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黄河三角洲表层沉积物古菌分布特征

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
1 引言第7-21页
   ·海洋沉积物微生物的研究进展第7-14页
     ·海洋环境特征第7页
     ·海洋微生物的多样性及意义第7-8页
     ·海洋中的古菌第8-14页
       ·古菌的发现第9-10页
       ·海洋古菌的多样性第10-12页
       ·海洋古菌的研究第12-14页
         ·古菌的的研究意义第12-13页
         ·古菌的研究现状第13-14页
     ·古菌研究的方法第14-21页
     ·原位研究第14页
     ·古菌富集第14-15页
     ·分离培养第15页
     ·同位素分析与甲烷的厌氧氧化作用第15-16页
     ·古菌含量的测定第16页
       ·荧光显微镜直接计数法第16页
       ·流式细胞术第16页
       ·其他分子技术第16页
     ·脂类标志物研究第16-17页
     ·分子生物学方法第17-21页
       ·限制性片段多态性分析第17-18页
         ·限制性片段长度多态性分析第17页
         ·末端限制性片段长度多态性分析第17-18页
       ·扩增片段长度多态性第18页
       ·温度梯度凝胶电泳(TGGE)和变性梯度凝胶电泳(DGGE)第18页
       ·聚合酶链反应-单链构象多态性(SSCP第18-19页
       ·实时荧光定量PCR第19页
       ·荧光原位杂交(FISH)第19-20页
       ·随机扩增多态性DN第20页
       ·基因文库分析法第20-21页
       ·PCR技术及引物造成的偏差第21页
   ·本文研究目的及相关意义第21页
2 实验材料及方法第21-35页
   ·材料及仪器设备第21-25页
     ·实验样品的采集第21-22页
     ·实验主要应用仪器第22-23页
     ·实验培养基与试剂第23-25页
   ·实验方法第25-35页
     ·16S rDNA基因克隆文库建立第25-30页
       ·基因组内DNA 的提取第25页
       ·16S rDNA 基因片段的PCR特异性扩增第25-26页
       ·PCR产物的乙醇沉淀第26-27页
       ·PCR产物的纯化第27-28页
       ·PCR 产物于纯化后的连接第28页
       ·重组载体转化第28-30页
     ·DNA 基因文库建立及序列测第30-33页
       ·挑菌及质粒PCR第30-31页
       ·扩增基因的限制性酶切分析第31-32页
       ·扩增产物测方向第32-33页
       ·基因序列的测定第33页
     ·基因文库序列的统计学及系统进化分析第33-35页
       ·多样性指数分析第33-34页
       ·DNA 基因序列的系统发育分析第34页
       ·16S rDNA 提交核酸序列第34-35页
3 结果与分析第35-42页
   ·结果第35-39页
     ·古菌16S rDNA 文库分析第35-37页
     ·古菌16S rDNA 序列分析第37-39页
     ·讨论第39-40页
     ·小结第40-42页
致谢第42-43页
参考文献第43-50页
作者简介第50页

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