| ·一种独特的 DNA 扩增方法 | 第49-50页 |
| ·设计反义的寡聚脱氧核糖核酸药物 | 第50页 |
| ·研究病毒的致病机理及抗病毒的药物 | 第50页 |
| 5. 小结 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-69页 |
| 第二章 衣原体 RNase H 蛋白的酶切特性分析 | 第69-99页 |
| 1. 引言 | 第70-71页 |
| 2. 材料和方法 | 第71-78页 |
| ·材料 | 第71-72页 |
| ·表达载体的构建 | 第72-73页 |
| ·CpRNase Hs 蛋白的制备 | 第73-75页 |
| ·CpRNase Hs 底物的制备 | 第75-77页 |
| ·CpRNase Hs 活性鉴定 | 第77-78页 |
| ·CpRNase Hs 生物信息学分析 | 第78页 |
| 3. 结果与分析 | 第78-89页 |
| ·CpRNase Hs 重组蛋白的表达和纯化 | 第78-79页 |
| ·同源性比对 | 第79-81页 |
| ·CpRNase Hs 对 RNA/DNA 底物的酶切 | 第81-84页 |
| ·CpRNase Hs 切割 DNA-rN1-DNA/DNA 嵌合底物的酶切特异性 | 第84-86页 |
| ·CpRNase HII 酶切错配DNA-rN1-DNA/DNA 嵌合底物 | 第86-89页 |
| 4. 讨论 | 第89-93页 |
| ·CpRNases Hs 蛋白的功能鉴定 | 第89-90页 |
| ·CpRNase HII 酶切 DNA-RNA-DNA/DNA 嵌合底物的特异性 | 第90-91页 |
| ·DNA-rN1-DNA | 第91页 |
| ·错配碱基类型对CpRNase HII 酶促反应的影响 | 第91-92页 |
| ·肺炎衣原体的 RNase H 在进化上的位置 | 第92页 |
| ·肺炎衣原体 RNase H 对其他RNase H 研究的促进作用 | 第92-93页 |
| ·肺炎衣原体 RNase H 的研究对疾病治疗的意义 | 第93页 |
| ·利用 CpRNaseHII 的酶切特性发展新型的 SNP 分型检测技术 | 第93页 |
| 5. 小结 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-99页 |
| 第三章 基于衣原体 RNase HII 酶促反应的 SNP 分型技术研究 | 第99-125页 |
| 1. 引言 | 第100-101页 |
| 2. 材料和方法 | 第101-107页 |
| ·材料 | 第101页 |
| ·制备cMB/oligo 底物 | 第101-102页 |
| ·CpRNase HII 酶切法分型HLA 基因的底物制备 | 第102-106页 |
| ·CpRNaseHII 的酶促反应 | 第106-107页 |
| 3. 结果 | 第107-115页 |
| ·分子信标与目的片段之间碱基配对数目的选择 | 第107页 |
| ·CpRNaseHII 酶促反应检测系统的特异性 | 第107-108页 |
| ·CpRNase HII 酶切配对底物的效率高于错配底物 | 第108-109页 |
| ·建立以CpRNase HII 酶促反应为基础的SNP 分型方法（CpRNase HII 酶切法） | 第109-111页 |
| ·CpRNase HII 酶切法进行SNP 分型的应用 | 第111-112页 |
| ·目标单链DNA 片段的长度对CpRNase HII 酶切法分型SNP 的影响 | 第112-113页 |
| ·过量cMBs 对CpRNase HII 酶切法分型SNP 的影响 | 第113页 |
| ·利用CpRNase HII 酶切法分型 HLA 基因的 SNP | 第113-115页 |
| 4. 讨论 | 第115-120页 |
| ·最适配对碱基数目的选择 | 第115-116页 |
| ·利用λ-exonuclease 消化作用制备单链DNA | 第116页 |
| ·CpRNase HII 酶切法分型SNP 对match | 第116-117页 |
| ·CpRNase HII 酶切法的特点 | 第117-120页 |
| 5. 小结 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-125页 |
| 附录一 常规试验操作 | 第125-127页 |
| 附录二 常见培养基和试剂配方 | 第127-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第130页 |
